dati sull'andamento temporale in formato micropiastraqualcuno può aiutarmi con il generatore di grafici per costruire i dati del corso del tempo che vengono registrati utilizzando un lettore di micropiastre?
Ho letto il post sulla mappa della micropiastra.Mentre quello è per i dati bidimensionali. Con i dati temporali, come si possono definire i dati del ruolo della mappa? Grazie
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraL'ho fatto usando la funzione wrap!Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraGrazie mille per la dimostrazione! Ci sono quasi. La colonna dello stack è davvero una chiave.
Tramite il filtro dei dati locali, posso scegliere determinate colonne da mostrare mentre non riesco ancora a visualizzarle singolarmente.
Come nuovo utente, apprezzo molto l'aiuto da parte tua e di Mark.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraI dati sono stati impilati: le prime 'n' righe corrispondono ai dati dell'andamento temporale per il primo recipiente del bioreattore, le seguenti 'n' corrispondono al successivo recipiente del bioreattore ecc. Var è sull'asse y, età o timestamp sulla x -axis, bireactor è la variabile di wrapping e/o la variabile del filtro dati.
Guardando la tua tabella di dati, per ottenere questa forma dovresti prima trasporre i dati e poi impilare le colonne.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraSembra che la tabella dei dati sia stata trasposta. Vuoi avere tre colonne: Posizione, Tempo e Risposta. Quindi potresti eliminare la prima riga dall'esempio e rinominare le colonne come Posizione , 562 , 1162 , e così via. Ovvero, il nome della penultima colonna è il valore dell'ora. Quindi impila tutte le colonne tranne il primo ( Posizione ). Assegna un nome alla nuova colonna di dati Risposta e la nuova colonna dell'etichetta Tempo . Modificare il tipo di dati in Numerico e il tipo di modellazione in Continuo per Tempo . Queste modifiche dovrebbero darti il layout corretto per questo esercizio.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraCiao Dave,
Ti dispiace mostrarmi la tua tabella dati? Quando usi il filtro dati locale quale colonna usi per fare il filtro?
Come raggruppi le diverse colonne e le definisci come bioreatori? Ho inserito il nome del reattore nella colonna info. Quindi ogni colonna è i dati per questo reattore. Per ogni punto temporale, i dati sono una riga per un insieme di reattori. In sintesi, ho una colonna delle serie temporali e tutte le colonne dei reattori. Non ho nessuna colonna da selezionare per il filtro. Sono bloccato a questo punto. Grazie
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraGrazie mille per le vostre pazienti risposte. Capisco il modo di utilizzare la creazione di grafici per farlo teoricamente con la tua descrizione.
Penso di essere ancora bloccato su un punto sul modo in cui inserisci i dati nella tabella. Poiché il mio formato di dati ha una dimensione di serie temporali di hh:mm:ss e una dimensione di posizione del pozzo (A1, B2 ecc.). Se inserisci l'ID in una colonna, i dati temporali saranno in riga. Mentre le mie informazioni sull'ora esatta saranno come una riga separata, il che significa sotto una colonna, i dati sono confusi. come lo gestisci? Grazie
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraGrazie Davide. Questa potrebbe essere una soluzione.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraCome ho detto prima, puoi utilizzare un filtro dati locale con Graph Builder per animare il display con la tua variabile tempo. Rilascia la colonna dei dati con le posizioni dei pozzi nella zona della mappa. Rilascia la colonna di dati con le risposte nel canvas. Questo è molto simile al "modello". Ora fai clic sul triangolo rosso e seleziona Filtro dati locale. Seleziona la colonna dei dati con i tuoi orari e fai clic su Aggiungi. Modificare l'intervallo per renderlo abbastanza piccolo da essere, quindi trascinare l'intervallo o fare clic sul triangolo rosso accanto a Filtro dati locali e selezionare Anima.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraNon sono sicuro che tu debba usare la mappa. Vorrei semplicemente tracciare le mie variabili rispetto al tempo, racchiuse o filtrate per nave
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraPosso inviarti un campione di dati se vuoi.
Grazie,
Hui
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraSÌ. Ho usato questo modello per la comprensione. La mia applicazione è che se si dispone di una serie di dati per un pozzo, si tratta di dati sul corso del tempo.
Come hai potuto disegnarlo?
Hui
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraSe si desidera utilizzare le forme delle micropiastre (pozzetti) in Graph Builder, NON trascinare la colonna e la riga sulla X e sulla Y. Invece, trascina solo la colonna con la posizione nell'area Mappa. Dovresti quindi vedere le forme (8 righe per 12 colonne). Quindi trascina la colonna con la risposta al centro delle forme.
Si prega di consultare questa voce nella sezione Scambio di file della community di JMP: Micro-Titre-Plate-Forme
Spiegherà come usarli e include un esempio in modo da poter verificare che funzioni come previsto. Puoi anche usare l'esempio per confermare che ti darà il risultato che desideri.
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraGrazie per la tua risposta. La mia particolare analisi dei dati è per un test di cinetica enzimatica.
Ho i dati del corso temporale in ciascun pozzetto per 96 pozzetti. Il layout del lettore di piastre di solito è che nella direzione della colonna è il tempo diverso, nella riga ci saranno diversi pozzetti.
quindi i dati di lettura reale sono nella tabella. Posso disegnare la lettura come Y e il tempo come X nel generatore di grafici. Come hai potuto disegnare tutti i 96 set di dati come curva Y rispetto a X nel layout della piastra a 96 pozzetti?
Migliore,
Hui
Ri: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraLa risposta dipende da cosa vuoi fare con questi dati. Ad esempio, se si desidera esaminare la variazione della risposta nel tempo osservando il display della micropiastra, è possibile utilizzare l'animazione tramite un filtro dati, impostato per filtrare sulla variabile tempo, e aggiungere semplicemente un nuovo colonna per il tempo. Trascina la colonna con la posizione del pozzo nell'area Mappa per ottenere la forma. Trascina la colonna con la risposta nell'area di disegno per ottenere la risposta media. Ora fai clic sul triangolo rosso accanto a Generatore di grafici e seleziona script > Ripeti > Filtro dati locale. Selezionare la colonna con l'ora per il filtro.
Questo esempio aiuta o stai cercando di fare qualcosa di molto diverso?
Re: dati sull'andamento temporale in formato micropiastraOttima domanda, visualizzare i dati dell'andamento temporale in un formato a 96 pozzetti può decisamente diventare complicato, soprattutto quando si cerca di preservare sia la cinetica sia la disposizione spaziale della piastra.
Un approccio che ha funzionato per me è stato quello di rimodellare prima i dati grezzi in un formato lungo in cui ogni riga include: Tempo, ID del pozzetto (ad esempio, A1, A2...) e la misurazione corrispondente. Quindi, in Graph Builder, è possibile assegnare il Tempo all'asse X e la Risposta all'asse Y. Per preservare visivamente il layout della piastra, utilizzare l'ID del pozzetto per mappare i dati spazialmente. Trascinare l'ID del pozzetto nella zona Mappa, che dovrebbe riflettere la posizione fisica di ciascun pozzetto sulla piastra.
Per visualizzare la cinetica completa di tutti i 96 pozzetti contemporaneamente, è anche possibile utilizzare grafici multipli (facet plot). Ogni pannello mostrerà l'andamento temporale di un singolo pozzetto, consentendo di individuare valori anomali, tendenze o pattern lungo tutta la piastra. Se il software lo consente, la suddivisione in righe e colonne (in base al layout della piastra) renderà l'interpretazione ancora più semplice.
Inoltre, per una mappatura delle piastre e una pianificazione più efficace della visualizzazione, potresti trovare utile questo modello di piastra a 96 pozzetti : è un comodo riferimento per allineare la struttura dei dati con il layout fisico della piastra per microtitolazione.
Spero che questo ti sia utile! Fammi sapere se hai bisogno di aiuto per rimodellare il tuo set di dati o impostare i multipli piccoli.
Oggetto: Dati relativi all'andamento temporale in formato piastra per microtitolazioneUna configurazione che di solito funziona bene consiste nel riorganizzare i dati in un formato lungo (impilato) anziché cercare di mantenere una colonna per ogni pozzetto o bioreattore. In questa struttura, ogni riga rappresenta una singola misurazione con colonne come Tempo, ID Pozzetto/Bioreattore, Risposta e, facoltativamente, Trattamento o ID Piastra. È quindi possibile assegnare il Tempo all'asse X, la Risposta all'asse Y e utilizzare Pozzetto/Bioreattore come variabile di raggruppamento, colore o avvolgimento.
Oggetto: Dati relativi all'andamento temporale in formato piastra per microtitolazioneCiao @choufree
Volevo solo aggiungere qualcosa a questa conversazione: un altro modo utile per visualizzare le piastre è combinare la lettura standard della piastra (ovvero la densità ottica massima per pozzetto) e la serie temporale insieme alle etichette al passaggio del mouse (vedi sotto).
Per fare ciò, create i grafici delle vostre serie temporali in Graph Builder, quindi cliccate sul pulsante rosso > Trasforma in tabella dati. In questo modo i grafici vengono trasformati in un'immagine per ogni riga; riportatela nella tabella originale (ad esempio tramite Join o Update) e potrete quindi utilizzare la colonna delle immagini come etichetta.
Allego una tabella di dati per consentirvi di visualizzarla (è necessario che i file shape della mappa si trovino nella cartella delle mappe).
Grazie,
Ben
