Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Bonjour,
J'essaie de construire un modèle linéaire où X1 = Temps et X2 = Traitement. Lorsque j'utilise l'outil Ajuster le modèle, je constate une différence entre le tableau ANOVA et le tableau des effets (capture d'écran ci-dessous). La somme des colonnes des carrés doit correspondre au même total (dans ce cas, 6 277,9477), n'est-ce pas ? Le SS sous Effects Tests ne correspond pas à cette valeur. Pourquoi serait-ce? Ai-je mal compris les calculs ici? Ou est-ce un bogue dans JMP ?
Merci beaucoup!

Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Non, je n'ajouterais pas les sommes des carrés de type III pour le dénominateur. Ce dénominateur n'a pas vraiment de sens.
La façon dont vous calculez votre "% de variance expliquée" dépendra des informations que vous essayez de transmettre. En règle générale, les gens utiliseront le type I SS divisé par le modèle SS puisque le type I SS s'additionnera au modèle SS. Vos pourcentages s'ajouteront alors à 100 %. Il s'agit d'un " % de variance expliquée", mais ces résultats dépendront de l'ordre dans lequel vous placez les termes de votre modèle.
Vous POUVEZ utiliser le type III SS divisé par le modèle SS. Cela se traduira par un pourcentage total différent de 100% (il devrait être inférieur à 100%). Dans ce cas, votre résultat est vraiment le "% de variance supplémentaire expliqué après avoir pris en compte tous les autres termes du modèle".
En raison de ces problèmes, je ne suis pas un grand fan de la détermination du pourcentage de variance expliqué pour chaque terme. Vous pouvez classer par ordre d'importance les termes d'autres manières proposées par JMP, telles que le tableau Résumé des effets, qui indique également l'ampleur de l'impact du terme.
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Merci pour la précision Dan. Puis-je poser une question de suivi : si je veux connaître le % de variance expliqué par chaque terme, A, B et A*B, puis-je utiliser la "somme des carrés" de chaque terme comme numérateur et (résumer le " Somme du carré" des trois) comme dénominateur ? Je veux dire au lieu d'utiliser "Modèle SS".
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Merci pour ce commentaire, Dan - grandement apprécié.
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Encore une chose. Si vous VOULEZ la somme des carrés de type I, à partir du triangle rouge près du nom de la réponse, choisissez Estimations > Tests séquentiels.
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Ce n'est pas ce que veut dire orthogonal. Orthogonal signifie que le SS resterait le même lors de la suppression de termes (quel que soit le type de SS utilisé). Orthogonal n'a rien à voir avec l'ordre dans lequel les termes sont entrés dans le modèle.
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Merci Dan. Si je peux demander un suivi...
Cette expérience est une factorielle complète avec 7 points dans le temps, 4 traitements et 2 répétitions. Ma compréhension est que, dans une conception équilibrée (ce qui est le cas), les facteurs sont orthogonaux, donc les sommes des carrés de type I, de type II et de type III doivent toutes être identiques. Alors pourquoi seraient-ils différents ?
Re : Pourquoi les tableaux ANOVA donnent-ils des résultats différents ?Il ne s'agit pas d'un bogue JMP. Les sommes des carrés s'additionneront si vous utilisez ce qu'on appelle la somme des carrés de type I (Type I SS). Le problème avec le type I SS est qu'il dépend de l'ordre. Cela signifie que le modèle A, B et A*B donnerait des résultats différents du modèle B, A, B*A. Par conséquent, les SS de type I ne sont généralement pas utilisés, sauf dans les calculs "à la main".
JMP utilise la somme des carrés de type III (SS de type III). Cela supprime la dépendance à l'ordre en calculant uniquement le SS pour un terme APRÈS que tous les autres termes aient été placés dans le modèle. Cela fournit des estimations stables, mais elles ne s'ajoutent pas au modèle SS.