<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />JMP genomics가 임의, 수정 및 공분산 효과 (Proc Grimmix)가있는 서수 특성에 따라 40000 개의 마커 대신 20000 개의 마커 만 계산하는 이유는 무엇입니까?
친애하는 더그
빠른 응답에 감사드립니다. 내 설정 파일이 괜찮다고 생각합니다. 300 샘플의 48909 마커 대신 30000 마커 만 계산하는 SAS 로그 파일을 보내드립니다. 내 컴퓨터에 충분한 메모리가 없다는 것이 문제라고 생각합니다.
내 컴퓨터의 JMP 게놈과 다른 대형 서버의 SAS를 사용할 수 있습니까?
예를 들어 로그 파일을 잘라낸 예입니다.
참고 : 데이터 세트 WORK.TEMP1에서 읽은 48909 개의 관측치가있었습니다.
참고 : WORK.TEMP 데이터 세트에는 48909 개의 관측 값과 3 개의 변수가 있습니다.
참고 : 사용 된 PSMOOTH 절차 (총 처리 시간) :
실시간 0.03 초
CPU 시간 0.04 초
경고 : 매크로 함수 % SUBSTR에 대한 인수 2가 범위를 벗어났습니다.
경고 : 매크로 함수 % SUBSTR에 대한 인수 3이 범위를 벗어났습니다.
참고 : 데이터 세트 WORK.TEMP1에서 읽은 48909 개의 관측치가있었습니다.
참고 : 데이터 세트 WORK.TEMP에서 읽은 48909 개의 관측치가있었습니다.
참고 : OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM 데이터 세트에는 48909 개의 관측 값과 29 개의 변수가 있습니다.
참고 : 사용 된 DATA 문 (총 처리 시간) :
실시간 0.04 초
CPU 시간 0.04 초
경고 : % SYSFUNC 또는 % QSYSFUNC 매크로 함수가 참조하는 LOG10 함수에 대한 인수
범위를 벗어났습니다.
참고 : % SYSFUNC 함수 실행 중에는 수학 연산을 수행 할 수 없습니다. 그만큼
작업 결과가 누락 된 값으로 설정되었습니다.
참고 : 누락 값에 대한 작업을 수행 한 결과 누락 값이 생성되었습니다.
% SYSEVALF 표현식 평가 중.
참고 : 데이터 세트 OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM에서 읽은 48909 관측치가있었습니다.
참고 : OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM 데이터 세트에는 48909 개의 관측 값과 28 개의 변수가 있습니다.
참고 : 사용 된 DATA 문 (총 처리 시간) :
실시간 0.03 초
CPU 시간 0.03 초
베스트,
실 벅벅
Von : dougR
Gesendet : 2014 년 10 월 13 일 월요일 오후 4:38
An : Wimmers, Siriluck
Betreff : Re : - 무작위, 수정 및 공분산 효과 (Proc Grimmix)를 사용하여 서수 특성에 따라 40000 개의 마커 대신 JMP 유전체를 계산하는 이유는 무엇입니까?
JMP 사용자 커뮤니티 <>
JMP genomics가 임의, 수정 및 공분산 효과 (Proc Grimmix)가있는 서수 특성에 따라 40000 개의 마커 대신 20000 개의 마커 만 계산하는 이유는 무엇입니까?
Doug Robinson <> 토론에서 - 전체 토론보기 <>
우리는 이것에 대해 좀 더 많은 정보가 필요하다고 생각합니다. 오류가 있습니까? 우리가 처음 추측 한 것은 마커의 유형이 실제로 "대립 형"으로 검사되었는지 여부는 유전자형 또는 비 한정형 유전자형 (데이터 표의 각 마커에 대해 단일 열로 표시되는 대립 형질)입니다. 설정 파일을 보낼 수 있다면 도움이 될 것입니다.
