<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />ランダム、固定、および共分散効果を持つ序数特性で、なぜ40000マーカーではなくたった20000マーカーしかJMPゲノミクス計算されないのか(Proc Grimmix)。
親愛なるダグ
迅速な対応ありがとうございます。私の設定ファイルは問題ないと思います。私はあなたに300サンプルの48909マーカーの代わりにたった30000マーカーの計算をするSASログファイルを送ります。それは私のコンピュータのメモリが足りないという問題であると思います。
私のコンピューターのJMPゲノムと他のもっと大きなサーバーのSASを使用できますか。
これは、ログファイルの例です。
注:データセットWORK.TEMP1から読み取られた48909の観測値がありました。
注:データセットWORK.TEMPには、48909個の観測値と3つの変数があります。
注:PSMOOTH使用プロシージャー(合計処理時間):
リアルタイム0.03秒
CPU時間0.04秒
警告:マクロ機能%SUBSTRの引数2が範囲外です。
警告:マクロ機能%SUBSTRの引数3が範囲外です。
注:データセットWORK.TEMP1から読み取られた48909の観測値がありました。
注:データセットWORK.TEMPから読み取られた48909の観測値がありました。
注:データセットOUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKMには、48909個の観測値と29個の変数があります。
注:使用されているDATAステートメント(合計処理時間):
リアルタイム0.04秒
CPU時間0.04秒
警告:%SYSFUNCまたは%QSYSFUNCマクロ関数によって参照される関数LOG10への引数
範囲外です。
注:%SYSFUNC関数の実行中に数学演算を実行できませんでした。の
操作の結果が欠損値に設定されました。
注:欠損値に対して操作を実行した結果、欠損値が生成されました
%SYSEVALF式の評価中
注:データセットOUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKMから48909の観測値が読み取られました。
注:データセットOUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKMには、48909個の観測値と28個の変数があります。
注:使用されているDATAステートメント(合計処理時間):
リアルタイム0.03秒
CPU時間0.03秒
ベスト、
シリラック
フォン:ダグ
Gesendet:2014年10月13日月曜日、午後4時38分
An:Wimmers、Siriluck
Betreff:Re: - ランダム、固定、共分散の効果を持つ序数の特徴によって、なぜJMPゲノミクスが40000マーカーではなくたった20000マーカーを計算するのか(Proc Grimmix)。
JMPユーザーコミュニティ<>
ランダム、固定、および共分散効果を持つ序数特性で、なぜ40000マーカーではなくたった20000マーカーしかJMPゲノミクス計算されないのか(Proc Grimmix)。
ディスカッションのDoug Robinson <>からの返信 - ディスカッション全体を表示<>
これについてもう少し情報が必要だと思います。エラーがありましたか?私たちの最初の推測は、それが実際には遺伝子型か非区切りの遺伝子型(データテーブルの各マーカーに対して単一の列に表されている)のいずれかである場合、マーカーの種類は「対立遺伝子」としてチェックされたことです。あなたが設定ファイルを送ることができればそれは助けになるでしょう。