<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />為什麼JMP基因組學僅通過具有隨機,修復和協方差效應的序數性質計算20000個標記而不是40000個標記(Proc Grimmix)。
親愛的道格
感謝快速回复。我認為我的設置文件沒問題。我發給你一些SAS日誌文件,它只計算30000個標記而不是300個樣本的48909個標記。我認為這可能是我的電腦內存不足的問題。
我可以使用來自我的計算機的JMP基因組和來自其他更大服務器的SAS。
這里以日誌文件的一些剪切為例。
注意:從數據集WORK.TEMP1中讀取了48909個觀測值。
注意:數據集WORK.TEMP有48909個觀測值和3個變量。
注意:使用過程PSMOOTH(總處理時間):
實時0.03秒
cpu時間0.04秒
警告:參數2到宏功能%SUBSTR超出範圍。
警告:參數3到宏功能%SUBSTR超出範圍。
注意:從數據集WORK.TEMP1中讀取了48909個觀測值。
注意:從數據集WORK.TEMP中讀取了48909個觀測值。
注意:數據集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM具有48909個觀測值和29個變量。
注意:使用的DATA語句(總處理時間):
實時0.04秒
cpu時間0.04秒
警告:%SYSFUNC或%QSYSFUNC宏函數引用的函數LOG10的參數
超出範圍。
注意:在%SYSFUNC函數執行期間無法執行數學運算。該
操作結果已設置為缺失值。
注意:由於對缺失值執行操作而生成缺失值
在%SYSEVALF表達式評估期間。
注意:從數據集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM讀取了48909個觀測值。
注意:數據集OUTLIB.WT5_26_DMG_IBD_KC_QKM具有48909個觀測值和28個變量。
注意:使用的DATA語句(總處理時間):
實時0.03秒
cpu時間0.03秒
最好,
Siriluck
馮:道格
Gesendet:2014年10月13日星期一下午4:38
An:Wimmers,Siriluck
Betreff:Re: - 為什麼JMP基因組計算只有20000個標記而不是40000個標記,具有隨機,修復和協方差效應的序數特徵(Proc Grimmix)。
JMP用戶社區<>
為什麼JMP基因組學僅通過具有隨機,修復和協方差效應的序數性質計算20000個標記而不是40000個標記(Proc Grimmix)。
Doug Robinson的回复<>在討論中 - 查看完整討論<>
我想我們需要更多關於此的信息。有錯誤嗎?我們最初的猜測是標記的類型被檢查為“等位基因”,而實際上它是基因型或非定界基因型(數據表中每個標記的單個列中都表示了兩個等位基因)。如果您可以發送設置文件,那將有所幫助。