Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Design entfernt werden?Verehrte Gäste,
Ich habe ein faktorielles Experiment durchgeführt. Meine Faktoren sind A (4-Stufen), B (2-Stufen) und C (2-Stufen) in 4 Blöcken. Faktor A ist unterschiedliche Genotypen einer Pflanze. In diesem Experiment habe ich verschiedene Merkmale gemessen.
Ich möchte meine Messungen in ein Modell einfügen und die Variation von Faktor A aus meiner Datenantwort entfernen. Kann ich es schaffen?
Ich habe in einer Arbeit eine Methode dazu gesehen. Sie analysierten die Reaktion der Daten (z. B. Biomasse) auf Faktor A. Anschließend speicherten sie die Residuen und verwendeten sie als neue Variablen (Biomasse ohne Faktor-A-Variation). Ich habe die gleiche Methode in JMP durchgeführt, bin mir aber nicht sicher, ob sie richtig ist oder nicht?Ist das statistisch möglich?
Vielen Dank
Meelad
VersuchsplanungBetreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Phil,
Vielen Dank, ich bin in Statistik und SEM nicht perfekt, ich bin nur ein Anfänger. Ihr Rat war für mich nützlich.
Ihr Link, den Sie mir geschickt haben, war hilfreich. Ich habe SEM ohne Residuen ausgeführt, da ich nicht sicher bin, ob ich sie für meinen Zweck im Modell verwenden kann. Ich denke, dass ich mehr über Residuen lernen muss. Natürlich habe ich einige Artikel gefunden, in denen die Residuen im Modell verwendet wurden.
Ich habe durch Ihren Rat noch mehr gelernt.
Vielen Dank für Ihre Zeit,
Mit freundlichen Grüßen,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Okay, Mylad. Ich überlasse es Ihnen, zu entscheiden, wie Sie dies in Ihrer Analyse verwenden. Ich gehe davon aus, dass Sie wissen, was Sie tun und warum Sie SEM anwenden müssen, aber es scheint mir ein ungewöhnlicher Ansatz zu sein. Ich habe SEM im Rahmen meines Masterstudiums in Statistik studiert und es fiel mir schwer, die Methode und die Anwendung zu verstehen.Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Phil,
Danke für deine Nachricht.
Ich meine die Residuen, die ich aus dem Modell gespeichert habe, das ich nach dem Zufallsprinzip mit „Genotyp“ und „Blockieren“ ausgeführt habe.
Ich glaube, dass ich mehr daran arbeiten sollte, bis ich sie verwende.
Ich möchte ein SEM mit R ausführen, ich möchte lediglich Daten in JMP berechnen und vorbereiten.
Vielen Dank,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Ich bin mir nicht sicher, von welchen Resten Sie jetzt sprechen. Sie möchten die Residuen des von mir vorgeschlagenen Modells nicht verwenden, da diese Residuen nur Aufschluss über die Variation geben würden, die nicht durch Block, Genotyp und die Variablen 1 und 2 erklärt wird.
Die Modellierung von Strukturgleichungen ist eine ziemlich schwer zu verstehende Methode (und derzeit in JMP nicht möglich). Ich bin mir nicht sicher, wie Sie SEM hier anwenden würden, aber ich schlage vor, dass Sie zunächst sicherstellen, dass Sie mit der Regressionsmodellierung vertraut sind.
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Mark,
Vielen Dank für deinen Rat,
Ich habe gesucht nach „ Vorhersage-Profiler". Es sieht gut aus. Ich glaube, dass es hilfreich wäre.
Danke schön,
Beste grüße,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Phil,
Vielen Dank für Ihre Zeit, es war großartig.
Ja, der Effekt von „Genotyp“ ist für mich nicht wichtig. Ich möchte es aus meinen Daten entfernen. Ich denke, dass ich Variablen vielleicht in einem besseren Zustand bewerten kann. Ich finde deine Lösung großartig.
Glauben Sie, dass ich diese Residuen als neue Variablen verwenden kann, um den „Genotyp“-Effekt zu reduzieren? Weil ich sie im Strukturgleichungsmodell verwenden möchte.
Beste grüße,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Ich möchte nur darauf hinweisen, dass die Grundlage für Phils Lösung darin besteht, dass ein lineares Modell alle Beiträge zu jeder Antwort gleichzeitig berücksichtigen kann. Sie haben ein Experiment mit mehreren Faktoren entworfen, analysieren es jedoch jeweils faktorweise. Es ist kein ungültiger Ansatz, aber Sie können mit dem von Phil vorgeschlagenen Modell mehr erreichen. Mit dem Prediction Profiler können Sie beispielsweise die Abhängigkeit von allen Faktoren visualisieren.
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Hallo,
Ich habe versucht, Ihr Experiment als .jmp-Tabelle anzuhängen, hatte aber das gleiche Problem. Ich werde den Community-Manager informieren, damit das Problem hoffentlich bald gelöst wird.
Ich habe das Design bewertet und festgestellt, dass es für Haupteffekte und Zwei-Faktor-Wechselwirkungen fast vollständig orthogonal ist (einige leichte Korrelation aufgrund der ausgeschlossenen „Ausreißer“-Läufe).
Ich habe mich nicht im Detail mit dem Ansatz befasst, den Sie gewählt haben. Ich denke, es ist wahrscheinlich in Ordnung, würde aber von einem Statistiker nicht empfohlen werden.
Mein Ansatz wäre, ein Modell einschließlich Genotyp anzupassen. Ich definiere es als einen zufälligen Effekt. Dies liegt daran, dass es sich meines Erachtens um einen Faktor handelt, von dem Sie erwarten, dass er die Antworten beeinflusst. Aber es ist Ihnen eigentlich egal, welche Wirkung Genotyope hat. Sie müssen nur die Wirkung berücksichtigen, damit sich Ihre Einschätzung der Wirkungen, die Ihnen wichtig sind, nicht ändert: Nährstoff 1 und 2 und ihre Wechselwirkung. Liege ich da richtig?
Aus dem gleichen Grund sollten Sie Block auch als Zufallseffekt definieren.
Deshalb habe ich ein Modell mit Block und Genotyp als zufälligen Effekten und Nährstoff1, Nährstoff2, Nährstoff1*Nährstoff2 als festen Effekten angepasst. Dieses Modell zeigt Ihnen die Wirkung der Nährstofffaktoren unter Berücksichtigung der Variation in den Reaktionen aufgrund von Block und Genotyp.
Wenn Sie dies versuchen, stimmen die Ergebnisse im Großen und Ganzen mit Ihrer Analyse überein? Es sieht so aus, als ob Nährstoff 1 einen signifikanten Einfluss auf Variable 1 hat und der andere Einfluss nicht signifikant ist.
Grüße,
Phil
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Phil,
Vielen Dank, dass Sie sich die Zeit genommen haben, mich zu beraten.
Ich habe die Faktoren einem Teil meiner Daten beigefügt. Bitte finden Sie es. Ich konnte die .jmp-Datei nicht anhängen, ich sah diese Meldung: „ Der Inhalt des Anhangs stimmt nicht mit seinem Dateityp überein. ". Also habe ich das Bild der Schritte eingefügt und die Excel-Tabelle angehängt.
Dieses Experiment ist unter RCBD faktoriell. Genotyp (4 Stufen, A, B, C und D), Nährstoff 1 (2 Stufen, 10 und 40) und Nährstoff 2 (2 Stufen, 25 und 100) sind Faktoren in 4 Blöcken. Außerdem sind „Variable 1“ und „Variable 2“ Variablen, die ich während des Experimentzeitraums gemessen habe. In dieser Datei habe ich die Variablen logarithmiert.
Beispielsweise hatten unterschiedliche „Genotypen“ unterschiedliche Auswirkungen auf „Variable 2“. Während ich im Modell nur die Effekte von „Nährstoff 1“ und „Nährstoff 2“ benötige. Daher möchte ich den Effekt von „Genotyp“ aus „Variable 1“ und „Variable 2“ entfernen. Zu diesem Zweck habe ich zunächst „Fit Y by X“ für jede Variable nach „Genotype“ verwendet und dann die Residuen für jede Variable gespeichert.
Step 1. Fit y by x.Step 1. Fit y by x.Schritt 1. Passe y an x an.
Im zweiten Schritt habe ich diese Residuen im „Fit-Modell“ nach „Block, Nutrient 1, Nutrient 2, Nutrient 1*Nutrient 2“ als Vollfaktor verwendet. Danach habe ich die Residuen, die ich mit dieser Methode erhalten habe, gespeichert und als neue Variablen verwendet.
Ich habe „Schritt 1“ und „Schritt 2“ in „Datentabelle“ in dieser Datei erwähnt. Außerdem sind „Schritt () – Variable ()“ Residuen, die ich aus jedem Schritt für jede Variable gespeichert habe.(Ich konnte die .jmp-Datei nicht anhängen). Für diese Variablen habe ich gerade zwei Ausreißer entfernt, die Sie in dieser Datei sehen können (Zeile 20 und 61).
Step 2.Step 2.Schritt 2. Als ich diese Methode verwendete, war die Regression zwischen einigen Variablen unterschiedlich. Beispielsweise würde die Regression zwischen zwei Variablen von negativ in positiv geändert werden.
Vielen Dank,
Mit freundlichen Grüßen,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Hallo,
Aus Ihrer Beschreibung lässt sich das nur schwer beantworten. Ich bin mir nicht sicher, welchen Ansatz Sie gewählt haben. Können Sie die Daten oder eine anonymisierte Version weitergeben? Oder können Sie veranschaulichen, was Sie mit einem der JMP-Beispieldatensätze tun möchten? Vielleicht ist das Beispiel „2x3x4“ ähnlich:
Open("$SAMPLE_DATA/Design Experiment/2x3x4 Factorial.jmp")
Grüße,
Phil
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Lieber Phil,
Vielen Dank für Ihre Zeit und die klare Erklärung.
Ich habe die Links gesehen, die Sie erwähnt haben. Ich denke, dass die Auswirkungen von A*B und A*C und B*C auf Variablen in meinem Experiment wie bei Versuchsplan 2 aussehen, also nicht orthogonal sind.
Könnten Sie sich bitte den Prozess ansehen, den ich durchgeführt habe, um den Effekt von A aus meinen Variablen zu entfernen?
1. Ich habe die Residuen von A mit jeder Variablen gespeichert.
2. Ich führe die vollständige Fakultät (B und C) für gespeicherte Residuen aus. Dann habe ich die Residuen als neue Variable gespeichert.
Jetzt wurde der Effekt von A aus den neuen Variablen entfernt.
Glaubst du, dass es richtig ist?
Vielen Dank für Ihre Zeit,
Prost,
Milad
Betreff: Wie kann die Variation eines Faktors aus Datenantworten in einem faktoriellen Versuchsplan entfernt werden?Ja, das ist möglich. Von jedem Modell in JMP können Sie Residuen speichern, z. B. von Fit Y by X: https://community.jmp.com/t5/Discussions/How-to-save-residuals-in-Fit-Y-by-X-platform-for-two-continuous/td-p/20608 .Sie können auch Residuen aus Fit Model und anderen Modellierungsplattformen speichern.
Ist es richtig? Nun ja, es gibt eigentlich kein Richtig oder Falsch. Sie müssen darüber nachdenken, was Sie hier tun. Sie müssen auch berücksichtigen, wie gut Ihre Daten für die separate Schätzung der Wirkung von A geeignet sind. Sind die Effekte von A, B und C in Ihrem experimentellen Design orthogonal? Sehen mein aktueller Blogbeitrag für ein Verständnis dessen, was ich meine.
Ich würde sagen, dass es üblicher ist, sowohl A als auch B und C in ein multiples Regressionsmodell einzubeziehen. Auf diese Weise wird die Variation der Biomasse aufgrund von A vom Modell erfasst und ermöglicht es Ihnen, die Auswirkung von B und C zu verstehen.
Hoffentlich hilft das.
Phil
