Cómo configurar un ANOVA para el análisis del ROIDisculpas por adelantado a los usuarios experimentados de JMP; esta es una pregunta de novato
Tengo un conjunto de datos de ROI cerebrales derivadas anatómicamente que miden la anisotropía fraccional (FA). Hay un total de 20 ROI, algunas de las cuales son de segundo orden (derivadas de las otras). Mi factor principal es el grupo (normal contra la demencia). Para el análisis de FA, también me gustaría controlar las diferencias de tamaño entre el MISMO ROI en los 2 grupos (tengo un tamaño de ROI, en mm para cada uno). También la edad y el sexo. ¿Cómo configuro el ANOVA en JMP13? La estructura de datos es la siguiente:
Tema 1: grupo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, edad, sexo
Tema 2: grupo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, edad, sexo
Asunto x: grupo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, edad, sexo
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROIParece que no tiene la información espacial para ajustarse a un modelo espacial utilizando el modelo mixto. Aquí hay un ejemplo de ajuste de dicho modelo. https://www.jmp.com/support/help/13-2/Spatial_Example_3a_Uniformity_Trial.shtml#1264182
Sin embargo, con los datos que ha recopilado mostrados arriba y apilados donde hay una columna de Asunto que identifica a los sujetos y una columna Repetida que identifica la secuencia de ROI_FA, puede ejecutar el análisis de medidas repetidas utilizando el Modelo Mixto. El tamaño de la ROI, la edad y el sexo entran en el modelo como efectos fijos. Para empezar, pruebe algunas de las estructuras de covarianza más simples. https://www.jmp.com/support/help/13-2/Fit_Model_Launch_Window_2.shtml
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROIbache.
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROIGracias, ese artículo fue definitivamente útil. Estoy seguro de que lo que estaba buscando era la "personalidad" del Modelo Mixto, y lo que faltaba era el conocimiento del comando "pila" en el menú Tablas, que me permitió reestructurar mis datos para que se ajustaran al método. Ahora me encuentro con otra pregunta de nivel superior, que es la elección de la estructura de covarianza repetida para mis datos. Sospecho que necesito una de las 4 opciones "espaciales", pero esto es solo una corazonada, y ciertamente no sé cuál de las 4 seleccionar, ni qué "Tipo" es mejor para estos datos, ni qué se entiende por la entrada requerida "Repetida". ¿Hay una página que discute estas opciones?
Con todo, lo que sería más útil sería encontrar una discusión en algún lugar sobre cómo utilizar JMP con datos de MRI (o imágenes similares). ¿Hay tal página, o grupo disponible?
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROIGracias por su respuesta. Esta Nota debería ser útil para usted en la configuración de su análisis. Hay tres enfoques diferentes para que usted considere.
En cuanto al tamaño, no conozco lo suficiente sobre su campo como para sugerir nada más que los enfoques de normalización más obvios, como la relación (ROI / tamaño). Sin embargo, es posible que pueda usarlo como una covariable si usa el enfoque de 'parcela dividida' descrito en la nota.
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROINo, no lo son. Estas medidas de ROI estarán altamente correlacionadas, ya que son regiones cerebrales diferentes pero adyacentes del mismo individuo.
Re: Cómo configurar un ANOVA para el análisis de ROI¿Las medidas de ROI para cada sujeto se consideran respuestas independientes?