Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROIScuse in anticipo agli utenti JMP esperti; questa è una domanda da principianti.
Ho un set di dati sulle ROI cerebrali di origine anatomica che misurano l'anisotropia frazionale (FA). Ci sono un totale di 20 ROI, alcune delle quali sono in 2 ° ordine (derivate dalle altre). Il mio principale fattore è il gruppo (normale vs demenza). Per l'analisi FA, vorrei anche controllare le differenze di dimensione tra lo SAME ROI nei 2 gruppi (ho una dimensione di ROI, in mm per ognuna). Anche età e sesso. Come configuro l'ANOVA in JMP13? La struttura dei dati è la seguente:
Oggetto 1: gruppo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, età, sesso
Oggetto 2: gruppo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, età, sesso
Oggetto x: gruppo, ROI1_FA, ROI2_FA, ROIn_FA, ROI1_size, ROI2_size, ROIn_size, età, sesso
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROINon sembra che le informazioni spaziali si adattino a un modello spaziale utilizzando il modello misto. Ecco un esempio di adattamento di tale modello. https://www.jmp.com/support/help/13-2/Spatial_Example_3a_Uniformity_Trial.shtml#1264182
Tuttavia, con i dati raccolti sopra e impilati dove sono presenti soggetti che identificano la colonna Oggetto e Colonna ripetuta che identifica la sequenza di ROI_FA, è possibile eseguire l'analisi delle misure ripetute utilizzando il Modello misto. Le dimensioni del ROI e l'età e il sesso entrano nel modello come effetti fissi. Per iniziare, prova alcune delle più semplici strutture di covarianza https://www.jmp.com/support/help/13-2/Fit_Model_Launch_Window_2.shtml
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROIurto.
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROIGrazie, quell'articolo è stato sicuramente d'aiuto. Sono certo che quello che stavo cercando era la "personalità" del Modello Misto, e quello che mi mancava era la conoscenza del comando "stack" nel menu Tabelle, che mi permetteva di ristrutturare i miei dati per adattarli al metodo. Ora mi trovo di fronte a un'altra domanda di livello superiore, che è la scelta della struttura di covarianza ripetuta per i miei dati. Sospetto di aver bisogno di una delle 4 opzioni "spaziali", ma questa è solo un'intuizione, e certamente non so quale dei 4 selezionare, né quale "Tipo" è il migliore per questi dati, né cosa si intende per l'input "ripetuto" richiesto. C'è una pagina che discute queste opzioni?
Tutto sommato, ciò che sarebbe più utile sarebbe trovare una discussione da qualche parte su come utilizzare i dati JMP con risonanza magnetica (o immagini simili). Esiste una tale pagina o gruppo disponibile?
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROIGrazie per la tua risposta. Questo Nota dovrebbe esserti utile nell'impostazione della tua analisi. Ci sono tre diversi approcci da prendere in considerazione.
Per quanto riguarda le dimensioni, non so abbastanza sul tuo campo per suggerire qualsiasi cosa tranne gli approcci di normalizzazione più ovvi, come il rapporto (ROI / dimensione). Potresti essere in grado, tuttavia, di usarlo come covariata se usi l'approccio "split-plot" descritto nella nota.
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROINo, non lo sono. Queste misure di ROI saranno altamente correlate, in quanto sono regioni del cervello diverse ma adiacenti dallo stesso individuo.
Ri: Come impostare un ANOVA per l'analisi del ROILe misurazioni del ROI per ciascun soggetto prendono in considerazione risposte indipendenti?
