Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?Ciao a tutti,
Ne ho appena guardato uno @giuliano video di YouTube, che mostrano come creare diversi grafici di correlazione delle mappe di calore utilizzando jmp.
Sto cercando di analizzare uno dei miei set di dati prendendo diversi valori di correlazione, spearman p, pearson e kendall's t, quindi raggruppando i dati utilizzando tecniche diverse, reparto, media, collegamento completo ecc. Il risultato finale è produrre qualcosa di simile alla foto qui sotto realizzata in R studio.
So che esiste un cluster fuori dalla funzione di correlazione in multivariato, ma qualcuno sa come si regola la tecnica del cluster e i valori di correlazione utilizzati nell'analisi del cluster?
Analisi prodotta in R studio
Grazie per l'aiuto
Kyle
Ri: Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?Grazie, Giuliano. Ho provato anche il tuo componente aggiuntivo, ma sfortunatamente la finestra con la rappresentazione matriciale delle correlazioni si presenta solo brevemente e poi scompare di nuovo. Ho bisogno di esaminare questo. Non vedo l'ora di farlo funzionare, il tuo componente aggiuntivo sembra essere molto utile. Immagino che farei una tabella della matrice di correlazione e la userei come input per la funzionalità di "clustering".
Saluti.
Ri: Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?CIAO @COME ,
Puoi produrre un file dendrogramma per le variabili utilizzando Analizza > Clustering > Cluster gerarchico. Dopo aver selezionato le variabili e prodotto il report, vai al Triangolo rosso > Cluster a due vie. Questo raggrupperà quindi le variabili, piuttosto che le righe.
Dovrei notare che questo non è esattamente lo stesso del clustering sulle correlazioni, sebbene stia arrivando alla stessa cosa. Come una correlazione, questo è un modo per capire quali variabili sono simili in termini di valori tra le righe. Nell'esempio precedente che utilizza il set di dati di esempio Dati demografici degli Stati Uniti, il rapporto di clustering a due vie mostra che le variabili di Obesi e Fumatori sono simili, il che significa che il profilo tra gli stati è simile per quelle variabili... che è simile a dire le variabili sono correlati tra gli stati, ma il clustering gerarchico non è statisticamente equivalente al calcolo e al tracciamento della somiglianza in termini di correlazione.
Ri: Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?Ciao Giuliano,
Ho lo stesso problema di Kyle (aveva). Vedo il cluster sulle correlazioni nell'output Mulitvariate, ma avrei bisogno di un dendrogramma con quello che non sono ancora riuscito a trovare. Potresti per favore indicarmi l'opzione, su come generare il dendrogramma delle correlazioni e quale formato di dati di input dovrebbe essere usato? Grazie per la vostra considerazione. Andreas
Ri: Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?Grazie,
Anche l'addin è molto utile
Ri: Analisi delle correlazioni dei cluster in JMP?CIAO @ Kyle ,
La mappa termica di correlazione in Multivariate si basa solo sulla correlazione di Pearson. Se vuoi creare una mappa termica delle correlazioni usando un'altra statistica (come Tau o Rho) dovrai generare una tabella di correlazioni come ho mostrato nel video che hai visto. Per farlo più rapidamente potresti utilizzare un componente aggiuntivo che ho scritto per automatizzare il processo: https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Correlate-Y-by-X-Add-In/ta-p/23628/
Per quanto riguarda la modifica della tecnica di clustering, è possibile impostare il metodo utilizzato quando si avvia il clustering gerarchico da Analizza> Clustering nella sezione delle opzioni nella parte inferiore sinistra della finestra di avvio. Dopo aver generato il rapporto sul cluster, puoi richiedere il clustering bidirezionale dal triangolo rosso, che raggrupperà le variabili utilizzate nella tua analisi. Assemblare tutti i pezzi insieme per creare la trama che hai allegato sarà un processo in qualche modo manuale: la mia raccomandazione sarebbe quella di salvare ogni elemento come immagine da JMP e poi assemblarli in un programma di grafica (o anche Powerpoint).
Spero che questo ti aiuti a iniziare!
@giuliano
