ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesJe suis nouveau sur JMP et j'ai du mal à exécuter une ANOVA à mesures répétées. Le problème est que j'ai deux facteurs et que les DEUX sont des mesures répétées. Tous les exemples trouvés en ligne montrent des mesures répétées ANOVA avec un facteur entre les sujets et un à l'intérieur. Quelqu'un peut-il aider? Voici une description.
Un groupe de sujets. Il s'agit d'une tâche de reconnaissance faciale avec suivi oculaire. La variable dépendante est la durée du temps de recherche.
Facteur de mesures répétées 1 : Demi-visage (face supérieure vs face inférieure)
Mesures répétées facteur 2 : Phase (Apprentissage, Cible et Distracteur)
En bref, nous sommes intéressés à voir si les sujets regardent plus longtemps vers le haut ou le bas du visage et aussi si leur durée de temps de regard diffère selon la phase (quand ils apprennent le visage, pour les visages cibles ou pour les visages distracteurs). Plus l'interaction.
Aider!
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesMerci Julien. J'ai creusé un peu dans la modélisation mixte linéaire depuis lors et j'ai beaucoup clarifié ce problème. Pour ceux qui lisent cet article et qui ont des questions similaires, consultez Andy Field's Discovering Statistics 4th ed (Chapitre sur les modèles linéaires à plusieurs niveaux) comme point de départ. Il est maintenant clair pour moi que SPSS et le complément JMP ne traitent pas le sujet comme un effet fixe lors de l'exécution d'une ANOVA. Cependant, si vous pensez qu'il peut y avoir une corrélation entre vos scores au sein d'un sujet, alors le sujet doit être modélisé comme un effet aléatoire à l'aide de la modélisation linéaire mixte . . . ou un autre test qui serait approprié. Si vos mesures intra-sujets ne sont pas corrélées, une ANOVA devrait suffire. Si quelqu'un pense que je me trompe sur ce point, s'il vous plaît corrigez-moi!Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesSalut tout le monde,
Je voulais juste clarifier quelque chose à propos du complément factoriel complet des mesures répétées. Ce complément * ne traite pas * le sujet comme un effet fixe. Le modèle généré par le complément traite le sujet comme un effet aléatoire et modélise toutes les interactions avec les sujets comme aléatoires (pentes aléatoires par sujet). Si vous lancez la boîte de dialogue du modèle après avoir exécuté le modèle (ou directement à partir du complément), vous pouvez voir comment cette structure serait définie dans la boîte de dialogue Ajuster le modèle standard. Les résultats des analyses configurées avec ce complément seront certainement différents du traitement des sujets comme un effet fixe (ce qui n'est bien sûr pas recommandé).
julien
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesJuste pour intervenir...
Si l'investigateur choisit quatre sujets et souhaite que l'interprétation de l'analyse s'applique UNIQUEMENT à ces quatre sujets, le facteur sujet doit être FIXE.
Si l'investigateur a choisi quatre sujets au hasard dans la population de tous les sujets afin de généraliser l'interprétation de l'analyse à cette population, le facteur sujet doit être ALÉATOIRE.
Je recommanderais également Milliken, GA, Johnson, DE (1997); Analyse de données désordonnées, volume 1 : expériences conçues ; Chapman & Hall; pages 322-350.
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesCela le résout pour moi. Merci beaucoup pour tout votre temps et vos efforts. Je comprends maintenant.
Sincèrement,
SherryseRe : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesLe complément traite l'effet de sujet comme fixe, c'est pourquoi vous obtenez les mêmes résultats qu'avec SPSS.
Je pense que le complément a été créé pour reproduire le style d'analyse SPSS pour les utilisateurs qui attendent des résultats lorsque les effets du sujet sont traités comme fixes. La note de la base de connaissances JMP traite les effets de sujet comme aléatoires.
Les mesures répétées sont une conception d'étude courante qui peut utiliser MANOVA. Vous mesurez la réponse du même sujet à plusieurs reprises. Vous pouvez inclure un ou plusieurs facteurs et covariables. L'effet sujet est à nouveau traité comme aléatoire.
Désolé mais il est difficile de vous suivre. J'ai des problèmes informatiques multiples et profonds - au niveau du BIOS !
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesOk, je te rejoins sur ton premier point. Je peux voir comment il faudrait beaucoup de temps pour que ces méthodes soient mises à jour et deviennent courantes.
Concernant ce commentaire, "si l'on utilisait une MANOVA traditionnelle pour une analyse à mesures répétées, le sujet est un effet aléatoire." Puis-je poser ma question d'une manière différente peut-être? Si j'utilise le complément JMP pour l'ANOVA à mesures répétées factorielles complètes pour effectuer mon analyse (comme je l'ai fait au début de ce fil), le sujet sera-t-il traité comme un effet fixe ou aléatoire ?
Si elle est corrigée, je comprends votre commentaire sur cette méthode "en retard". S'il est aléatoire, quelle est la différence entre ce que fait le complément et l'exécution de l'analyse à l'aide de cette méthode ( http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html ) avec l'approche split-plot univariée ? Les résultats sont un peu différents. Ma seule conclusion est que le complément traite le sujet comme un effet fixe et que la deuxième méthode le traite comme aléatoire.
Je suis également un peu surpris par l'utilisation du terme "MANOVA" par JMP, car j'ai toujours pensé que MANOVA impliquait deux variables dépendantes ( http://online.sfsu.edu/efc/classes/biol710/m… ), alors que je n'ai qu'un seul DV. Je suppose que JMP l'appelle MANOVA mais si vous n'entrez que sur DV, alors c'est vraiment une ANOVA que vous exécutez ?
Désolé pour la longue série de questions. J'espère que ce fil sera utile à quelqu'un qui se posera les mêmes questions que moi à l'avenir. Et j'apprends beaucoup dans le processus!Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesLes professeurs de statistiques de SAS Education recommandent ce livre :
Stroup, Walter W. (2013) Modes mixtes linéaires généralisés : concepts, méthodes et applications modernes , CRC Press, Boca Raton, Floride, ISBN 978-1-4398-1512-0 (relié)
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesOK, on dirait que vous êtes convaincu que le sujet, dans le cadre de l'unité expérimentale, devrait être un effet aléatoire. Il s'agit implicitement d'un effet aléatoire dans la MANOVA. Il s'agit explicitement d'un effet aléatoire dans le modèle à effets mixtes.
Il existe des situations dans lesquelles l'effet de bloc doit être traité comme un effet fixe, mais elles ne ressemblent en rien à votre étude.
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesJe ne sais pas avec certitude que la majorité des utilisateurs de SPSS traitent le sujet comme un effet fixe, mais je vous crois. La majorité n'a pas toujours raison et dans les statistiques, la majorité est souvent tout simplement en retard en termes d'adoption de nouvelles méthodes. Il faut une vingtaine d'années pour que les méthodes s'imposent et une autre décennie pour qu'elles soient couvertes dans les manuels et enseignées à l'école.
Vous avez raison : si l'on utilisait une MANOVA traditionnelle pour une analyse à mesures répétées, le sujet est un effet aléatoire.
Il n'est pas faux de traiter le sujet comme un effet fixe mais à quoi sert cette interprétation ? Le sujet n'a rien à voir avec les traitements. Le sujet n'est qu'une partie de l'unité expérimentale.
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesPS Merci également pour votre commentaire ci-dessus. Je comprends ce que vous décrivez en principe, mais je suis confus sur l'idée que j'ai toujours pensé qu'une ANOVA à mesures répétées standard traitait déjà le sujet comme un effet aléatoire. Comme l'a récemment dit un autre ami statisticien : "Je ne sais pas pourquoi SPSS traiterait *jamais* le sujet comme un effet fixe. Je suis presque sûr qu'il traite le sujet comme un effet aléatoire. Traiter les sujets comme aléatoires vient de l'idée d'échantillonnage aléatoire, où nous supposons que la variance des scores chez les sujets est un véritable reflet de la variance d'erreur dans la population - cela nous permet de généraliser à la population, plutôt qu'aux N personnes seulement dans notre échantillon. Traiter les sujets comme des facteurs fixes ou aléatoires change généralement la façon dont nous construisons les F-ratios. Les tests que vous obtenez de l'un ou l'autre programme doivent utiliser le terme d'erreur comme dénominateur dans le rapport F. Ainsi, par exemple, le rapport F pour la moitié du visage doit être MS (moitié du visage)/MS (erreur), avec 1, 2x3x(N-1) degrés de liberté ; Le rapport F pour la phase devrait MS(phase)/MS(error) avec 2, 2x3x(N-1) degrés de liberté ; et le rapport F pour l'interaction doit être MS(interaction)/MS(error) avec 2, 2x3x(N-1) degrés de liberté. Tout ce qui vous donne cela le fait bien !"Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesMerci beaucoup pour la réponse rapide. Avez-vous des ressources que vous pouvez me diriger sur ce sujet? J'ai fini par analyser mes données d'abord dans SPSS avec une ANOVA à mesures répétées "traditionnelle" (j'appellerai cela "SPSS traditionnel" pour plus de simplicité). Ensuite, j'ai effectué la même analyse dans JMP, mais en incluant le sujet comme effet aléatoire (JMP Mixed Effects) et, bien sûr, j'ai obtenu un résultat légèrement différent. Ensuite, j'ai utilisé le complément recommandé ci-dessus pour effectuer une ANOVA à mesures répétées (JMP Traditional) et j'ai obtenu un résultat identique à mon analyse SPSS Traditional. Enfin, j'ai pu utiliser SPSS Mixed pour effectuer une ANOVA à mesures répétées avec le sujet comme effet aléatoire (SPSS Mixed Effects) et j'ai produit un résultat identique à ce que j'avais obtenu avec "JMP Mixed Effects". Donc, essentiellement, les deux programmes font la même chose, il est simplement plus facile de faire l'analyse des effets mixtes dans JMP. Maintenant, ce qui me trouble encore, c'est POURQUOI le sujet devrait être inclus comme un effet aléatoire alors qu'il me semble que ce n'est pas ce que font la plupart des gens (ou du moins pas ce que font la majorité des utilisateurs de SPSS). Une ANOVA "traditionnelle" à mesures répétées ne traite-t-elle pas déjà le sujet comme un effet aléatoire dans une certaine mesure ? Pouvez-vous m'indiquer des ressources qui démontrent la différence entre ce que fait le modèle traditionnel et ce que fait l'inclusion du sujet comme effet aléatoire ? Merci beaucoup de m'avoir aidé à régler ce problème. Je veux m'assurer que je le comprends vraiment.Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesLe fait est que les logiciels étaient généralement incapables d'estimer correctement les effets aléatoires correctement, sauf dans des cas particuliers jusqu'à une époque récente. Ainsi, la plupart des analyses ont utilisé une ANOVA standard ou une analyse de régression et ont (incorrectement) traité tous les effets comme des effets fixes. De nombreux manuels doivent encore rattraper les pratiques plus modernes.
Le choix entre fixe ou aléatoire est basé sur votre inférence sur l'effet d'une source de variation. Nous nous intéressons généralement aux effets fixes de facteurs tels que le traitement. Nous considérons cet effet comme fixe parce que notre inférence porte sur des niveaux spécifiques et nous pensons que chaque niveau produit toujours le même effet. Par contre, certaines sources de variation ne représentent qu'un échantillon. L'effet de sujet est un tel cas. Nous ne sommes généralement pas intéressés par l'effet d'un sujet individuel car il ne généralise pas mais se soucie plutôt de la population. Dans ce cas, nous nous intéressons à la variance entre les sujets. L'effet aléatoire est cette variance.
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesJe suis tellement content que vous ayez demandé! Cette question nous tue ! Nous avons essayé de comprendre pourquoi notre sortie dans SPSS est si différente de celle dans JMP. En fin de compte, nous avons pensé que cela devait être lié au fait que JMP traite le sujet comme un effet aléatoire. Il s'avère que si j'utilise le complément recommandé ci-dessus, le résultat est identique à celui de SPSS. Alors, pouvez-vous nous dire s'il vous plaît!? Pourquoi le sujet doit-il être inclus comme effet aléatoire ? J'ai cherché dans des livres de statistiques, des ressources en ligne, partout où je peux penser pour comprendre pourquoi JMP fait cela, alors que d'autres logiciels de statistiques ne le font pas ! Si quelqu'un ici peut fournir la réponse, vous ferez ma journée!Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesJim a résolu votre problème mais je veux juste m'assurer que son note dans la base de connaissances JMP fait également partie de votre réponse.
Pourquoi ne voudriez-vous pas traiter le sujet comme un effet aléatoire ? En quoi un effet fixe de sujet a-t-il un sens ?
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesCela l'a résolu. Merci beaucoup!Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesMerci! je vais me renseigner !
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesSi vous n'avez pas regardé cet addin, je vous suggère de le télécharger à partir de l'échange de fichiers
Complément ANOVA à mesures répétées factorielles complètes
Re : ANOVA avec plusieurs facteurs de mesures répétéesDe plus, j'aurais dû préciser que la difficulté réside dans la saisie de ces variables dans JMP pour effectuer l'analyse. Je peux comprendre comment le faire avec une mesure répétée, mais je peux trouver une option pour spécifier que j'en ai deux. J'ai pu le faire fonctionner en utilisant des données empilées mais seulement si je spécifie le sujet comme effet aléatoire, ce que je ne veux pas faire.
