Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Salut tout le monde,
Je viens de voir l'un des @julien vidéos you tube, montrant comment créer différents tracés de corrélation de cartes thermiques à l'aide de jmp.
J'essaie d'analyser l'un de mes ensembles de données en prenant différentes valeurs de corrélation, spearman p, pearson et t de kendall, puis en regroupant les données à l'aide de différentes techniques, service, moyenne, liaison complète, etc. Le résultat final est de produire quelque chose de similaire à la photo ci-dessous réalisée en studio R.
Je sais qu'il existe un cluster hors fonction de corrélation dans multivarate, mais est-ce que quelqu'un sait comment ajuster la technologie de cluster ainsi que les valeurs de corrélation utilisées dans l'analyse de cluster?
Analyse réalisée en studio R
Merci pour votre aide
Kyle
Re : Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Merci, Julien. J'ai également essayé votre complément, mais malheureusement, la fenêtre avec la représentation matricielle des corrélations ne s'affiche que brièvement, puis disparaît à nouveau. J'ai besoin d'examiner cela. J'ai hâte que cela fonctionne, votre complément semble être très utile. Je suppose que je ferais ensuite un tableau de la matrice de corrélation et l'utiliserais comme entrée pour la fonctionnalité de "clustering".
Acclamations.
Re : Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Salut @COMME ,
Vous pouvez produire un dendrogramme pour les variables en utilisant Analyze > Clustering > Hierarchical Cluster. Une fois que vous avez sélectionné vos variables et produit le rapport, accédez au Triangle rouge > Cluster bidirectionnel. Cela regroupera alors les variables, plutôt que les lignes.
Je dois noter que ce n'est pas exactement la même chose que le regroupement sur les corrélations, même si cela revient au même. Comme une corrélation, c'est un moyen de comprendre quelles variables sont similaires en termes de valeurs sur les lignes. Dans l'exemple ci-dessus utilisant l'ensemble de données d'exemple US Demographics, le rapport de regroupement bidirectionnel montre que les variables d'obèse et de fumeurs sont similaires, ce qui signifie que le profil entre les États est similaire pour ces variables... ce qui revient à dire les variables sont corrélés entre les états, mais le regroupement hiérarchique n'est pas statistiquement équivalent au calcul et au traçage de la similarité en termes de corrélation.
Re : Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Salut Julien,
J'ai le même problème que Kyle (avait). Je vois le cluster sur les corrélations dans la sortie multivariée, mais j'aurais besoin d'un dendrogramme avec celui que je n'ai pas encore trouvé. Pourriez-vous s'il vous plaît m'indiquer l'option, comment générer le dendrogramme des corrélations, et quel format de données d'entrée doit être utilisé ? Merci pour votre considération. Andréas
Re : Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Merci,
L'addin est également très utile
Re : Analyse des corrélations de cluster dans JMP ?Salut @Kyle ,
La carte thermique de corrélation dans Multivariate est basée uniquement sur la corrélation de Pearson. Si vous souhaitez créer une carte thermique des corrélations en utilisant une autre statistique (comme Tau ou Rho), vous devrez générer un tableau de corrélations comme je l'ai montré dans la vidéo que vous avez regardée. Pour le faire plus rapidement, vous pouvez utiliser un complément que j'ai écrit pour automatiser le processus : https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Correlate-Y-by-X-Add-In/ta-p/23628/
En ce qui concerne la modification de la technique de clustering, vous pouvez définir la méthode utilisée lorsque vous lancez Hierarchical Clustering depuis Analyze > Clustering dans la section des options en bas à gauche de la fenêtre de lancement. Une fois que vous avez généré le rapport de cluster, vous pouvez demander le clustering bidirectionnel à partir du triangle rouge, qui regroupera les variables utilisées dans votre analyse. Assembler toutes les pièces ensemble pour créer l'intrigue que vous avez jointe sera un processus quelque peu manuel - ma recommandation serait d'enregistrer chaque élément sous forme d'image à partir de JMP, puis de les assembler dans un programme graphique (ou même Powerpoint).
J'espère que cela vous aidera à démarrer !
@julien
