Ayuda con el diseño/análisis del protocolo de medidas repetidas.Hola,
Me estoy preparando para diseñar experimentos para mi protocolo de investigación y estoy tratando de elegir un modelo para analizar mis datos. A continuación se muestra mi configuración de diseño:
Variable de respuesta : frecuencia cardíaca
Factor aleatorio : sujeto
Factor fijo : tratamiento (control, tratamiento A, tratamiento 
Objetivo : determinar los efectos estadísticamente significativos de los factores/interacción que se desvían de la frecuencia cardíaca inicial
Protocolo:
- Registre la frecuencia cardíaca inicial durante 60 minutos antes de la administración del tratamiento.
- Registre la frecuencia cardíaca durante 20 minutos durante los 20 minutos de administración del tratamiento
- Registre la frecuencia cardíaca durante 60 minutos después de la administración del tratamiento.
Estoy confundido porque hay una variedad de enfoques utilizados en la literatura y parece haber consejos contradictorios en línea con respecto al análisis de datos de medidas repetidas. He leído sobre los principales beneficios de utilizar un modelo lineal mixto generalizado (GLMM) en lugar de un ANOVA de medidas repetidas. Estoy un poco atascado con la aplicación práctica de este GLMM con datos recopilados mediante mi protocolo.
Estaba pensando en promediar la frecuencia cardíaca registrada en intervalos de 5 minutos, lo que me daría 12 puntos de datos iniciales, 4 durante el tratamiento y 12 puntos de datos posteriores al tratamiento por sujeto. No hay rima o razón real por la que elegí 5 minutos. La mayor parte de la literatura normaliza la frecuencia cardíaca de los sujetos en los primeros 5 minutos (%) antes de analizar, pero estoy cansado de hacer esto porque no permite comparaciones de los niveles de frecuencia cardíaca de un sujeto a otro.
Ahora estoy un poco estancado y no sé cómo proceder ni entender qué tipo de modelo tengo.
Con la esperanza de que haya alguien familiarizado con este tipo de protocolo que pueda echar una mano.
Cualquier ayuda es muy apreciada.
Gracias,
J.P.
Modelado estadístico avanzadoInvestigación de Consumidores y MercadosRe: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.¡Gracias por tu ayuda!
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.No, no lo hace. RE y la estructura repetida representan dos fuentes diferentes de variación. Sin embargo, para ciertas estructuras repetidas como UN, RE ya no se puede estimar: aparecerá un mensaje de error si intenta hacerlo. AR (1) trabaja con un efecto de sujeto aleatorio.
El orden del tiempo no importa para la ONU.
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Hay dos niveles de tratamiento (A = dosis baja, B = dosis alta).
Basado en el ejemplo de Cholesterol Stacked.jmp, así es como creo que necesito configurar mi conjunto de datos y análisis:
- Plataforma : Modelo de ajuste
- Personalidad : Modelo Mixto
- Y, Respuesta : Frecuencia cardíaca (lpm) -> continua
- Efectos fijos : Tratamiento., Time Region, Reg. Inst. -> todo categórico
Debajo de la pestaña Estructura repetida si quiero usar 'No estructurado':
- Tema : Tema
- Repetido : Tiempo Reg./Inst. Concat -> categórico
Bajo la pestaña Estructura repetida si quiero usar 'AR (1)':
- Tema : Tema
- Repetido : Tiempo (min) -> continuo
| Sub. | Tratar. | Región del tiempo | Reg. Inst. | Tiempo Reg./Inst. Concat | Tiempo (min) | Frecuencia cardíaca (lpm) |
| 1 | UNA | Tratamiento previo | 1 | Pre-Tratamiento_1 | 0 | 62 |
| 1 | UNA | Tratamiento previo | 2 | Tratamiento previo_2 | 5 | 60 |
| 1 | UNA | Durante el tratamiento | 1 | Durante el tratamiento_1 | 10 | 64 |
| 1 | UNA | Durante el tratamiento | 2 | Durante_Tratamiento_2 | 15 | 67 |
| 1 | UNA | Postoperatorio | 1 | Post-Tratamiento_1 | 20 | sesenta y cinco |
| 1 | UNA | Postoperatorio | 2 | Post-tratamiento_2 | 25 | 64 |
| 2 | segundo | Tratamiento previo | 1 | Pre-Tratamiento_1 | 0 | 71 |
| 2 | segundo | Tratamiento previo | 2 | Tratamiento previo_2 | 5 | 72 |
| 2 | segundo | Durante el tratamiento | 1 | Durante el tratamiento_1 | 10 | 78 |
| 2 | segundo | Durante el tratamiento | 2 | Durante el tratamiento_2 | 15 | 76 |
| 2 | segundo | Postoperatorio | 1 | Post-Tratamiento_1 | 20 | 76 |
| 2 | segundo | Postoperatorio | 2 | Post-tratamiento_2 | 25 | 75 |
| ... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
¿El campo de asunto "Estructura repetida" hace mi "Sub"? ¿Desea un efecto aleatorio o necesita especificarlo en la pestaña 'Efectos aleatorios'? Además, al usar la opción 'no estructurado', ¿cómo sabe el modelo el orden de cada punto de tiempo si la columna 'Tiempo (min)' no se usa para ese caso?
¡Gracias!
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.¿Cuántos niveles de tratamiento? Para los niveles de Grupo de tiempo, deben ser como pre-1, pre_2, while_1, durante _2, ..., etc. Echa un vistazo a los datos de muestra, Cholesterol Stacked.jmp, que se utiliza en el ejemplo de medidas repetidas de la documentación JMP. Esos datos son similares en formato y diseño a los suyos.
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Gracias, definitivamente voy a revisar el texto.
Entonces, para resumir, una versión de muestra simplificada de mis datos apilados tendría el siguiente aspecto:
| Sub. | Tratar. | Grupo de tiempo | Tiempo desde el primer punto de datos (min) | Frecuencia cardíaca (lpm) |
| 1 | UNA | Tratamiento previo | 0 | 62 |
| 1 | UNA | Tratamiento previo | 5 | 60 |
| 1 | UNA | Durante el tratamiento | 10 | 64 |
| 1 | UNA | Durante el tratamiento | 15 | 67 |
| 1 | UNA | Postoperatorio | 20 | sesenta y cinco |
| 1 | UNA | Postoperatorio | 25 | 64 |
| 2 | segundo | Tratamiento previo | 0 | 71 |
| 2 | segundo | Tratamiento previo | 5 | 72 |
| 2 | segundo | Durante el tratamiento | 10 | 78 |
| 2 | segundo | Durante el tratamiento | 15 | 76 |
| 2 | segundo | Postoperatorio | 20 | 76 |
| 2 | segundo | Postoperatorio | 25 | 75 |
| ... | ... | ... | ... | ... |
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Deberá crear una columna de tiempo (por ejemplo, 0, 10, 20, 30, etc.). Junto con una columna de identificación del sujeto, los dos identifican de forma única cada medición de la frecuencia cardíaca. Y estas dos columnas de ID son necesarias cuando especifica una estructura repetida. (Nota: para AR (1), la columna Tiempo debe definirse como continua. Para otros, es categórico. Consulte la sección "Requisitos de la estructura de covarianza repetida" http://www.jmp.com/support/help/13/Fit_Model_Launch_Window_2.shtml#999895 .
También deberá crear una columna de tratamiento de tres niveles por separado para utilizarla como efecto fijo.
Finalmente, además de la documentación de JMP, recomiendo este libro. https://www.sas.com/storefront/aux/en/spmixedmodel/59882_toc.pdf . El capítulo 5 trata sobre el análisis de medidas repetidas.
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Dado que cada una de las 30 medidas de respuesta es efectivamente un resumen (promedio) de cada ventana de 5 minutos, podría condensar esto para resumir en ventanas de 10 minutos para reducir la cantidad de puntos de datos, pensé que buscaré las estructuras de Exchange y AR1.
Como una pregunta más precisa, ¿necesito crear una columna para 'Time Group' donde tenga tres niveles posibles: 'pre-tratamiento', 'durante el tratamiento' y 'post-tratamiento', y usar esto como un factor en mi modelo mixto?
La razón por la que pregunto es porque estos tipos de estudios generalmente tienen un punto de datos de respuesta de tiempo cero justo antes de que se administre el tratamiento y luego todos los puntos de datos siguientes se consideran tiempo después del tratamiento. En mi caso, mi tratamiento se administra de forma continua durante 30 minutos antes de que se detenga, por lo que también es necesario definir un período de tiempo "durante el tratamiento".
¡Gracias!
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.1. Podría transformar todas las mediciones a medida que las diferencias (o como% de los cambios) de "tiempo en cero". Si la transformación se debe guiar en parte por los objetivos de su estudio.
2. La información de las medidas repetidas se utiliza para estimar los efectos del tratamiento que incluirá en su modelo, así como la estructura repetida. Como precaución, ya que ha registrado 30 puntos de respuesta, puede haber demasiados parámetros de varianza-covarianza para estimar estructuras como la ONU. Le sugiero que comience con Intercambiable o AR (1).
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Hola jian
Gracias por su respuesta. Literalmente, acabo de ver tu tutorial JMP Pro Mixed Model para ver medidas repetidas antes de volver a revisar esta discusión. Fueron muy útiles.
Como seguimiento, tengo dos preguntas:
1) ¿Es mejor que la variable de respuesta (frecuencia cardíaca) se mantenga en su forma original para realizar este análisis de modelo mixto o se puede normalizar la frecuencia cardíaca (dentro del sujeto a lo largo del tiempo) como un cambio porcentual con respecto al tiempo cero o la diferencia? ¿Desde el tiempo cero antes de ejecutar el análisis? Mi instinto me dice que la normalización probablemente no sea una buena idea ya que no permite la comparación entre sujetos, pero tengo curiosidad por su opinión.
2) En mi caso, cada sujeto tiene 30 puntos de datos de respuesta medidos en el tiempo dentro de tres grupos de tiempo ordenados, a saber: pre-infusión de tratamiento (12 puntos de datos), durante el tratamiento de infusión (6 puntos de datos) y post-infusión de Tratamiento (12 puntos de datos). ¿Cómo puedo agregar esta información a la plataforma de modelo mixto?
¡Gracias!
Re: Ayuda con diseño / análisis de protocolo de medidas repetidas.Dada tu variable de respuesta, frecuencia cardíaca, es continuo, comenzaría el análisis con modelos lineales mixtos, que está disponible en JMP Pro ( Analizar => Ajustar modelo y elige Modelo mixto como Personalidad ). Los datos deben estar en un formato alto, es decir, cada observación se identifica mediante las columnas Asunto y Hora.
En el Modelo mixto JMP se puede especificar un efecto de sujeto aleatorio mediante la pestaña Efectos aleatorios, mientras que las correlaciones entre las medidas repetidas se manejan mediante la pestaña Estructura repetida. Por supuesto, use la pestaña Efectos fijos para especificar efectos fijos como el tratamiento, etc.
Con JMP Pro 13 hay muchas estructuras de varianza-covarianza diferentes para elegir. Probaría con varios y evaluaría los modelos adecuados antes de decidir cuál es la "mejor" estructura. Para más información, consulte la documentación. http://www.jmp.com/support/help/13/Fit_Model_Launch_Window_2.shtml#999895
