Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola usuarios de JMP,
Soy novato en JMP y necesito ejecutar el análisis de medidas repetidas con ANOVA a partir de datos sin procesar en JMP. Por ejemplo, dados los siguientes datos:
Sujeto Prueba1 Prueba2 Prueba3 Prueba4
1 8 5 7 9
2 3 2 5 6
3 1 0 4 3
4 5 2 6 6
5 2 3 8 5
6 9 10 8 10
7 10 7 9 10
8 2 4 7 2
9 10 3 4 6
10 0 1 3 5
donde cada sujeto fue sometido a esas pruebas en diferentes puntos de tiempo, ¿cómo puedo analizarlo?
Si es posible, dígame los pasos en JMP para obtenerlo, por favor.
Gracias de antemano.
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarPara un MANOVA, cualquier variable en la sección de efectos del modelo se trata como una variable entre sujetos. Para un enfoque de modelo mixto, las variables entre sujetos se especifican en la sección de efectos del modelo y luego el sujeto se marca como anidado dentro de las variables entre sujetos (como una forma de decirle a JMP que los niveles particulares de la variable sujeto, es decir, individuos, se miden en un solo nivel particular de la variable entre sujetos).
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarExcelente, @Julian ! ¡Pensé que la variable Sujeto se habría considerado como un sujeto intermedio si estuviera solo entre paréntesis! ¡Entonces, esa es otra forma de tener un sujeto intermedio (está solo en ese diálogo)! ¡Gracias!
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola @Reinaldo ,
En respuesta a tu PD:
" PD: si agrego el sujeto en el cuadro de diálogo Construir efectos del modelo, la prueba de esfericidad de Mauchly cambia el valor, así como la estadística F. ¿Por qué no consideró el Sujeto como una variable dentro del sujeto en ese diálogo?"
Los enfoques multivariados para las medidas repetidas implican la formación de contrastes entre las observaciones repetidas, las observaciones que se encuentran en las columnas de su conjunto de datos dividido/amplio. La varianza del "sujeto" se maneja implícitamente mediante la formación de estos contrastes dentro del sujeto a lo largo de las columnas, por lo que la varianza del sujeto no necesita modelarse más. Si agrega sujeto en la sección de efectos del modelo cuando ejecuta un MANOVA, le está diciendo a jmp, esencialmente, que hay una variable entre sujetos con tantos niveles como sujetos tiene, y ha medido cada nivel solo una vez. Entonces, no es lo que quieres hacer. Una regla básica para recordar es que si tiene una variable para la cual solo tiene una fila de medidas por nivel en su tabla (como el tema en una tabla dividida/ancha), no debe usarla en los efectos de su modelo.
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola Rei,
El complemento se ejecutará sin problemas en JMP 10. Además, todo lo que hace el complemento es posible mediante el cuadro de diálogo Ajustar modelo, solo se necesita más trabajo para especificar todos los efectos del modelo y las interacciones con el efecto de sujeto aleatorio para modelos complicados. En la sección de detalles de la página del complemento, describo cómo el complemento genera los efectos del modelo; si no tiene el complemento, puede seguir esos pasos en el cuadro de diálogo Ajustar modelo para un modelo de cualquier complejidad. . Además, vale la pena señalar que el modelo generado por el complemento es solo uno de los muchos modelos mixtos posibles que podrían ser apropiados (los modelos mixtos son muy flexibles). La estructura de efectos aleatorios que elegí implementar es una que coincidirá con las medidas repetidas univariadas tradicionales para un diseño factorial (suponiendo que no falten datos). Como es el caso con la mayoría de las cosas, JMP puede hacer eso, mucho más; Le animo a que aprenda más sobre los modelos mixtos si descubre que a menudo está modelando datos de medidas repetidas.
@Julian
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola @Julian ¡Muchas gracias por su explicación didáctica y archivos! ¡Excelente!
Inicialmente, pensé que el sujeto debería agregarse a los efectos del modelo de construcción para ejecutar la prueba de esfericidad de Mauchly, pero cuando lo agregué, obtuve un resultado diferente de la prueba de esfericidad. Entonces, en este caso, no debo considerar el Sujeto como parte de mi análisis para la prueba de esfericidad, sino solo las variables de Prueba.
Además, cuando uso datos apilados, debo usar Mínimos cuadrados estándar en lugar de MANOVA porque solo tengo una variable dependiente. Sin embargo, cuando tengo datos divididos (una columna para cada variable de salida), debo usar MANOVA y el resultado será el mismo que antes.
¡Vi su video Análisis de diseños de medidas repetidas en JMP y es genial! Podría aprender más sobre cómo tabular los datos para obtener algunos pruebas multivariadas (prueba de GG, prueba de HF, traza de Pillai, lambda de Wilks, traza de Hotelling y raíz más grande de Roy).
Respecto al diseño Factorial de Medidas Repetidas, ¿funciona en JMP v.10? Además, ¿es posible hacer ese análisis sin ese complemento?
¡Gracias!
PD: si agrego el sujeto en el cuadro de diálogo Construir efectos del modelo, la prueba de esfericidad de Mauchly cambia el valor, así como la estadística F. ¿Por qué no consideró el Sujeto como una variable dentro del sujeto en ese diálogo?
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola @Reinaldo ,
Como otros han señalado, tiene la opción de analizar estos datos de diferentes maneras, un MANOVA (que también es donde encontrará medidas repetidas univariadas ajustadas y no ajustadas) o un modelo lineal de efectos mixtos. para producir el Prueba de esfericidad de Mauchly, deberá utilizar la personalidad MANOVA en Analizar > Ajustar modelo. Para esto, como notó, utilizará sus datos en forma amplia/dividida (conjunto de datos adjunto con script). Aquí está la configuración en Fit Model:
Luego, en el informe MANOVA, querrá construir una especificación de respuesta: haga clic en "Elegir respuesta" y seleccione "Medidas repetidas", y también marque la casilla para pruebas univariadas. Titula tu factor intra-sujeto como quieras:

En la parte inferior del informe, verá sus pruebas del efecto dentro del sujeto, así como la prueba de esfericidad de Mauchly. También puede especificar otros contrastes si lo desea aquí, pero es posible que disfrute más de la interfaz cuando utilice un enfoque de modelo mixto.
Para ajustar estos datos usando un modelo mixto, primero apile sus datos (conjunto de datos adjunto). A continuación, inicie Analizar > Ajustar modelo y coloque su respuesta como Y. A continuación, coloque la columna de asunto y la etiqueta (o como haya llamado a su factor cuando apiló) como efectos de modelo. Seleccione Sujeto en los efectos del modelo, luego haga clic en el triángulo rojo junto a los atributos y seleccione Aleatorio. Sujeto DEBE marcarse como nominal en su tabla de datos; de lo contrario, esto devolverá un análisis incorrecto. No necesita usar Nest en este caso: los sujetos solo se anidarían dentro de una variable entre sujetos, y en este ejemplo no tiene ninguno.
Cuando haga clic en Ejecutar, obtendrá lo que es un análisis equivalente (ya que no tiene datos faltantes) al resultado del análisis univariante no ajustado que encontró de la personalidad MANOVA.
Sin embargo, un beneficio de usar esta personalidad de modelado es que el Triángulo rojo junto a su factor (etiqueta en este caso) tiene opciones útiles adicionales, como realizar todas las comparaciones por pares, Tukey-HSD y contrastes personalizados de uno o varios grados de libertad. mediante un sencillo panel de control.
Para adaptarse a modelos de medidas repetidas más complicados, puede consultar el Complemento factorial completo de medidas repetidas , que también funciona para medidas repetidas unidireccionales como esta, pero como puede ver, no son demasiado difíciles de configurar.
¡Espero que esto ayude!
@Julian
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola a todos,
Seguí la solución anterior, pero desafortunadamente no sé por qué no funcionó.
Me gustaría analizar algunos asuntos en ANOVA unidireccional de medidas repetidas como
- Prueba de esfericidad de Mauchly,
- pruebas de efectos dentro de los sujetos,
- pruebas multivariadas (traza de Pillai, lambda de Wilks, traza de Hotelling y raíz más grande de Roy),
- contrastes (por ejemplo, nivel 1 (Test1) frente a nivel 2 (Test2), nivel 2 (Test2) frente a nivel 3 (Test3) y nivel 3 (Test3) frente a nivel 4 (Test4)) y
- comparaciones por pares.
Cuando usé Table => Stack, combiné todas las columnas de prueba en una sola y luego no pude ejecutar el procedimiento descrito en el capítulo "Ajuste de la especificación de respuesta de modelos de respuesta múltiple", similar al ejemplo de prueba univariada y de esfericidad (Dogs.jmp ), que indicó ejecutar MANOVA. Ciertamente, encontramos más de una variable independiente (es decir, drogas y dep1) en ese ejemplo (es decir, Perros.jmp), mientras que solo hay una (es decir, Sujeto) en esos datos sin procesar antes mencionados .
Además, después de leer la página sobre el ajuste de modelos lineales, como pude entender un poco sobre el significado de los corchetes en el cuadro de diálogo Construir efectos del modelo, cuando usa Sujeto [Prueba] implica que el predictor de prueba es una variable entre sujetos, ¿no? ¿No es así? Creo que la Prueba debería ser una variable dentro de los sujetos porque todos los Sujetos participan en esas pruebas. ¿Estoy en lo correcto?
En caso afirmativo, supongo que no puedo hacer el efecto anidado (es decir, Asunto[Prueba]), pero haz algo como Asunto*Prueba, ¿no?
Gracias de antemano.
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarSí, los corchetes indican un efecto anidado.
Esta página desde el Documentación en línea de JMP tiene información sobre la construcción de efectos para ajuste de modelos lineales .
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesar¡Gracias Jim y Marcos!
Entonces, antes de cualquier acción para analizar los datos, debo usar Table -> Stack para insertar mis datos. Inicialmente, importé los datos sin procesar de .sav y JMP naturalmente creó esas columnas para mí, como le dije anteriormente.
Por cierto, cuando usa la variable entre corchetes [ ], ¿significa que la variable es un sujeto interno (por ejemplo, Prueba)? ¿Dónde puedo encontrar más información sobre cómo administrar esas variables en ese cuadro de diálogo?
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarApile las columnas de datos Test1 a Test4 (Tabla > Apilar). Ahora siga las instrucciones en la Nota. Los datos apilados están en la función Y, la columna de etiqueta está en la función Efectos y el Sujeto es el efecto aleatorio.
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarUsar
Tablas==>Apilar
para poner todas sus columnas de prueba en una sola columna y luego ejecutar
Analizar==>Ajustar modelo
y configurar el cuadro de diálogo como

Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesar¡Gracias, Jeff!
Como mencioné anteriormente, parece que este ejemplo se describe en ese documento "Modelado y Métodos Multivariados", Sección "Modelo Multivariado con Medidas Repetidas"; sin embargo, no coincide con mis datos sin procesar dados porque es un caso de ANOVA unidireccional de medidas repetidas. ¿Tienes alguna idea de cómo analizarlo?
¡Gracias!
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarArreglé el enlace de arriba.Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola Tomás,
Gracias por responder a mi publicación. Hice clic en él, ¡pero parece que no se puede encontrar la página! 
Tengo un conocimiento elemental sobre JMP y cómo puedo analizar las medidas repetidas de los datos sin procesar anteriores. Eché un vistazo al manual de usuario (JMP v.10 ebook) llamado "Modelado y Métodos Multivariantes", Sección "
Modelo multivariante con medidas repetidas", ¡pero sentí algunas dificultades para transferir ese conocimiento de una muestra de datos (ejemplo) a mis datos sin procesar! Además, esos datos sin procesar no son un caso multivariado, sino un ANOVA unidireccional de medidas repetidas.
Mejor,
Reinaldo.
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarTomás,
El enlace de su página web está dando como resultado una página perdida
Re: Cómo ejecutar las medidas repetidas a partir de datos sin procesarHola Reinaldo
¿Conoces este artículo?: http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html ?
Saludos cordiales, Tomás