Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoSalve utenti JMP,
Sono un principiante in JMP e ho bisogno di eseguire l'analisi delle misure ripetute con ANOVA da dati grezzi in JMP. Ad esempio, dati i seguenti dati:
Soggetto Prova1 Prova2 Prova3 Prova4
18579
2 3 2 5 6
3 1 0 4 3
4 5 2 6 6
5 2 3 8 5
6 9 10 8 10
7 10 7 9 10
8 2 4 7 2
9 10 3 4 6
10 0 1 3 5
dove ogni soggetto è stato sottoposto a quei test in tempi diversi, come posso analizzarlo?
Se è possibile, dimmi i passaggi in JMP per ottenerlo, per favore!
Grazie in anticipo.
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoPer un MANOVA, qualsiasi variabile nella sezione degli effetti del modello viene trattata come una variabile tra soggetti. Per un approccio di modello misto, le variabili tra soggetti vengono specificate nella sezione degli effetti del modello e quindi il soggetto viene contrassegnato come nidificato all'interno delle variabili tra soggetti (come un modo per indicare a JMP che livelli particolari della variabile soggetto, ovvero, individui, sono misurati solo a un particolare livello della variabile tra soggetti).
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoGrande, @giuliano ! Ho pensato che la variabile Soggetto sarebbe stata considerata come un soggetto intermedio se fosse stata solo tra parentesi! Quindi, questo è un altro modo per avere un oggetto intermedio (è solo in quel dialogo)! Grazie!
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCIAO @Reinaldo ,
In risposta al tuo PS:
" PS: se aggiungo il soggetto nella finestra di dialogo Construct Model Effects, il test di sfericità di Mauchly cambia il valore così come la statistica F. Perché non hai considerato il Soggetto come una variabile all'interno del soggetto in quella finestra di dialogo?"
Gli approcci multivariati alle misure ripetute comportano la formazione di contrasti tra le osservazioni ripetute, le osservazioni che si trovano tra le colonne nel set di dati suddiviso/ampio. La varianza del "soggetto" viene gestita implicitamente formando questi contrasti all'interno del soggetto attraverso le colonne, quindi non è necessario modellare ulteriormente la varianza del soggetto. Se aggiungi il soggetto nella sezione degli effetti del modello quando esegui un MANOVA, stai essenzialmente dicendo a jmp che esiste una variabile tra soggetti con tanti livelli quanti sono i soggetti e hai misurato ogni livello solo una volta. Quindi, non quello che vuoi fare. Una regola di base da ricordare è che se hai una variabile per la quale hai solo una riga di misurazioni per livello nella tua tabella (come soggetto in una tabella divisa/larga) non dovresti usarla negli effetti del tuo modello.
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCiao Rei,
Il componente aggiuntivo verrà eseguito senza problemi in JMP 10. Inoltre, tutto ciò che fa il componente aggiuntivo è possibile utilizzando la finestra di dialogo Adatta modello, richiede solo più lavoro per specificare tutti gli effetti del modello e le interazioni con l'effetto soggetto casuale per modelli complicati. Nella sezione dei dettagli della pagina del componente aggiuntivo descrivo come il componente aggiuntivo genera gli effetti del modello: se non si dispone del componente aggiuntivo, è possibile seguire questi passaggi nella finestra di dialogo Adatta modello per un modello di qualsiasi complessità . Inoltre, vale la pena notare che il modello generato dal componente aggiuntivo è solo uno dei tanti possibili modelli misti che potrebbero essere appropriati (i modelli misti sono molto flessibili). La struttura dell'effetto casuale che ho scelto di implementare è quella che corrisponderà alle misure ripetute univariate tradizionali per un disegno fattoriale (supponendo che non vi siano dati mancanti). Come nel caso della maggior parte delle cose, JMP può farlo, molto di più; Ti incoraggio a saperne di più sui modelli misti se scopri che stai modellando spesso dati di misure ripetute.
@giuliano
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCIAO @giuliano grazie mille per la tua spiegazione didattica e i file! Eccellente!
Inizialmente, pensavo che il Soggetto dovesse essere aggiunto agli effetti del modello di costruzione per eseguire il test di sfericità di Mauchly, ma quando l'ho aggiunto, ho ottenuto un risultato diverso dal test di sfericità. Quindi, in questo caso non devo considerare Soggetto come parte della mia analisi per il test di sfericità, ma solo le variabili Test.
Inoltre, quando utilizzo i dati in pila, dovrei utilizzare i minimi quadrati standard anziché MANOVA perché ho solo una variabile dipendente. Tuttavia, quando ho dati divisi (una colonna per ogni variabile di output), dovrei usare MANOVA e il risultato sarà lo stesso di prima.
Ho guardato il tuo video Analysis of Repeated Measures Designs in JMP ed è fantastico! Potrei saperne di più su come tabulare i dati per ottenerne alcuni test multivariati (test GG, test HF, traccia di Pillai, lambda di Wilks, traccia di Hotelling e radice più grande di Roy).
Per quanto riguarda il design Factorial Repeated-Measures, funziona in JMP v.10? Inoltre, è possibile eseguire tale analisi senza tale componente aggiuntivo?
Grazie!
PS: se aggiungo il soggetto nella finestra di dialogo Construct Model Effects, il test di sfericità di Mauchly cambia il valore così come la statistica F. Perché non hai considerato l'oggetto come una variabile all'interno del soggetto in quella finestra di dialogo?
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCIAO @Reinaldo ,
Come altri hanno sottolineato, hai la possibilità di analizzare questi dati in diversi modi, un MANOVA (che è anche il luogo in cui troverai misure ripetute univariate aggiustate e non aggiustate) o un modello di effetti misti lineare. Per produrre il Mauchly's Test of Sphericity, dovrai usare la personalità MANOVA in Analizza > Adatta modello. Per questo, come hai notato, utilizzerai i tuoi dati in formato wide/split (set di dati allegato con script). Ecco la configurazione in Fit Model:
Quindi, nel rapporto MANOVA, vorrai costruire una specifica di risposta: fai clic su "Scegli risposta" e seleziona "Misure ripetute" e seleziona anche la casella per i test univariati. Intitola il tuo fattore all'interno del soggetto come preferisci:
In fondo al rapporto vedrai i tuoi test dell'effetto all'interno del soggetto, così come il test di sfericità di Mauchly. Puoi anche specificare altri contrasti se lo desideri qui, ma potresti apprezzare di più l'interfaccia quando usi un approccio di modello misto.
Per adattare questi dati utilizzando un modello misto, impila prima i dati (set di dati allegato). Quindi, avvia Analizza> Adatta modello e posiziona la tua risposta come Y. Successivamente, posiziona la colonna del soggetto e l'etichetta (o come hai chiamato il tuo fattore quando hai impilato) come effetti del modello. Seleziona Soggetto negli effetti del modello, quindi fai clic sul triangolo rosso accanto agli attributi e seleziona Casuale. Soggetto DOVERE essere contrassegnato come nominale nella tabella dei dati, altrimenti restituirà un'analisi errata. Non è necessario utilizzare Nest in questo caso: i soggetti sarebbero nidificati solo all'interno di una variabile tra soggetti e in questo esempio non ne hai.
Quando fai clic su Esegui, otterrai un'analisi equivalente (poiché non hai dati mancanti) all'output dell'analisi univariata non aggiustata che hai trovato dalla personalità MANOVA.
Tuttavia, uno dei vantaggi dell'utilizzo di questa personalità di modellazione è che il triangolo rosso accanto al tuo fattore (etichetta in questo caso) ha opzioni utili aggiuntive, come l'esecuzione di tutti i confronti a coppie, Tukey-HSD e contrasti personalizzati a grado singolo e multi-grado di libertà utilizzando un semplice pannello di controllo.
Per adattare modelli di misure ripetute più complicati, potresti controllare il file Componente aggiuntivo per misure ripetute fattoriali complete , che funziona anche per misure ripetute unidirezionali come questa, ma come puoi vedere non sono troppo difficili da impostare.
Spero che aiuti!
@giuliano
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCiao a tutti,
Ho seguito la soluzione di cui sopra, ma purtroppo non so perché non ha funzionato.
Mi piacerebbe analizzare alcune questioni in ANOVA a misure ripetute unidirezionali come
- Prova di sfericità di Mauchly,
- test degli effetti all'interno dei soggetti,
- test multivariati (traccia di Pillai, lambda di Wilks, traccia di Hotelling e radice più grande di Roy),
- contrasti (ad esempio, livello 1 (Test1) vs livello 2 (Test2), livello 2 (Test2) vs livello 3 (Test3) e livello 3 (Test3) vs livello 4 (Test4)) e
- confronti a coppie.
Quando ho utilizzato Table => Stack, ho combinato tutte le colonne Test in una sola e quindi non ho potuto eseguire la procedura descritta nel capitolo "Fitting Multiple Response Models Response Specification", simile all'esempio di test univariato e sfericità (Dogs.jmp ), che indicava di eseguire MANOVA. Certamente, in quell'esempio troviamo più di una variabile indipendente (ad esempio, drugs e dep1) (ad esempio, Dogs.jmp), mentre ce n'è solo una (ad esempio, Subject) in quei dati grezzi di cui sopra .
Inoltre, dopo aver letto la pagina sull'adattamento di modelli lineari, dato che ho potuto capire un po' il significato delle parentesi nella finestra di dialogo Costruisci effetti modello, quando si usa Soggetto[Test] implica che il predittore del test è una variabile tra soggetti, non vero? Penso che il test dovrebbe essere una variabile all'interno dei soggetti perché tutti i soggetti partecipano a quei test. Ho ragione?
Se sì, suppongo di non poter fare l'effetto annidato (cioè, Soggetto[Test]), ma fai qualcosa come Soggetto*Test, no?
Grazie in anticipo.
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoSì, le parentesi indicano un effetto nidificato.
Questa pagina dal Documentazione online di JMP ha informazioni sulla costruzione di effetti per montaggio di modelli lineari .
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoGrazie Jim e Marco!
Quindi, prima di qualsiasi azione per analizzare i dati, dovrei usare Tabella -> Stack per inserire i miei dati. Inizialmente, ho importato i dati grezzi da .sav e JMP ha naturalmente creato quelle colonne per me come ti ho detto sopra.
A proposito, quando usi la variabile tra parentesi [ ], significa che la variabile è un soggetto interno (ad esempio, Test)? Dove posso trovare maggiori informazioni su come gestire quelle variabili in quella finestra di dialogo?
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoImpilare le colonne di dati da Test1 a Test4 (Tabella > Stack). Ora segui le istruzioni nella nota. I dati in pila si trovano nel ruolo Y, la colonna dell'etichetta si trova nel ruolo Effetti e l'oggetto è l'effetto casuale.
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoUtilizzo
Tabelle==>Impila
per inserire tutte le colonne di test in un'unica colonna, quindi eseguire
Analizza==>Adatta modello
e impostare la finestra di dialogo come
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoGrazie, Jeff!
Come accennato in precedenza, sembra che questo esempio sia descritto in quel documento "Modellazione e metodi multivariati", sezione "Modello multivariato con misure ripetute"; tuttavia, non corrisponde ai miei dati grezzi perché si tratta di un caso di ANOVA a misure ripetute unidirezionale. Hai idea di come analizzarlo?
Grazie!
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoHo corretto il link sopra.Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCiao Tommaso,
Grazie per aver risposto al mio post. Ci ho cliccato sopra, ma sembra che la pagina non si trovi! 
Ho una conoscenza elementare di JMP e di come posso analizzare le misure ripetute da quei dati grezzi sopra. Ho dato un'occhiata al manuale dell'utente (ebook di JMP v.10) chiamato "Modellazione e metodi multivariati", sezione "
Modello multivariato con misure ripetute", ma ho sentito alcune difficoltà nel trasferire quella conoscenza da un dato campione (esempio) ai miei dati grezzi! Inoltre, quei dati grezzi non sono un caso multivariato, ma un'ANOVA a misure ripetute unidirezionale.
Migliore,
Rinaldo.
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoTommaso,
Il tuo collegamento alla pagina web si traduce in una pagina persa
Ri: Come eseguire le misure ripetute da un dato grezzoCiao Reinaldo
Sei a conoscenza di questo articolo: http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html ?
Cordiali saluti, Tommaso
