Mapa de calor, agrupación de filas.<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Hola a todos,
Gracias por tomarse el tiempo de leer mi pregunta.
Iré directamente a mi problema con JMP:
Tengo varios datos de concentración lipidómica de 10 ratones en condición A y 10 carnes picadas en condición B . Cada vez que intento generar el análisis de agrupamiento y el mapa de colores, JMP sigue reorganizando mis filas entonces mi condición A - ratones está mezclada con mi condición B - ratones.
Solo quiero un mapa de calor con mis 2 grupos en el eje Y: condición A y condición B. Y que cada columna correspondería a un lípido.
Puedo usar R para hacer esto pero realmente me gustaría usar JMP ya que es muy rápido de hacer.
Muchas gracias por su ayuda.
Re: Mapa de calor, agrupación de filasHola julián,
Soy nuevo en JMP.Este ejemplo está muy cerca de lo que estoy tratando de hacer. Quería ver el tutorial del generador de gráficos pero el enlace no funcionó.
Por favor ayuda.
Re: Mapa de calor, agrupación de filas¡Entiendo! Tendré que seguir usando Cell Plot para mis mapas de calor. Gracias
Re: Mapa de calor, agrupación de filas¡Gran pregunta! Aunque Graph Builder es más flexible en general, solo hay una función de color, por lo que solo puede usar una escala única y uniforme, a diferencia del gráfico de celdas que le permite tener escalas individuales para cada variable.
¡Excelente sugerencia para elaborar una guía para usar mapas de calor! Lo agregaré a la lista de guías de una página que haremos en el futuro. Si no ha visto la colección actual, puede encontrarla en jmp.com/learn
Julian
Re: Mapa de calor, agrupación de filasEntiendo el truco de usar la función Stack y luego usar Graph Builder.El resultado que obtuve usando su método es muy prometedor pero me pregunto cómo no escalar uniformemente el mapa de calor como puedo hacer con el gráfico celular (que sería en este ejemplo: una escala para cada medición temporal de la presión arterial).
Me siento como un principiante con JMP, pero también siento que hasta ahora me va bastante bien con la ayuda, la guía del usuario disponible y los tutoriales de Youtube. Pero no pude encontrar ninguna información sobre cómo crear estos mapas de calor antes de su respuesta. Creo que sería muy valioso que JMP escribiera algún tipo de ayuda oficial sobre esto, ya que los mapas de calor son extremadamente populares hoy en día.
Re: Mapa de calor, agrupación de filas¡Me alegro de poder ayudar!
En caso de que sea útil en el futuro, quería mostrarle cómo puede hacer este mismo gráfico usando Graph Builder (que es más flexible, pero requerirá que hagamos un poco de reestructuración). Aquí hay un video rápido de ese proceso (es sencillo, pero parece más complicado como una serie de pasos que en un video).
¡Espero que esto te ayude en el futuro!
Julian
Re: Mapa de calor, agrupación de filasHola julián,
¡Esto se parece exactamente a lo que quiero!
Muchas gracias por su ayuda.
También espero que ayude a otros.
Cuidarse,
tomás
Re: Mapa de calor, agrupación de filasHola thomasd ,
Creo que puede obtener lo que busca colocando Asunto y Dosis en la sección "Etiqueta", en lugar de poner Dosis en la sección "X, Agrupación".
Para obtener la escala uniforme, marque la casilla "Escalar uniformemente" antes de hacer clic en Aceptar.
¿Está esto más cerca de lo que quieres?
Julian
Re: Mapa de calor, agrupación de filasHola julián,
Muchas gracias por su apreciada respuesta.
El conjunto de datos de presión de la muestra de sangre es en realidad muy similar a mi caso. En este conjunto de datos, digamos que quiero hacer un mapa de calor de los datos de la fila 11 a la fila 20 (2 condiciones: Control/Placebo). Quiero en el mismo mapa de calor las 2 condiciones (es decir, Control para las primeras 5 filas y Placebo para las últimas 5 filas) y que cada columna es una condición de medición de la presión arterial con solo una escala única por columnas para las dos condiciones .
Por favor dígame si no estoy siendo claro.
Que tengas un buen domingo.
Re: Mapa de calor, agrupación de filasHola thomasd ,
Parece que estás ejecutando un Análisis de conglomerados jerárquico, ¿es así? Para ese análisis, las filas se reorganizan para formar la d endograma, por lo que necesitaremos hacer algo más para formar el gráfico que creo que desea.Si está buscando conservar el orden de sus filas y mostrar lipidómico concentración en a mapa de calor , quizás Gráfico > Gráfico de celda funcione para usted.
A continuación se muestra un ejemplo sencillo con el conjunto de datos de muestra de Big Class:
Y aquí hay un ejemplo más amplio que utiliza el conjunto de datos de muestra de presión arterial, con 4 niveles del factor experimental y 6 DV:
¿Se acerca eso a lo que estás buscando? Si no, ¿puedes proporcionar una imagen del amable ¿Qué trama estás buscando hacer? Estoy seguro de que podemos encontrar una manera de hacerlo con JMP.
¡Espero que esto ayude!
Julian
