ヒートマップ、行グループ化<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />こんにちは、みんな、
私の質問を読んでいただきありがとうございます。
JMP に関する問題に直接進みます。
私は 10 匹のマウスの脂質濃度データをいくつか持っています。状態Aそしてミンチを10個入れます状態B 。 クラスタリング分析とカラーマップを生成しようとするたびに、JMP は列を並べ替えていますつまり、私の状態 A のマウスと状態 B のマウスが混同されています。
Y 軸に条件 A と条件 B の 2 つのグループを含むヒートマップが必要です。 そして、各列は脂質に対応すると考えられます。
R を使用してこれを行うこともできますが、非常に迅速に実行できるため、JMP を使用したいと思っています。
ご助力ありがとうございます。
Re: ヒート マップ、行グループ化こんにちは、ジュリアンさん
JMP を初めて使用します。この例は、私がやろうとしていることに非常に近いです。 グラフビルダーのチュートリアルを見ようとしましたが、リンクが機能しませんでした。
助けてください。
Re: ヒート マップ、行グループ化わかった！ ヒートマップには Cell Plot を使い続ける必要があります。 ありがとう
Re: ヒート マップ、行グループ化素晴らしい質問です！ グラフ ビルダーは一般に柔軟性が高くなりますが、色の役割は 1 つだけであるため、変数ごとに個別のスケールを使用できるセル プロットとは異なり、単一の均一なスケールしか使用できません。
ヒート マップの使用に関するガイドをまとめた素晴らしい提案です。 今後作成する 1 ページのガイドのリストに追加します。 現在のコレクションをまだ見ていない場合は、jmp.com/learn で見つけることができます。
ジュリアン
Re: ヒート マップ、行グループ化Stack 機能を使用してから Graph Builder を使用するコツはわかりました。あなたの方法を使用して得られた結果は非常に有望ですが、どうですかヒートマップを均一に拡大縮小しない方法Cell Plot で行うことができるのと同様です (この例では、血圧の各時点の測定に 1 つのスケールが適用されます)。
私は JMP に関しては初心者のような気がしますが、ヘルプ、利用可能なユーザー ガイド、および Youtube チュートリアルを利用して、これまでのところかなりうまくやっていると感じています。 しかし、あなたの返信の前に、これらのヒートマップの作成に関する情報を見つけることができませんでした。 ヒートマップは現在非常に人気があるため、JMP がこれに関する何らかの公式ヘルプを作成することは非常に価値があると思います。
Re: ヒート マップ、行グループ化お役に立てて嬉しいです！
将来役立つ場合に備えて、グラフ ビルダーを使用してこれと同じプロットを作成する方法を説明したいと思います (グラフ ビルダーの方が柔軟性がありますが、少し再構築する必要があります)。 そのプロセスの簡単なビデオを次に示します (簡単ですが、一連の手順としてはビデオよりも複雑に見えます)。
これが将来役立つことを願っています。
ジュリアン
Re: ヒート マップ、行グループ化こんにちは、ジュリアンさん
これはまさに私が求めているものに見えます!
ご助力ありがとうございます。
また、他の人にも役立つことを願っています。
気をつけて、
トーマス
Re: ヒート マップ、行グループ化こんにちはトーマスド、
線量を「X、グループ化」セクションに入れるのではなく、件名と線量の両方を「ラベル」セクションに入れることで、探しているものが得られると思います。
均一なスケールを取得するには、「OK」をクリックする前に「均一にスケールする」チェックボックスをオンにします。
これはあなたが望むものに近いですか？
ジュリアン
Re: ヒート マップ、行グループ化こんにちは、ジュリアンさん
大変貴重なご返信をいただき、誠にありがとうございます。
血液サンプルの圧力データセットは、実際には私の場合と非常によく似ています。 このデータセットでは、行 11 から行 20 までのデータのヒートマップを作成したいとします (2 つの条件: コントロール / プラセボ)。 欲しい同じヒートマップ上で2 つの条件 (最初の 5 行は対照、最後の 5 行はプラセボ)、および各列は血圧測定の条件のみです。 2 つの条件に対する列ごとの 1 つの固有のスケール。
私が自分自身を明確にしていない場合は教えてください。
よい日曜日を。
Re: ヒート マップ、行グループ化こんにちはトーマスド、
を実行しているようですね階層的クラスター分析、そうですか？ その分析出力では、行が再配置されて d が形成されます。エンドログラムなので、私が望むグラフィックを形成するには別のことをする必要があります。行の順序を保持して表示したい場合リピドミック集中力あるヒートマップ、おそらく「グラフ > セルプロット」がうまくいきます。
Big Class サンプル データ セットを使用した簡単な例を次に示します。
そして、これは、4 つのレベルの実験因子と 6 つの DV を含む、血圧サンプル データセットを使用したより大きな例です。
それはあなたが探しているものに近いですか？ そうでない場合は、画像を提供していただけますか親切あなたが作りたいプロットのことは何ですか？ JMP を使ってそれを実現する方法がきっと見つかると思います。
お役に立てれば！
ジュリアン
