Mappa termica, raggruppamento di righe<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Ciao a tutti,
Grazie per aver dedicato del tempo a leggere la mia domanda.
Vado direttamente al mio problema con JMP:
Ho diversi dati sulla concentrazione lipidomica di 10 topi in condizione A e 10 tritati condizione B . Ogni volta che provo a generare l'analisi di clustering e la mappa dei colori, JMP mantiene riorganizzare le mie righe quindi la mia condizione A - topi è confusa con la mia condizione B - topi.
Voglio solo una mappa termica con sull'asse Y i miei 2 gruppi: condizione A e condizione B. E che ciascuna colonna corrisponderebbe a un lipide.
Posso usare R per farlo, ma mi piacerebbe davvero usare JMP perché è davvero veloce.
Grazie mille per il tuo aiuto.
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCiao Giuliano,
Sono nuovo in JMP.Questo esempio è molto vicino a quello che sto cercando di fare. Volevo visualizzare il tutorial del generatore di grafici ma il collegamento non funzionava.
Per favore aiuto.
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeFatto! Dovrò continuare a utilizzare Cell Plot per le mie mappe di calore. Grazie
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeOttima domanda! Anche se il Costruttore di grafici è più flessibile in generale, esiste un solo ruolo di colore, quindi puoi utilizzare solo una scala singola e uniforme, a differenza del grafico a celle che ti consente di avere scale individuali per ciascuna variabile.
Ottimo suggerimento su come mettere insieme una guida per l'utilizzo delle mappe di calore! Lo aggiungerò all'elenco delle guide di una pagina che realizzeremo in futuro. Se non hai visto la raccolta attuale, puoi trovarla su jmp.com/learn
giuliano
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCapisco il trucco sull'utilizzo della funzione Stack e quindi sull'utilizzo del Graph Builder.Il risultato che ho ottenuto utilizzando il tuo metodo è molto promettente, ma mi chiedo come non ridimensionare in modo uniforme la mappa di calore come posso fare con il diagramma cellulare (che in questo esempio sarebbe: una scala per ogni misurazione temporale della pressione sanguigna).
Mi sento un principiante con JMP, ma sento anche che finora me la sto cavando abbastanza bene con la Guida, la Guida per l'utente disponibile e i tutorial di YouTube. Ma non sono riuscito a trovare alcuna informazione su come creare queste mappe di calore prima della tua risposta. Penso che sarebbe molto utile per JMP scrivere una sorta di aiuto ufficiale al riguardo poiché le mappe di calore sono estremamente popolari al giorno d'oggi.
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeSono contento di aver potuto aiutare!
Nel caso in cui ti sia utile in futuro, volevo mostrarti come creare lo stesso grafico utilizzando il Costruttore di grafici (che è più flessibile, ma richiederà una piccola ristrutturazione). Ecco un breve video di questo processo (è semplice, ma sembra più complicato come una serie di passaggi che in un video).
Spero che questo ti aiuti in futuro!
giuliano
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCiao Giuliano,
Questo assomiglia esattamente a quello che voglio!
Grazie mille per il tuo aiuto.
Spero anche che possa aiutare gli altri.
Occuparsi,
Tommaso
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCIAO Tommaso ,
Credo che tu possa ottenere ciò che stai cercando inserendo sia Oggetto che Dose nella sezione "Etichetta", anziché inserire Dose nella sezione "X, Raggruppamento".
Per ottenere la scala uniforme, seleziona la casella "Scala uniformemente" prima di fare clic su OK.
È più vicino a quello che vuoi?
giuliano
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCiao Giuliano,
Grazie mille per la tua apprezzatissima risposta.
Il set di dati sulla pressione del campione di sangue è in realtà molto simile al mio caso. In questo set di dati, diciamo che voglio creare una mappa termica dei dati dalla riga 11 alla riga 20 (2 condizioni: Controllo/Placebo). Voglio sulla stessa mappa termica le 2 condizioni (quindi Controllo per le prime 5 righe e Placebo per le ultime 5 righe) e che ciascuna colonna sia una condizione di misurazione della pressione arteriosa con solo una scala unica per colonne per le due condizioni .
Per favore ditemi se non sono stato chiaro.
Buona domenica.
Ri: Mappa termica, raggruppamento di righeCIAO Tommaso ,
Sembra che tu stia eseguendo un analisi dei cluster gerarchici, giusto? Per l'output dell'analisi, le righe vengono riorganizzate per formare il d endrogramma, quindi dovremo fare qualcos'altro per formare la grafica che penso tu voglia.Se stai cercando di preservare l'ordine delle righe e show lipidomico concentrazione dentro UN mappa di calore , forse Grafico > Grafico celle funzionerà per te.
Ecco un semplice esempio con il set di dati di esempio Big Class:
Ed ecco un esempio più ampio che utilizza il set di dati di esempio della pressione sanguigna, con 4 livelli del fattore sperimentale e 6 DV:
Si avvicina a quello che stai cercando? In caso contrario, puoi fornire un'immagine del file Tipo della trama che stai cercando di realizzare? Sono sicuro che possiamo trovare un modo per farcela con JMP.
Spero che questo ti aiuti!
giuliano
