JMP에서 Permanova 사용<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />안녕,
저는 Qiime 대신 JMP에서 PERMANOVA를 실행하여 다양한 요인에 따라 다양한 미생물 샘플 간의 커뮤니티 구성 차이를 살펴보려고 합니다. 가능하다면 JMP에서 PCoa 도표를 작성하는 방법도 배우고 싶지만 이는 부차적인 사항입니다.
감사합니다!
답: JMP에서 Permanova 사용이에 대한 움직임이 있나요? JMP에 익숙하므로 사용하고 싶지만 영구 변수를 실행해야 합니다...
답: JMP에서 Permanova 사용이 토론에 걸림돌이 되는 사람은 누구나 위시리스트에서 해당 항목에 투표하는 것을 고려할 수 있습니다. PERMANOVA 및 PERMDISP
감사해요,
-남자
답: JMP에서 Permanova 사용PERMANOVA 및 ANOSIM을 수행하기 위해 PRIMER(PC 전용)를 실행하기 위해서만 병렬 운영 체제를 실행해야 하는 사람으로서 저는 이 기술을 향후 JMP 릴리스에 구현하도록 강력히 권장합니다! 나는 이것을 실현하기 위한 모든 주요 요소가 이미 준비되어 있다고 생각합니다.
답: JMP에서 Permanova 사용Chris에게 감사합니다. 지금 그렇게 했고 그것이 견인력을 얻길 바랍니다.
정말 고마워요, 마르크스
답: JMP에서 Permanova 사용이 두 가지 방법은 아직 JMP에서 구현되지 않았습니다. 다른 사람들이 투표(쿠도)할 수 있도록 위시 리스트에 추가하세요. 이는 개발자가 다음 버전의 기능 우선순위를 정하는 데 도움이 될 것입니다.
위시리스트 링크는 다음과 같습니다.
https://community.jmp.com/t5/JMP-Wish-List/idb-p/jmp-wish-list
나는 이 두 가지를 이 목록에 포함시키는 것이 좋을 것이라는 데 동의합니다.
최상의,
크리스 커치버그
답: JMP에서 Permanova 사용2 년 후. 응답 없음?
PERMANOVA와 ANOSIM은 미생물군집 분야의 주력 제품입니다. JMP에 있어야 합니다.
답: JMP에서 Permanova 사용고마워요 이안님,
저는 Qiime 대신 JMP에서 PERMANOVA를 실행하여 다양한 요인에 따라 다양한 미생물 샘플 간의 커뮤니티 구성 차이를 살펴보려고 합니다. 제가 테스트하고 싶은 대부분의 요인은 명목변수와 순서변수입니다.
Ex- 모유를 먹는 유아의 미생물 군집은 연령에 따라 분유를 먹는 유아와 공동체 구성이 다른가요?
수유 변수에는 "유방", "분유", "혼합물"의 세 가지 명목 범주가 있고, 연령 그룹 변수에는 4가지 수준(0-3개월, 4~7개월, 8~11개월 또는 12개월 이상). 특히 모유 수유 영아(0~3개월)가 같은 연령층의 분유 수유 영아와 다른지 테스트하고 싶습니다.
또 다른 변수는 가정 청결도 0-2의 서열 척도입니다.
가능하다면 유사성 분석(ANOSIM)도 테스트해보고 싶습니다.
답: JMP에서 Permanova 사용JMP에는 다음과 직접 비교할 수 있는 것이 아무것도 내장되어 있지 않습니다. http://qiime.org/scripts/compare_categories.html (적어도 자세하게는 아닙니다.) 그러나 변수에 대해 좀 더 자세히 설명할 수 있다면 사람들이 JMP 기능을 어떻게 사용할 수 있는지 제안해 줄 것이라고 확신합니다. JMP의 스크립팅 언어를 사용하면 다양한 '추가' 작업이 가능하지만 그것부터 시작하지는 않겠습니다.
