Rapport de lettres vs rapport de différences. Sont-ils différents ?Salut,
J'utilise un modèle mixte avec JMP et je viens de voir que les lettres d'une table tukey ne correspondent pas à leurs valeurs p du rapport de différences. Je joins une capture d'écran à ce sujet. Le rapport de différence JMP correspond également au rapport Tukey-Kramer de SAS, mais la table Tukey de JMP ne correspond à rien. S'il vous plaît, j'ai besoin d'aide pour comprendre ce qui se passe ici et pour savoir si je dois utiliser l'un de ces tests de séparation.
Merci,
Cristian
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Marque,
Le rapport de lettre a été corrigé à l'aide de la nouvelle version (JMP 13.2.1). Maintenant, cela a du sens.
Merci beaucoup.
Cristian Collado
NCSU
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Je suis désolé que vous ressentiez cela. Nous disposons d'un contrôle qualité efficace, mais pas parfait, pour tous les produits SAS. Ce problème a malheureusement échappé à nos tests internes mais il a été découvert sur le terrain par un utilisateur, il a été signalé, et il a été corrigé. Cet exemple est la raison pour laquelle nous encourageons les utilisateurs à signaler les problèmes ici ou directement au support technique comme vous l'avez fait afin que nous en soyons informés et puissions les résoudre. Cet exemple est la raison pour laquelle nous encourageons les utilisateurs à mettre à jour leur logiciel vers la dernière version de maintenance.
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Ce n'est pas cool.
Vous savez à quel point il est grave que l’un des principaux (ou les principaux) outils statistiques se soit (est) trompé. Cela pourrait être très mauvais pour SAS.
Je le mettrai à jour et je vous le ferai savoir.
Merci pour votre aide
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?JMP sépare les informations pour vous. L'ANOVA concerne l'ensemble du modèle. Les tests d'effet concernent chaque terme du modèle. Les estimations de paramètres concernent chaque niveau de chaque terme. Le rapport de différences qui utilise des lettres de connexion ne doit pas être utilisé dans JMP Pro 13.0, mais les autres rapports ne posent aucun problème.
La transformation des variables entraîne souvent une simplification du modèle. Les non-linéarités et même certaines interactions peuvent ne plus être nécessaires après l'utilisation de certaines transformations.
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Cette différence a déjà été signalée et il s'agit donc d'un bug connu. Ce problème a été corrigé dans la version de maintenance de JMP 13.2, une mise à jour le corrigerait donc pour vous.
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Marque,
La version JMP est Pro 13.0.0.
Oui, mon plus gros problème concerne le tableau (différences par lettres) car si ce tableau est erroné, je devrai revérifier tous mes nouveaux et anciens résultats. Je ne veux pas y penser.
Bien que le rapport sur les différences ne montre pas et que l'interaction entre les lumières et les produits chimiques et l'ANOVA indiquent qu'il y a une interaction, dans ce cas, les différents rapports devraient être plus corrects car l'ANOVA ne montre pas d'interaction si j'utilise des données transformées (Log ). Est-ce que ça a du sens?
Merci beaucoup,
Cristian
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Salut Cameron,
Oui, « Oui » et « Non » sont différents. Je comprends aussi pourquoi c'est bizarre et à quel point cela va être difficile d'expliquer qu'il y a plus de puissance dans l'intrigue divisée que dans l'intrigue principale. Mais là où j'ai besoin d'aide pour comprendre, c'est avec l'interprétation des différents résultats JMP car l'ANOVA dit qu'il y a une interaction entre « Lumière » (contrôle, hps et B6) et « Chimique » (oui/non) et le rapport sur les différences ne montre que les différences entre « oui » et « non ».
De plus, je comprends d'après le tableau qu'il existe des différences entre B6-oui (D) et contrôle-oui (C,E) et HPS-oui (B,C), ce qui aurait plus de sens avec l'interaction dans l'ANOVA. Le tableau indique que « les niveaux non reliés par la même lettre sont significativement différents ». Ai-je une mauvaise interprétation de ce tableau ?
Merci,
Cristian
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Quelle version de JMP utilisez-vous ? Merci!
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Merci d'avoir partagé la sortie SAS avec la sortie JMP.
J'ai confirmé que les deux ensembles de résultats sont identiques, mais veuillez noter que :
- l'ordre de la liste n'est pas le même
- certaines estimations sont de signe opposé, mais cette différence n’affecte pas la signification
- JMP signale la valeur p ajustée (pour des comparaisons multiples) mais l'appelle valeur p, tandis que SAS rapporte séparément la valeur p et la valeur p ajustée.
Il existe cependant, comme vous l'avez noté et je l'ai confirmé précédemment, une divergence dans les résultats JMP entre la valeur p et le rapport des lettres de connexion pour deux paires.
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Merci pour ton aide Marc !
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Bien sûr, voici la table et le modèle SAS (split-plot avec sous-échantillons et blocs).
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?Salut @Cristian ,
Bienvenue dans la communauté !
Je n'en ai vérifié que quelques-uns, mais je ne vois aucune incohérence.Le rapport sur les lettres de connexion est construit de telle sorte que les niveaux partageant un niveau ne présentent pas de différence statistiquement significative.Puisqu'il n'y a que 3 comparaisons statistiquement significatives dans le tableau, il est facile de vérifier qu'elles correspondent.Par exemple, « HPS, non » et « HPS, oui » ont une valeur p < 0,001.Dans le rapport des lettres de connexion, « HPS, non » comporte les lettres ADE et « HPS, oui » comporte les lettres « B C ».Puisqu’aucune de ces lettres ne correspond, le tableau et les lettres sont cohérents.Il en va de même pour "B6_G5_R89,no" vs "B6_G5_R89, oui" et "Contrôle, non" vs "Contrôle, oui".
Je dois admettre qu’il s’agit du rapport de lettres de connexion le plus inhabituel que j’ai vu. La raison est la norme. l'erreur pour toutes les autres comparaisons est de 5,023. Notez que si les niveaux comparés contiennent le même produit chimique, l’erreur type n’est que de 0,932 ? Comment sont structurées vos données ?Est-ce une expérience de split plot par hasard ?
*Edit : Bon oeil Mark pour repérer ces incohérences.
Re : Rapport de lettres et rapport de différences. Sont-ils différents ?J'ai trouvé deux écarts entre le rapport sur les lettres de connexion (LSMeans Differences Tukey HSD) et les valeurs p dans le rapport par paire :
- HPS, oui (B, C) versus B6_G5_R89, oui (D) ne se connectent pas mais la valeur p est de 0,7579.
- Contrôle, oui (C, E) versus B6_G5_R89, oui (D) ne se connecte pas mais la valeur p est de 0,9999.
En avez-vous trouvé d'autres ?
Je ne suis pas sûr de ce que vous entendez par "mais la table Tukey de JMP ne correspond à rien". Souhaitez-vous également publier une photo de la sortie SAS correspondante pour clarifier ?
Ce problème peut nécessiter l'attention du support technique JMP (support@jmp.com).
