ユーザー定義の方程式を使用して距離行列を作成するこんにちは、
コミュニティ データの類似度/非類似度の距離行列を作成しようとしています。特定の方程式 (Bray-Curtis) を使用して値のマトリックスを作成したいと思います。値は、複数のプロット間の複数の種の存在量の類似性を示します。階層クラスタリングを使用して JMP で距離行列を作成する方法は知っていますが、独自の方程式を使用して同様のコマンドを実行する方法がわかりません。それを行うためのツールはありますか、またはそのためのスクリプトをどのように作成しますか?
Re: ユーザー定義の方程式を使用して距離行列を作成するハイ、ハァッ!
あなたが望むものは何でも、スクリプトで実現できます。JSLがあなたを自由にします!
そのためのスクリプトの書き方については、コンピューターのキーボードをお勧めします。
ただし、真剣に、スクリプトの作成に取りかかる前に、いくつかのことを検討する必要があります。データ ソースがどのように構造化および編成されているか、必要なデータ分析手順、必要な出力、およびスクリプトの使用方法です。選択した非類似度測定を実装する関数を作成する必要があるでしょう。
これらの質問に対する回答 (JSL Companion の第 2 版の第 11 章に役立つチェックリストがあります) によっては、スクリプトの作成が多かれ少なかれ困難になる可能性があります。
そして、あなたが選ぶことができれば、Bray-Curtis とは異なる非類似度の尺度をお勧めします。ご希望の方は同封の用紙をご参照ください。
幸運を!