Ciao,
Sto cercando di creare una matrice di distanza di valori di somiglianza / dissomiglianza per i dati della comunità. Vorrei usare un'equazione specifica (Bray-Curtis) per costruire la matrice di valori; i valori mostreranno somiglianza in abbondanza di molte specie tra più trame. Sono a conoscenza del metodo per creare una matrice di distanze in JMP usando il clustering gerarchico, ma non so come eseguire un comando simile usando la mia equazione. C'è uno strumento per farlo, o come farei a scrivere lo script per farlo?
Ciao, hjh!
Tutto ciò che desideri può essere ottenuto con una sceneggiatura. JSL ti renderà libero!
Per quanto riguarda la modalità di scrittura dello script, consiglio una tastiera per computer.
Seriamente, però, dovrai considerare diverse cose prima di iniziare a scrivere uno script: come sono strutturate e organizzate le tue origini dati, i passaggi necessari per l'analisi dei dati, l'output che desideri e come verrà utilizzato lo script. Probabilmente vorrai scrivere una funzione per implementare la misura di dissomiglianza che scegli.
A seconda delle risposte a queste domande (c'è una lista di controllo utile nel Capitolo 11 della Seconda Edizione di JSL Companion), lo script potrebbe essere più o meno difficile da scrivere.
E se dovessi scegliere, ti consiglierei una misura di dissimilarità diversa da quella di Bray-Curtis. Si prega di fare riferimento alla carta allegata se lo si desidera.
In bocca al lupo!
