Hallo,
Ich versuche, eine Distanzmatrix von Ähnlichkeits-/Unähnlichkeitswerten für Community-Daten zu erstellen.Ich möchte eine bestimmte Gleichung (Bray-Curtis) verwenden, um die Wertematrix zu erstellen. Die Werte zeigen Ähnlichkeit in der Häufigkeit mehrerer Arten zwischen mehreren Parzellen.Ich kenne die Methode zum Erstellen einer Distanzmatrix in JMP mithilfe hierarchischer Clusterbildung, weiß jedoch nicht, wie ich einen ähnlichen Befehl mithilfe meiner eigenen Gleichung ausführen kann.Gibt es dafür ein Tool oder wie würde ich das Skript dafür schreiben?
Hallo, hjh!
Was auch immer Sie sich wünschen, können Sie mit einem Skript erreichen.JSL wird Sie befreien!
Für die Vorgehensweise beim Schreiben des Skripts empfehle ich eine Computertastatur.
Im Ernst, Sie müssen jedoch mehrere Dinge bedenken, bevor Sie mit dem Schreiben eines Skripts beginnen: wie Ihre Datenquellen strukturiert und organisiert sind, welche Datenanalyseschritte erforderlich sind, welche Ausgabe Sie wünschen und wie das Skript verwendet wird.Sie möchten wahrscheinlich eine Funktion schreiben, um das von Ihnen gewählte Unähnlichkeitsmaß zu implementieren.
Abhängig von Ihren Antworten auf diese Fragen (eine hilfreiche Checkliste finden Sie in Kapitel 11 der zweiten Ausgabe des JSL Companion) könnte das Schreiben des Skripts mehr oder weniger schwierig sein.
Und wenn Sie die Wahl haben, würde ich ein anderes Unähnlichkeitsmaß als Bray-Curtis empfehlen.Bitte beziehen Sie sich bei Bedarf auf das beigefügte Dokument.
Viel Glück!