Bonjour,
J'essaie de créer une matrice de distance de valeurs de similarité/dissimilarité pour les données communautaires.Je voudrais utiliser une équation spécifique (Bray-Curtis) pour construire la matrice de valeurs ; les valeurs montreront une similarité dans l’abondance de plusieurs espèces entre plusieurs parcelles.Je connais la méthode permettant de créer une matrice de distance dans JMP à l'aide du clustering hiérarchique, mais je ne sais pas comment exécuter une commande similaire en utilisant ma propre équation.Existe-t-il un outil pour le faire, ou comment pourrais-je écrire le script pour le faire ?
Salut, hjh !
Tout ce que vous désirez peut être réalisé avec un script.JSL vous libérera !
Quant à la manière d’écrire le script pour ce faire, je recommande un clavier d’ordinateur.
Sérieusement, cependant, vous devrez prendre en compte plusieurs éléments avant de vous lancer dans l'écriture d'un script : la manière dont vos sources de données sont structurées et organisées, les étapes d'analyse des données nécessaires, le résultat souhaité et la manière dont le script sera utilisé.Vous souhaiterez probablement écrire une fonction pour implémenter la mesure de dissimilarité que vous choisissez.
En fonction de vos réponses à ces questions (il existe une liste de contrôle utile dans le chapitre 11 de la deuxième édition de JSL Companion), le script pourrait être plus ou moins difficile à écrire.
Et, si vous avez le choix, je recommanderais une mesure de dissimilarité différente de celle de Bray-Curtis.Veuillez vous référer au document ci-joint si vous le souhaitez.
Bonne chance!
