使用使用者定義的方程式建立距離矩陣你好,
我正在嘗試為社區數據創建相似性/不相似性值的距離矩陣。我想使用一個特定的方程式(Bray-Curtis)來建構值矩陣;值將顯示多個地塊之間多個物種豐度的相似性。我知道使用層次聚類在 JMP 中創建距離矩陣的方法,但不知道如何使用我自己的方程式執行類似的命令。有沒有一個工具可以做到這一點,或者我將如何編寫腳本來做到這一點?
回覆:使用使用者定義的方程式建立距離矩陣嗨,呵呵!
無論您想要什麼,都可以透過腳本實現。JSL將讓你自由!
至於如何編寫腳本來執行此操作,我推薦使用電腦鍵盤。
不過,說實話,在開始編寫腳本之前,您需要考慮幾件事:資料來源的結構和組織方式、必要的資料分析步驟、您想要的輸出以及如何使用腳本。您可能需要編寫一個函數來實現您選擇的相異性度量。
根據您對這些問題的答案(JSL Companion 第二版的第 11 章中有一個有用的清單),編寫腳本可能或多或少有些困難。
而且,如果您確實需要選擇,我會建議與 Bray-Curtis 不同的相異性度量。如果您願意,請參考隨附的文件。
祝你好運!