Comment créer une cohorte appariée ?<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />Je mène une étude de cohorte appariée et j'aimerais utiliser JMP pour créer ma cohorte de contrôle.J'ai environ 2000 cas et 10000 contrôles potentiels.Je voudrais faire correspondre les cas aux témoins dans un rapport de 1 à 1.Comment puis-je utiliser JMP pour sélectionner parmi les 10 000 témoins potentiels en faisant correspondre ceux qui ressemblent le plus aux cas sur trois facteurs : la date d'admission à l'hôpital, les comorbidités et le score de blessure ?
Merci pour tous les conseils que vous pouvez fournir.
Re : Comment créer une cohorte appariée ?Jordan,
J'ai rencontré un petit problème - lorsque j'ai essayé l'analyse de cluster, il exécute le
analyse initiale, mais lorsque j'essaie de "sauvegarder la matrice de distance", je reçois un message
qui dit "Impossible d'allouer suffisamment de mémoire".
Ma table est plus grande que ce à quoi je m'attendais - plus proche de 30 000 lignes.Peut-être cela
c'est le problème?
Merci,
Chahram
Re : Comment créer une cohorte appariée ?Super, merci Jordan.
Meilleur,
Chahram
Le samedi 13 décembre 2014 à 16 h 50, jordanhiller@jmp
Re : Comment créer une cohorte appariée ?Voici une approche.
1) Créez un ensemble de données contenant les 12 000 patients, à la fois des cas et des témoins potentiels. Inclure une colonne qui indique l'appartenance au groupe. Incluez également les variables continues sur lesquelles vous souhaitez faire correspondre. (Je ne sais pas si les comorbidités peuvent être utilisées de cette façon -- peut-être avez-vous un moyen de convertir en un score continu).
2) Exécutez une analyse de cluster hiérarchique sur les variables correspondantes. Utilisez un identifiant unique pour le patient en tant que "Label". Cochez la case "Standardize Data" pour vous assurer que vos variables correspondantes contribuent de manière égale à l'analyse, sinon les variables avec une plus grande variance auront une plus grande influence.
3) À partir du point chaud du triangle rouge, choisissez "Enregistrer la matrice de distance". La matrice de distance peut être utilisée pour trouver une correspondance pour chaque cas. Vous devrez joindre la variable d'appartenance à la matrice de distance, puis supprimer les lignes pour les cas. Maintenant, pour chaque colonne qui représente un cas, la ligne avec la plus petite valeur dans cette colonne est la correspondance la plus proche parmi les contrôles potentiels.
Un écueil est qu'un seul contrôle peut être choisi pour plusieurs cas - vous devrez vérifier cela manuellement ou via un script.
Bonne chance,
Jordan
Re : Comment créer une cohorte appariée ?Pourriez-vous joindre des captures d'écran à ce message. J'ai eu un peu de mal à suivre les instructions.
Merci beaucoup
