¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos desequilibrados con modelo mixto?Hola ,
Estoy tratando de hacer el análisis de datos de rendimiento con tres factores (2 años, 2 ubicaciones, 8 variedades). Sin embargo, los datos no son datos equilibrados como se muestra a continuación:
En 2012, las 8 variedades se probaron solo en la ubicación A, pero en 2013, las 8 variedades se probaron en las ubicaciones A y B.
¿Cómo puedo seguir ejecutando un análisis factorial completo de 3 vías utilizando el modelo mixto si quiero tratar el "año" como un efecto aleatorio? porque desearé ver si hay interacciones entre los tres factores.
¡¡Muchas gracias por su ayuda!!
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Tendrá pruebas para términos individuales en el modelo.
No hay pruebas por pares (por ejemplo, Tukey o contrastes) en Logística Ordinal o Nominal. El informe de estimaciones de parámetros probará todos los parámetros con el último nivel, pero sin realizar ajustes para las comparaciones múltiples.
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?No sabía que Year podía tratarse como un efecto fijo para cualquier situación, pero gracias por esta recomendación.
si encajo Modelo logístico ordinal , puedo ver si los efectos o interacciones son significativamente diferentes, ¿verdad? ¿Hay alguna manera de poder realizar una comparación por pares entre las variedades para sus calificaciones de respuesta a enfermedades?
Gracias.!
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Los términos del modelo serán los mismos pero el método será de regresión logística nominal u ordinal. JMP no puede estimar dicho modelo si existen efectos aleatorios. Quizás sea mejor que trate el año como un efecto fijo por ahora, ya que solo tiene dos años, lo que de todos modos es un tamaño de muestra muy pequeño para estimar la varianza.
Comience como antes con Ajustar modelo. JMP cambiará automáticamente a regresión logística nominal cuando coloque su respuesta categórica Enfermedad en el rol Y. (No ingrese otra respuesta en este caso). La diferencia entre logística nominal y ordinal es la interpretación del logit y las probabilidades que desea.
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?¡Muchas gracias por toda su ayuda!
También voy a analizar la clasificación de enfermedades (datos ordinales). ¿Podría sugerirme el mejor modelo para analizar dada mi situación? (8 variedades, 2 años y 2 ubicaciones)?
¡Aprecialo de nuevo!
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Puede utilizar la plataforma Tabular (menú Analizar) para calcular el %CV de cada grupo en un formato de resumen.
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?No, todavía necesito el Año en mi modelo para ver si la mayoría de las variedades funcionan de manera estable en diferentes entornos. Su punto de lluvia es la única variable en un año y tiene mucho sentido. Sin embargo, pensé que había una manera de ver las interacciones de la variedad Año* aunque el año sea aleatorio.
CV es una forma común de observar la uniformidad de los campos cuando se realizan pruebas de rendimiento con cualquier diseño experimental, como RCBD.
Generalmente se cree que <10% son entornos extremadamente uniformes;
10% < x <30% es aceptable antes de realizar más análisis de combinación
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Entonces, ¿eliminarás Año del análisis?
Las precipitaciones son sólo una de las presuntas muchas perturbaciones que contribuyen al efecto aleatorio denominado Año. ¿Tendría sentido cambiar de un factor categórico aleatorio (Año) a factores continuos fijos como la lluvia?
¿La variedad es un efecto fijo que depende del nivel de otro factor? Ese efecto requiere un término de interacción en el modelo.
Si tiene varios cultivos en su conjunto de datos y los combina, entonces la variación adicional entre años o cultivos reducirá la potencia de sus pruebas.
Debido a que está comparando la misma respuesta en todos los grupos, no necesita usar %CV. Puede comparar la variación directamente en la plataforma Oneway. Seleccionar Analizar > Ajustar Y por X . Haga clic en el triángulo rojo después de iniciar la plataforma y seleccione Variaciones desiguales . La prueba de Bartlett es la prueba más potente para datos distribuidos normalmente. Por lo demás, la prueba de Levene es la prueba más poderosa.
También puedes utilizar el Gráfica de cuantiles normales comando en Oneway para evaluar la normalidad de los datos.
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Porque el 2012 tiene menos precipitaciones que el 2013, y no todas las variedades están respondiendo igual al año. Puedo combinar, pero tendré que verificar el% de CV para cada combinación de entorno antes de realizar el análisis de combinación.
¿Sabe cómo comprobar el % de CV de cada combinación para asegurarse de que sea lo suficientemente bajo como para combinarlo?
ex (2012, ubicación A) y (201 2 , ubicación 
& ((2013, ubicación A)& (2013, ubicación
Gracias
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?No veo la necesidad de realizar análisis separados para cada año. Esta división de la muestra afectará la potencia de sus pruebas. Mantenga todos los efectos en el modelo que estén respaldados por los datos para las pruebas más potentes. Obtendrá una prueba de modelo completo, pruebas para términos individuales y pruebas para comparar niveles dentro de un factor.
¿Por qué los comandos que te di antes no serán suficientes para las comparaciones que quieres hacer?
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Hola Mark,
Muchas gracias por explicarlo tan claro.
Entiendo que si ejecuto el modelo mixto con "año" como efecto aleatorio, no podré obtener un LSD común, pero aún así puedo hacer comparaciones por pares.
Sin embargo, ¿podré conseguir un LSD si lo ejecuto por " Año "?
Y: Producir
Por Año
Efectos del modelo: Variedades , Ubicaciones , Variedades*Ubicaciones
¡Gracias!
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Hola Mark,
Muchas gracias por explicarlo tan claro.
Entiendo que si ejecuto el modelo mixto con "año" como efecto aleatorio, no podré obtener un LSD común, pero aún así puedo hacer comparaciones por pares.
Sin embargo, ¿podré conseguir un LSD si lo ejecuto por " Año "?
Y: Producir
Por Año
Efectos del modelo: Variedades , Ubicaciones , Variedades*Ubicaciones
¡Gracias!
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Olvidé que estás probando un modelo mixto. Mis instrucciones se adaptaban al caso de un modelo con sólo efectos fijos.
Estos comandos todavía están disponibles pero están ubicados en otro lugar. Abre el Detalles del efecto esquema y encontrará la misma información para cada término que encontraría en el Gráfico de apalancamiento (excepto el gráfico en sí).
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Deberá utilizar la plataforma Ajustar mínimos cuadrados a través de Análisis > Ajustar modelo. Asegúrese de que el énfasis sea Apalancamiento del efecto, aunque hay otra forma de obtener esta información. Las medias de mínimos cuadrados se muestran debajo de cada uno de los gráficos de apalancamiento. El LSD no está disponible pero puedes probar todas las diferencias por pares con el método de Tukey, diferencias con un nivel de control con el método de Dunnett, o cualquier contraste o combinación de contrastes específico. Haga clic en el triángulo rojo junto a cualquiera de los gráficos de apalancamiento para encontrar los comandos. Si presiona y mantiene presionada la tecla Ctrl (Windows) o Comando (Mac) primero, el comando se transmitirá a todos los gráficos de apalancamiento para que no tenga que ejecutar cada uno individualmente.
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Hola Mark,
¡Muchas gracias!
¿Aún podré obtener el LSD para todas las variedades de este análisis combinado para poder hacer comparaciones por pares?
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?La estimabilidad de los parámetros depende del diseño. El diseño factorial completo de 32 corridas (2*2*8) admite la estimación de todos los términos posibles, asumiendo que todos se tratan como factores nominales. Los datos faltantes prohíben la estimación del efecto Año*Ubicación y el efecto Año*Ubicación*Variedad.
Además, si trata el Año como un efecto aleatorio, no querrá estimar el efecto Año*Variedad. Puede estimar el efecto Año independientemente de cómo lo modele (efecto fijo o aleatorio).
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Hola Mark,
Muchas gracias por su respuesta.Supongo que tendria que quitar el Año * Ubicación*variedad término del modelo también?
¿Seguiré siendo capaz de ver el efecto del año en el rendimiento entonces? Gracias
Juno
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?No consideré el efecto de interacción de tres factores. Se pueden estimar dos de los tres efectos de interacción de dos factores si los únicos valores que faltan son para Ubicación = B cuando Año = 2012. Sin duda, hice un diseño factorial completo para estos factores tal como se describieron y no tuve problemas para estimar los parámetros si se omitía el término Año*Ubicación.
¿Quién cree en las interacciones de tres factores?
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Marca,
No está calificando nada sobre el término Año*Ubicación*Variedad.¿Ese término seguirá siendo viable en este diseño?
Jim
Re: ¿Cómo hacer ANOVA factorial completo de tres vías con datos no balanceados con modelo mixto?Puede ajustar un modelo con todos los efectos deseados excepto el Año * Ubicación efecto de interacción.
- Seleccionar Analizar > Modelo de ajuste .
- Selecciona el Año , Ubicación , y Variedad columnas de datos.
- Hacer clic macros y seleccione Factorial a grado .
- Selecciona el Año * Ubicación efecto y haga clic Eliminar .
- Selecciona el Año y el Año * Variedad términos, luego haga clic en el triángulo rojo junto a Atributos y seleccione Aleatorio .
- Haga clic en Ejecutar.
Eso es todo lo que puedes hacer con estos datos.
