Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ciao ,
Sto cercando di eseguire l'analisi dei dati sulla resa con tre fattori (2 anni, 2 località, 8 varietà). Tuttavia i dati non sono equilibrati come segue:
Nel 2012, le 8 varietà sono state testate solo nella località A, ma nel 2013 le 8 varietà sono state testate nelle località A e B.
Come posso comunque eseguire un'analisi a 3 vie completamente fattoriale utilizzando il modello misto se voglio trattare "anno" come effetto casuale? perché desidero vedere se ci sono interazioni tra i tre fattori.
Grazie mille per il tuo aiuto!!
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Avrai test per i singoli termini nel modello.
Non ci sono test a coppie (ad esempio, Tukey o contrasti) nella logistica ordinale o nominale. Il report sulle stime dei parametri testerà tutti i parametri rispetto all'ultimo livello ma senza aggiustamenti per i confronti multipli.
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Non sapevo che Year potesse essere considerato un effetto fisso per qualsiasi situazione, ma grazie per questo consiglio.
Se mi adatto Modello logistico ordinale , posso vedere se gli effetti o le interazioni sono significativamente diversi, giusto? Esiste un modo per effettuare un confronto a coppie tra le varietà per le rispettive valutazioni di risposta alla malattia?
Grazie.!
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?I termini del modello saranno gli stessi ma il metodo sarà la regressione logistica nominale o ordinale. JMP non può stimare un modello di questo tipo se sono presenti effetti casuali. Potrebbe essere meglio trattare Anno come un effetto fisso per ora, poiché hai solo due anni, che è comunque una dimensione del campione molto piccola per stimare la varianza.
Inizia come prima con Fit Model. JMP passerà automaticamente alla regressione logistica nominale quando si inserisce la risposta categoriale Malattia nel ruolo Y. (Non inserire un'altra risposta in questo caso.) La differenza tra logistica nominale e ordinale è l'interpretazione del logit e delle quote che desideri.
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Grazie mille per tutto il tuo aiuto!
Analizzerò anche la valutazione della malattia (dati ordinali), potreste per favore suggerirmi il modello migliore da analizzare data la mia situazione? (8 varietà, 2 anni e 2 località)?
Apprezzalo ancora!
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?È possibile utilizzare la piattaforma Tabula (menu Analizza) per calcolare il %CV per ciascun gruppo in un formato di riepilogo.
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?No, ho ancora bisogno dell'anno nel mio modello per vedere se la maggior parte delle varietà funziona stabilmente in ambienti diversi. Il punto in cui piove è l'unica variabile in un anno e ha molto senso. Tuttavia, ho pensato che ci fosse un modo per esaminare le interazioni della varietà Anno* anche se l'anno è casuale?
Il CV è un modo comune per esaminare l'uniformità dei campi durante lo svolgimento di prove di rendimento con qualsiasi disegno sperimentale, come RCBD.
Si ritiene generalmente che < 10% siano ambienti estremamente uniformi;
10%< x <30% è accettabile prima di combinare ulteriormente l'analisi
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Quindi rimuoverai Anno dall'analisi?
La pioggia è solo una delle presumibilmente molte perturbazioni che contribuiscono all'effetto casuale etichettato come Anno. Avrebbe senso passare da un fattore categorico casuale (anno) a fattori fissi continui come le precipitazioni?
La varietà è un effetto fisso che dipende dal livello di un altro fattore? Tale effetto richiede un termine di interazione nel modello.
Se nel tuo set di dati sono presenti più colture e le combini, la variazione aggiuntiva tra anni o colture ridurrà la potenza dei test.
Poiché stai confrontando la stessa risposta in tutti i gruppi, non è necessario utilizzare %CV. Puoi confrontare la varianza direttamente nella piattaforma Oneway. Selezionare Analizzare > Adatta Y per X . Fai clic sul triangolo rosso dopo aver avviato la piattaforma e seleziona Varianze disuguali . Il test di Bartlett è il test più potente per dati distribuiti normalmente. Altrimenti il test di Levene è il test più potente.
Puoi anche usare il Grafico dei quantili normali comando in Oneway per valutare la normalità dei dati.
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Perché il 2012 ha avuto meno precipitazioni rispetto al 2013, e non tutte le varietà rispondono allo stesso anno. Posso combinare, ma dovrò controllare il CV% per ciascuna combinazione di ambienti prima di eseguire l'analisi di combinazione.
Sai come verificare il CV% per ciascuna combinazione per assicurarti che sia sufficientemente basso da poter essere combinato?
ex (2012, luogo A) & (201 2 , ubicazione 
& ((2013, ubicazione A)& (2013, ubicazione
Grazie
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Non vedo la necessità di effettuare analisi separate per ogni anno. Questa divisione del campione influenzerà la potenza dei tuoi test. Conserva nel modello tutti gli effetti supportati dai dati per i test più efficaci. Otterrai un test del modello completo, test per termini individuali e test per confrontare i livelli all'interno di un fattore.
Perché i comandi che ti ho dato prima non saranno sufficienti per i confronti che vuoi fare?
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ciao Marco,
Grazie mille per averlo spiegato in modo così chiaro.
Capisco che se eseguo il modello misto con "anno" come effetto casuale, non sarò in grado di ottenere un LSD comune, ma posso comunque fare confronti a coppie.
Tuttavia, potrò procurarmi un LSD se lo uso entro " Anno "?
Y: Prodotto
Di Anno
Effetti del modello: Varietà , Posizioni , Varietà*Ubicazioni
Grazie!
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ciao Marco,
Grazie mille per averlo spiegato in modo così chiaro.
Capisco che se eseguo il modello misto con "anno" come effetto casuale, non sarò in grado di ottenere un LSD comune, ma posso comunque fare confronti a coppie.
Tuttavia, potrò procurarmi un LSD se lo uso entro " Anno "?
Y: Prodotto
Di Anno
Effetti del modello: Varietà , Posizioni , Varietà*Ubicazioni
Grazie!
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ho dimenticato che stai adattando un modello misto. Le mie istruzioni si adattavano al caso di un modello con soli effetti fissi.
Questi comandi sono ancora disponibili ma si trovano altrove. Apri il Dettagli dell'effetto schema e troverai per ciascun termine le stesse informazioni che troverai nel Leverage Plot (ad eccezione della trama stessa).
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Sarà necessario utilizzare la piattaforma Stima dei minimi quadrati tramite Analisi > Stima modello. Assicurati che l'enfasi sia sull'effetto leva, sebbene esista un altro modo per ottenere queste informazioni. Le medie dei minimi quadrati sono riportate sotto ciascuno dei grafici di leva. L'LSD non è disponibile ma è possibile testare tutte le differenze a coppie con il metodo Tukey, le differenze con un livello di controllo con il metodo Dunnett o qualsiasi contrasto specifico o combinazione di contrasti. Fare clic sul triangolo rosso accanto a uno qualsiasi dei grafici di leva per trovare i comandi. Se premi e tieni premuto prima Ctrl (Windows) o Comando (Mac), il comando verrà trasmesso a tutti i grafici Leverage in modo da non dover eseguirli singolarmente.
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ciao Marco,
Grazie mille!
Potrò ancora ottenere l'LSD per tutte le varietà da questa analisi combinata in modo da poter effettuare confronti a coppie?
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?La stimabilità dei parametri dipende dal disegno. Il disegno fattoriale completo a 32 esecuzioni (2*2*8) supporta la stima di tutti i termini possibili, presupponendo che tutti siano trattati come fattori nominali. I dati mancanti impediscono la stima dell'effetto Anno*Località e dell'effetto Anno*Località*Varietà.
Inoltre, se consideri Anno come un effetto casuale, non vorrai stimare l'effetto Anno*Varietà. Puoi stimare l'effetto Anno indipendentemente da come lo modelli (effetto fisso o casuale).
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Ciao Marco,
Grazie mille per la tua risposta.Presumo che dovrei rimuovere il file Anno * Posizione*varietà termine anche dal modello?
Potrò ancora vedere l'effetto dell'anno sul rendimento? Grazie
Giunone
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Non ho considerato l’effetto dell’interazione a tre fattori. Due dei tre effetti di interazione a due fattori possono essere stimati se gli unici valori mancanti sono per Posizione = B quando Anno = 2012. A dire il vero, ho realizzato un disegno fattoriale completo per questi fattori così come sono stati descritti e non ho avuto problemi a stimare i parametri se il termine Anno*Località veniva omesso.
Chi crede comunque nelle interazioni a tre fattori?
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Segno,
Non stai qualificando nulla riguardo al termine Anno*Località*Varietà.Quel termine resterà praticabile in questo disegno?
Jim
Re: Come eseguire l'ANOVA fattoriale completo a tre vie con dati sbilanciati con il modello misto?Puoi adattare un modello con tutti gli effetti desiderati tranne il Anno * Posizione effetto di interazione.
- Selezionare Analizzare > Modello adatto .
- Seleziona il Anno , Posizione , E Varietà colonne di dati.
- Clic Macro e seleziona Fattoriale al grado .
- Seleziona il Anno * Posizione effetto e fare clic Rimuovere .
- Seleziona il Anno e il Anno * Varietà termini, quindi fare clic sul triangolo rosso accanto a Attributi e seleziona Casuale .
- Fare clic su Esegui.
Questo è tutto ciò che puoi fare con questi dati.
