33151_fr-FR

liliconcom

Validation d'un modèle cox de régression général avec un ensemble de données externe

Est-ce possible? Même si je mets une colonne de validation dans un modèle approprié pour fractionner les données, toutes les options de validation que je reçois sont AICc & BIC.

 

* EDIT * J'ai trouvé un exemple de ce que je veux dire.  

 

dt = Open("$SAMPLE_DATA\VA Lung Cancer.jmp");
dt << Fit Model(
 Censor( :censor ),
 Censor Code( "1" ),
 Y( :Time ),
 Effects( :Cell Type, :Treatment, :Prior, :Age, :Diag Time, :KPS ),
 No Intercept,
 Personality( "Generalized Regression" ),
 Generalized Distribution( "Cox Proportional Hazards" ),
 Run(
  Fit( Estimation Method( Maximum Likelihood ), Validation Method( None ) ),
  Fit(
   Estimation Method( Lasso( Adaptive ) ),
   Validation Method( AICc ),
   Set Solution ID( 143 ),
   Parameter Estimates for Centered and Scaled Predictors( 1 )
  )
 ),
 SendToReport(
  Dispatch(
   {"Adaptive Lasso with AICc Validation", "Solution Path"},
   "Fit Generalized Solution Path",
   FrameBox,
   {DispatchSeg( Line Seg( 4 ), {Line Width( 3 )} )}
  )
 )
);

J'ai en fait créé une colonne de validation ici et ici se trouvait la boîte de dialogue du modèle d'ajustement.  C'est bizarre de ne pas transférer la colonne de validation au script (le script a été créé principalement par JMP). 

 

 

Re: Validation d'un modèle de régression général cox avec un ensemble de données externe

Visage triste.   

Il n’ya donc aucun moyen de valider, car les bêtas calculent réellement les dangers et non les réponses.

 

J'ai déjà vu des trucs sur le calcul d'un indice de concordance pour les modèles Cox, mais j'essaie toujours d'analyser les documents à ce sujet.  

Serait-ce un itinéraire à prendre?

Re: Validation d'un modèle de régression général cox avec un ensemble de données externe

La méthode de la colonne de validation n'est pas disponible pour le modèle de dangers proportionnels de Cox dans la régression généralisée, comme indiqué ci-dessous:

http://www.jmp.com/support/help/13/Model_Launch_Control_Panel.shtml#456887

 

Colonne de validation

• Utilise la colonne spécifiée dans la fenêtre Adapter le modèle comme ayant le rôle Validation. La solution finale est celle qui minimise la log-vraisemblance négative pour l'ensemble de validation. Cette option n'est pas disponible lorsque la distribution spécifiée est régression quantile ou risques proportionnels de Cox.

Re: Validation d'un modèle de régression général cox avec un ensemble de données externe

J'ai la colonne de validation ici, j'ai seulement inclus le script pour montrer que le script de sauvegarde n'a pas de colonne de validation.  Mais quand je fais spécifiquement un modèle cox. En dehors de AICc et BIC, tout est grisé.  La gauche est une distribution normale, la droite est Cox.  

 

Re: Validation d'un modèle de régression général cox avec un ensemble de données externe

Le script ouvre en permanence la table de données à partir du dossier JMP Sample Data. Avez-vous ajouté la colonne de validation et sauvegardé le tableau de données? Si la colonne est manquante, elle sera supprimée de la boîte de dialogue / analyse de lancement.