Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierSalve, mi chiedo come posso ottenere un grafico di Kaplan Meier con le corrispondenti tabelle a rischio visualizzate sotto?
Grazie.
Ri: Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierCiao, immagino che tu voglia creare qualcosa del genere:
Puoi ottenerlo, seguendo questa procedura:
- Crea la trama di sopravvivenza come descritto da @Mark_Bailey Prima
- Salva la tabella combinata sotto la struttura del gruppo (apri la struttura del primo gruppo, fai clic con il pulsante destro del mouse sulla tabella, Crea tabella dati combinata)
- Nella nuova tabella dati è una buona idea cambiare il giorno in ordinale e cambiare il formato in 0 cifre decimali, inoltre fare clic con il pulsante destro del mouse sulla colonna A rischio nel pannello delle colonne al centro a sinistra della tabella dati e selezionare Usa per marcatore. Questo mostrerà i numeri effettivi invece dei punti nel grafico che costruiamo
- Costruttore di grafici, giorno su X, Sopravvivenza su Y, passa all'elemento linea, quindi seleziona passo invece di linea nelle opzioni per l'elemento linea
- Ora metti il Gruppo su Y sotto Sopravvivenza (non al top!), Metti il Gruppo anche come Overlay.
- L'ultimo è utilizzare il filtro per selezionare solo i gruppi e non quello combinato.
Quando verranno visualizzati tutti i valori a rischio, potresti voler aggiungere colonne per i giorni richiesti, ad esempio 150, 200, 250, 300, 350 e copiare rispettivamente i valori della riga con il numero del giorno più piccolo più vicino. Quindi usa solo questi come etichette. Non sono sicuro che sarà molto semplice rispetto a uno script, ma dovresti almeno avvicinarti a ciò che desideri.
Tuttavia, una finestra combinata del grafico di sopravvivenza (nella piattaforma di sopravvivenza o nel Costruttore di grafici) più una tabella creata con tabellare o riepilogo, quindi tabellare, funzionerà in modo simile.
@ghartel , hai menzionato una voce nella lista dei desideri. Io non riesco a trovarlo. Sarebbe fantastico se potessi pubblicare il collegamento alla voce qui, così chiunque sia interessato può dare un complimento al tuo desiderio.
Ri: Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierI diari spesso richiedono che i grafici di sopravvivenza siano formattati come nell'esempio in alto (ad es https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/pages/instructions-for-authors ). L'ho inserito nella mia lista dei desideri di JMP per averlo come opzione. La cosa più vicina che riesco a ottenere al momento è aggiungere una casella di tabella con i numeri rilevanti, ma non riesco ad allineare le dimensioni della tabella con la trama di sopravvivenza, ma è abbastanza vicino per modificarla ulteriormente nel diario. Sarei grato per qualsiasi suggerimento su come migliorare questo o se esiste un componente aggiuntivo che lo rende possibile.Ho pensato che forse il graphbuilder potrebbe essere utilizzato per creare questo grafico (cfr. addin forest plot @Richard_Zink )
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Rats.jmp" );
minT = 100;
maxT = 350;
stepT = 50;
Summarize( lv = by( :Group ) );
obj = Survival(
Y( :days ),
Censor( :Censor ),
Grouping( :Group ),
Show Points( 1 ),
SendToReport( Dispatch( {"Survival Plot"}, "1", ScaleBox, {Min( minT ), Max( maxT ), Inc( stepT ), Minor Ticks( 1 )} ), )
) << report;
obj[List Box( 2 )] << append( Table Box( String Col Box( "No at Risk | Day", lv ) ) );
Tab1 = (obj[lv[1]][Table Box( 1 )] << get);
Tab2 = (obj[lv[2]][Table Box( 1 )] << get);
For( T = minT, T <= maxT, T += stepT,
lp = Max( Loc( Matrix( Tab1["days"] ) <= T ) );
AR1 = Tab1["At Risk"][lp];
lp = Max( Loc( Matrix( Tab2["days"] ) <= T ) );
AR2 = Tab2["At Risk"][lp];
obj[List Box( 2 )][Table Box( 1 )] << append( Number Col Box( Char( T ), {AR1, AR2} ) );
);
Ri: Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierTentativo Analizzare > Affidabilità e sopravvivenza > Sopravvivenza con la colonna dei dati sulla durata nel file Y, Tempo all'evento ruolo, la colonna dei dati di indicazione della censura (se presente) nel file Censurare ruolo e la colonna dei dati di appartenenza al gruppo nel file Raggruppamento ruolo. Ecco un esempio:
Clic OK e vedrai la trama desiderata nella parte superiore della finestra:
Non capisco la "tabella a rischio" che mostri. Non credo che JMP fornisca direttamente questa tabella ma probabilmente è possibile ottenerla con un'azione di sintesi sulle stime.
È possibile ottenere le stime aprendo il contorno nella parte inferiore della finestra per qualsiasi gruppo o per le osservazioni combinate. Ad esempio, ecco le stime Gruppo=1:
Potrebbe funzionare anche il suggerimento originale di utilizzare la piattaforma Life Distribution con la scheda Confronta gruppi.
Ri: Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierCome posso ottenere un grafico simile a questo? Vorrei che i numeri a rischio fossero visualizzati sotto la tabella Kaplan Meier. Grazie.
Ri: Visualizzazione delle tabelle a rischio sotto Kaplan MeierSelezionare Analizzare > Affidabilità e sopravvivenza > Distribuzione della vita . Inserisci la variabile del tempo necessario all'evento nel file Tempo ruolo e fare clic OK . Fai clic sul triangolo rosso quando la piattaforma si apre e deseleziona Mostra punti . La tabella è inizialmente chiusa ma appare direttamente sotto il grafico della probabilità.
