Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierSalut, je me demande comment obtenir un tracé de Kaplan Meier avec les tableaux de risques correspondants affichés en dessous ?
Merci.
Re : Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierSalut, je suppose que tu veux créer quelque chose comme ceci :
Vous pouvez l'obtenir en suivant cette procédure :
- Créez le complot de survie comme décrit par @Mark_Bailey avant
- Enregistrez le tableau combiné sous le plan du groupe (ouvrez le plan du premier groupe, faites un clic droit dans le tableau, créez un tableau de données combiné)
- Dans le nouveau tableau de données, c'est une bonne idée de changer le jour en ordinal et de changer le format en 0 décimale, ainsi que de cliquer avec le bouton droit sur la colonne AtRisk dans le panneau de colonnes au milieu à gauche du tableau de données et de sélectionner Utiliser pour marqueur. Cela affichera les nombres réels au lieu des points dans le graphique que nous construisons
- Graph Builder, jour sur X, survie sur Y, passez à l'élément de ligne, puis sélectionnez l'étape au lieu de la ligne dans les options de l'élément de ligne
- Maintenant, mettez le groupe sur Y sous Survie (pas au top !), Mettez le groupe également en superposition.
- La dernière consiste à utiliser le filtre pour sélectionner uniquement les groupes et non celui combiné.
Comme vous obtiendrez toutes les valeurs à risque affichées, vous souhaiterez peut-être ajouter des colonnes pour les jours requis, par exemple 150, 200, 250, 300, 350 et copier les valeurs de la ligne avec le numéro de jour le plus petit le plus proche dans la ligne respectivement. Ensuite, utilisez-les uniquement comme étiquettes. Je ne sais pas si cela sera très simple par rapport à un script, mais vous devriez au moins vous rapprocher de ce que vous voulez.
Cependant, une fenêtre combinée du tracé de survie (dans la plateforme de survie ou dans Graph Builder) plus un tableau créé avec tabulaire ou récapitulatif, puis tabulaire, fonctionneront de la même manière.
@ghartel , vous avez mentionné une entrée dans la liste de souhaits. Je ne le trouve pas. Ce serait formidable si vous pouviez publier le lien vers l'entrée ici, afin que toute personne intéressée par cela puisse féliciter votre souhait.
Re : Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierLes journaux exigent souvent que les graphiques de survie soient formatés comme dans l'exemple en haut (par exemple https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/pages/instructions-for-authors ). J'ai mis cela dans ma liste de souhaits JMP pour avoir cela en option. Le plus proche que je puisse obtenir pour le moment est d'ajouter une zone de tableau avec les numéros pertinents, mais je n'arrive pas à aligner la taille du tableau sur le tracé de survie, mais elle est suffisamment proche pour la modifier davantage dans le Journal. Je serais reconnaissant pour toute suggestion sur la façon d'améliorer cela ou s'il existe un complément qui permet que cela se produise.J'ai pensé que peut-être le graphbuilder pourrait être utilisé pour créer ce tracé ( cf complément de tracé forestier @Richard_Zink )
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Rats.jmp" );
minT = 100;
maxT = 350;
stepT = 50;
Summarize( lv = by( :Group ) );
obj = Survival(
Y( :days ),
Censor( :Censor ),
Grouping( :Group ),
Show Points( 1 ),
SendToReport( Dispatch( {"Survival Plot"}, "1", ScaleBox, {Min( minT ), Max( maxT ), Inc( stepT ), Minor Ticks( 1 )} ), )
) << report;
obj[List Box( 2 )] << append( Table Box( String Col Box( "No at Risk | Day", lv ) ) );
Tab1 = (obj[lv[1]][Table Box( 1 )] << get);
Tab2 = (obj[lv[2]][Table Box( 1 )] << get);
For( T = minT, T <= maxT, T += stepT,
lp = Max( Loc( Matrix( Tab1["days"] ) <= T ) );
AR1 = Tab1["At Risk"][lp];
lp = Max( Loc( Matrix( Tab2["days"] ) <= T ) );
AR2 = Tab2["At Risk"][lp];
obj[List Box( 2 )][Table Box( 1 )] << append( Number Col Box( Char( T ), {AR1, AR2} ) );
);
Re : Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierEssayer Analyser > Fiabilité et survie > Survie avec la colonne de données sur la durée de vie dans le Y, temps jusqu'à l'événement rôle, la colonne de données d'indication de censure (s'il y en a une) dans le Censurer rôle et la colonne de données d'appartenance au groupe dans le Regroupement rôle. Voici un exemple:
Cliquez sur D'ACCORD et vous verrez le tracé souhaité en haut de la fenêtre :
Je ne comprends pas le « tableau à risque » que vous montrez. Je ne pense pas que JMP fournisse ce tableau directement mais il peut probablement être obtenu avec une action récapitulative sur les estimations.
Vous pouvez obtenir les estimations en ouvrant le contour en bas de la fenêtre pour n'importe quel groupe ou les observations combinées. Par exemple, voici les estimations Groupe = 1 :
La suggestion originale d'utiliser la plateforme Life Distribution avec l'onglet Comparer les groupes pourrait également fonctionner.
Re : Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierComment puis-je obtenir un graphique ressemblant à ceci ? Je voudrais que les chiffres à risque soient affichés sous le tableau de Kaplan Meier. Merci.
Re : Affichage des tableaux à risque sous Kaplan MeierSélectionner Analyser > Fiabilité et survie > Répartition de la vie . Entrez votre variable de temps avant l'événement dans le champ Temps rôle et cliquez sur D'ACCORD . Cliquez sur le triangle rouge lorsque la plateforme s'ouvre et désélectionnez Afficher les points . Le tableau est initialement fermé mais il apparaît directement sous le diagramme de probabilité.
