Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierHallo, ich frage mich, wie ich ein Kaplan-Meier-Diagramm mit den entsprechenden Risikotabellen erhalten kann, die darunter angezeigt werden.
Danke schön.
Betreff: Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierHallo, ich vermute, Sie möchten so etwas erstellen:
Sie können dies erreichen, indem Sie diesem Verfahren folgen:
- Erstellen Sie den Überlebensplot wie von beschrieben @Mark_Bailey Vor
- Speichern Sie die kombinierte Tabelle unter der Gruppengliederung (öffnen Sie die Gliederung der ersten Gruppe, klicken Sie mit der rechten Maustaste in die Tabelle, erstellen Sie eine kombinierte Datentabelle).
- In der neuen Datentabelle ist es eine gute Idee, den Tag in eine Ordinalzahl und das Format auf 0 Dezimalstellen zu ändern. Klicken Sie außerdem mit der rechten Maustaste auf die Spalte „AtRisk“ im Spaltenbereich in der Mitte links der Datentabelle und wählen Sie „Verwenden für“. Marker. Dadurch werden in der von uns erstellten Grafik die tatsächlichen Zahlen anstelle von Punkten angezeigt
- Graph Builder, Tag auf X, Überleben auf Y, wechseln Sie zum Linienelement und wählen Sie dann in den Optionen für das Linienelement Schritt statt Linie aus
- Setzen Sie nun die Gruppe auf Y darunter Überleben (nicht an der Spitze!), Gruppe auch als Overlay einfügen.
- Zuletzt können Sie den Filter verwenden, um nur die Gruppen und nicht die kombinierte auszuwählen.
Da Ihnen alle AtRisk-Werte angezeigt werden, können Sie Spalten für die erforderlichen Tage hinzufügen, z. B. 150, 200, 250, 300, 350, und jeweils die Werte der Zeile mit der nächstkleineren Tageszahl in die Zeile kopieren. Dann verwenden Sie einfach diese als Etiketten. Ich bin mir nicht sicher, ob dies im Vergleich zu einem Skript sehr einfach sein wird, aber Sie sollten zumindest annähernd an das herankommen, was Sie wollen.
Ein kombiniertes Fenster des Überlebensdiagramms (in der Überlebensplattform oder im Graph Builder) und eine Tabelle, die zunächst tabellarisch oder zusammenfassend und dann tabellarisch erstellt wurde, funktionieren jedoch auf ähnliche Weise.
@ghartel , Sie haben einen Wunschlisteneintrag erwähnt. Ich kann es nicht finden. Es wäre toll, wenn Sie den Link zum Eintrag hier posten könnten, damit jeder, der sich dafür interessiert, Ihrem Wunsch ein Lob aussprechen kann.
Betreff: Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierFür Zeitschriften ist es häufig erforderlich, dass Überlebensdiagramme wie im Beispiel oben formatiert werden (z. B https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/pages/instructions-for-authors ). Ich habe das auf meine JMP-Wunschliste gesetzt, um dies als Option zu haben. Das Beste, was ich im Moment erreichen kann, besteht darin, ein Tabellenfeld mit den relevanten Zahlen anzuhängen. Allerdings kann ich die Tabellengröße nicht ganz an die Überlebensdarstellung anpassen, aber sie reicht aus, um sie im Journal weiter zu bearbeiten. Für Vorschläge zur Verbesserung oder für die Frage, ob es ein Add-In gibt, das dies ermöglicht, wäre ich dankbar.Ich habe gedacht, dass vielleicht der Graphbuilder verwendet werden könnte, um diesen Plot zu erstellen (siehe Forest Plot Add-In). @Richard_Zink )
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Rats.jmp" );
minT = 100;
maxT = 350;
stepT = 50;
Summarize( lv = by( :Group ) );
obj = Survival(
Y( :days ),
Censor( :Censor ),
Grouping( :Group ),
Show Points( 1 ),
SendToReport( Dispatch( {"Survival Plot"}, "1", ScaleBox, {Min( minT ), Max( maxT ), Inc( stepT ), Minor Ticks( 1 )} ), )
) << report;
obj[List Box( 2 )] << append( Table Box( String Col Box( "No at Risk | Day", lv ) ) );
Tab1 = (obj[lv[1]][Table Box( 1 )] << get);
Tab2 = (obj[lv[2]][Table Box( 1 )] << get);
For( T = minT, T <= maxT, T += stepT,
lp = Max( Loc( Matrix( Tab1["days"] ) <= T ) );
AR1 = Tab1["At Risk"][lp];
lp = Max( Loc( Matrix( Tab2["days"] ) <= T ) );
AR2 = Tab2["At Risk"][lp];
obj[List Box( 2 )][Table Box( 1 )] << append( Number Col Box( Char( T ), {AR1, AR2} ) );
);
Betreff: Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierVersuchen Analysieren > Zuverlässigkeit und Überleben > Überleben mit der Lebenszeitdatenspalte in der Y, Zeit bis zum Ereignis Rolle, die Zensurhinweis-Datenspalte (falls vorhanden) in der Zensieren Rolle und die Spalte mit den Gruppenmitgliedschaftsdaten in der Gruppierung Rolle. Hier ist ein Beispiel:
Klicken OK und Sie sehen oben im Fenster den gewünschten Plot:
Ich verstehe die „Risikotabelle“, die Sie zeigen, nicht. Ich glaube nicht, dass JMP diese Tabelle direkt bereitstellt, aber sie kann wahrscheinlich mit einer zusammenfassenden Aktion zu den Schätzungen abgerufen werden.
Sie können die Schätzungen erhalten, indem Sie die Gliederung am unteren Rand des Fensters für eine beliebige Gruppe oder die kombinierten Beobachtungen öffnen. Hier sind zum Beispiel Schätzungen für Gruppe=1:
Der ursprüngliche Vorschlag, die Life Distribution-Plattform mit der Registerkarte „Gruppen vergleichen“ zu verwenden, könnte ebenfalls funktionieren.
Betreff: Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierWie erhalte ich ein Diagramm, das so aussieht? Ich möchte, dass die Risikozahlen unter der Kaplan-Meier-Tabelle angezeigt werden. Danke schön.
Betreff: Anzeige von Risikotabellen unter Kaplan MeierWählen Analysieren > Zuverlässigkeit und Überleben > Lebensverteilung . Geben Sie Ihre Zeit bis zum Ereignis in die Variable ein Zeit Rolle und klicken Sie OK . Klicken Sie beim Öffnen der Plattform auf das rote Dreieck und heben Sie die Auswahl auf Punkte anzeigen . Die Tabelle ist zunächst geschlossen, erscheint jedoch direkt unter dem Wahrscheinlichkeitsdiagramm.
