Modelo de ajuste: efectos repetidos, fijos y aleatoriosHola,
Espero alguna orientación con una prueba que me gustaría ejecutar. Tenemos una prueba donde las aves fueron alimentadas con 2 dietas (Control y Tratamiento). Cada semana (Día 7, 14, 21, 28) se pesaron los sujetos para analizar los datos de rendimiento (ganancia de peso, eficiencia alimenticia, mortalidad, etc.). Exactamente el mismo ensayo se repitió en las mismas instalaciones dos meses después, utilizando exactamente las mismas dietas y el mismo protocolo de ensayo. Quiero combinar los resultados de ambos ensayos y analizarlos juntos.
Por favor, ¿alguien puede aconsejarme cómo hacer esto? Supongo que necesitaría agregar prueba, tratamiento y día como efectos fijos y hacerlo a través de la plataforma Fit Model. ¿Está bien? Uno de los ensayos funcionó mejor en general, pero no estoy interesado en qué ensayo funcionó mejor, solo qué tratamiento funcionó mejor en general. ¿Debe agregarse Día como un efecto repetido o hay una opción para hacerlo? Estoy usando JMP, pero no tengo JMP Pro, aunque tengo el complemento de medidas repetidas, pero no estoy seguro de si esto es lo que debería usar.
Además, ¿qué personalidad debo seleccionar y puedo agregar algo como un efecto fijo y aleatorio?
¡Gracias de antemano!
AnalíticaRe: Ajustar modelo: efectos repetidos, fijos y aleatoriosSolo estaba revisando diferentes opciones de visualización.
La granja problemática sin información se estableció en "no".
Re: Ajustar modelo: efectos repetidos, fijos y aleatoriosHola melodía,
Esto se puede hacer en JMP Genomics usando la sección de efectos fijos y aleatorios dentro del cuadro de diálogo ANOVA en la pestaña Modelo (suponiendo que eso es lo que está usando). Se permite anidar variables al igual que JMP. La sintaxis es similar, () en lugar de [], pero uno tiene que escribirlos en lugar de arrastrar y soltar.Consulte el siguiente enlace y observe el enfoque univariante para conocer la sintaxis de definir cómo se anidará el efecto del sujeto dentro del efecto entre sujetos (medicamento). Esto iría a la sección aleatoria, el resto son efectos fijos y van a la sección de Efectos fijos.
http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html
Entonces, para este ejemplo, se vería así en el cuadro de diálogo JMP Genomics ANOVA:
Aquí hay otra explicación de Nesting desde el punto de vista de JMP:
http://www.jmp.com/support/help/Launch_the_Fit_Model_Platform.shtml#65634
Espero que ayude,
cris
Re: Ajustar modelo: efectos repetidos, fijos y aleatoriosHola,
Soy usuario de JMP Genomics. Mi experimento es similar, pero cada sujeto tiene miles de genes para probar con el modelo fila por fila.
Entonces, ¿qué hago con el análisis genómico en un experimento similar?
No puedo completar el factor de sujetos "entre" y "dentro". ¿Cuáles serían los factores aleatorios o fijos? ¿Cómo me decido por eso?
Re: Ajustar modelo: efectos repetidos, fijos y aleatoriosHola @abbiegraham ,
Parece que tienes un experimento de medidas repetidas con un factor entre sujetos (dieta) y un factor dentro del sujeto (tiempo). Podría considerar las diferentes ejecuciones de todo el experimento como otro factor entre sujetos, pero si realmente fueran idénticos, podría ignorar ese hecho, ya que aumentará la complejidad del modelo.
Puede ejecutar este modelo en JMP estándar utilizando Analizar > Ajustar modelo. Configurar los efectos del modelo será más fácil con mi complemento, que parece que ya tiene ( https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Full-Factorial-Repeated-Measures-ANOVA-Add-In/ta-p/23904 ). He adjuntado un conjunto de datos con el formato en el que deben estar los datos.
Verá que he incluido una columna para la ejecución experimental, pero no la usaremos cuando configuremos el modelo. Si estuviera interesado en ver si hay evidencia de diferencias entre los experimentos que hizo con unos meses de diferencia, podría usar esa columna como un efecto entre sujetos (es entre sujetos de la misma manera que la dieta es entre sujetos, no un solo pájaro se mide en ambos niveles del factor).
Para configurar el modelo usando mi complemento, usaremos ID de pájaro como ID de sujeto, Dieta como efecto entre sujetos, tiempo como efecto dentro del sujeto (y asegúrese de que esta columna esté marcada como nominal), y peso como su Y.
Esto devolverá un modelo lineal de efectos mixtos equivalente a un ANOVA estándar de medidas repetidas.
¡Espero que esto ayude!
@Julian
