적합 모델 - 반복, 고정 및 무작위 효과안녕,
내가 실행하고 싶은 테스트와 함께 몇 가지 지침을 기대하고 있습니다. 우리는 새들에게 2가지 식이(제어 및 치료)를 먹인 실험을 했습니다. 매주(7일, 14일, 21일, 28일) 피험자의 체중을 측정하여 성능 데이터(체중 증가, 사료 효율, 사망률 등)를 분석했습니다. 2개월 후 동일한 시설에서 정확히 동일한 식단과 시험 프로토콜을 사용하여 동일한 시험을 반복했습니다. 두 시도의 결과를 결합하여 함께 분석하고 싶습니다.
누군가이 작업을 수행하는 방법을 조언 해 주시겠습니까? 고정 효과로 시도, 치료 및 날짜를 추가하고 Fit Model 플랫폼을 통해 이를 수행해야 할 것 같습니다. 맞습니까? 시험 중 하나가 일반적으로 더 잘 수행되었지만 어떤 시험이 더 잘 수행되었는지에 관심이 없으며 어떤 치료가 전반적으로 더 잘 수행되었는지에만 관심이 있습니다. Day를 반복 효과로 추가해야 합니까, 아니면 이를 수행할 수 있는 옵션이 있습니까? JMP를 사용하고 있지만 JMP Pro는 없지만 반복 측정 추가 기능은 있지만 이것이 내가 사용해야 하는 것인지 확실하지 않습니다.
또한- 어떤 성격을 선택해야 하며 고정 및 무작위 효과로 무언가를 추가할 수 있습니까?
미리 감사드립니다!
해석학Re: Fit Model - 반복, 고정 및 무작위 효과다른 시각화 옵션을 확인하고 있었습니다.
정보가 없는 문제 농장은 "아니오"로 설정되었습니다.
Re: Fit Model - 반복, 고정 및 무작위 효과안녕 멜로디,
모델 탭 아래의 ANOVA 대화 상자에 있는 고정 및 무작위 효과 섹션을 사용하여 JMP Genomics에서 이 작업을 수행할 수 있습니다(사용 중인 것으로 가정). 하나는 JMP가 할 수 있는 것처럼 변수를 중첩할 수 있습니다. 구문은 [] 대신 ()와 유사하지만 드래그 앤 드롭 대신 입력해야 합니다.아래 링크를 확인하고 주제 효과가 주제 효과(약물) 사이에 중첩되는 방식을 정의하는 구문에 대한 일변량 접근법을 살펴보십시오. 이것은 임의 섹션으로 이동하고 나머지는 고정 효과이며 고정 효과 섹션으로 이동합니다.
http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html
따라서 이 예에서는 JMP Genomics ANOVA 대화 상자에서 다음과 같이 표시됩니다.
다음은 JMP 관점에서 중첩에 대한 또 다른 설명입니다.
http://www.jmp.com/support/help/Launch_the_Fit_Model_Platform.shtml#65634
도움이 되는 희망,
크리스
Re: Fit Model - 반복, 고정 및 무작위 효과안녕,
저는 JMP Genomics 사용자입니다. 내 실험은 비슷하지만 각 대상에는 행 단위 행 모델로 테스트할 수천 개의 유전자가 있습니다.
그렇다면 유사한 실험에서 유전체학 분석으로 무엇을 해야 할까요?
나는 "사이"와 "내" 주제 요소를 채우지 않습니다. 랜덤 또는 고정 요인은 무엇입니까? 어떻게 결정합니까?
Re: Fit Model - 반복, 고정 및 무작위 효과안녕 @Abbiegraham ,
하나의 개체 간 요인(식이 요법)과 하나의 개체 내 요인(시간)을 사용하여 반복 측정 실험을 하는 것 같습니다. 전체 실험의 다른 실행을 다른 개체 간 요소로 고려할 수 있지만 실제로 동일하다면 모델의 복잡성이 증가하므로 해당 사실을 무시할 수 있습니다.
분석 > 모델 적합을 사용하여 표준 JMP에서 이 모델을 실행할 수 있습니다. 내 추가 기능을 사용하면 모델 효과를 설정하는 것이 더 쉬울 것입니다. 이미 있는 것 같습니다( https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Full-Factorial-Repeated-Measures-ANOVA-Add-In/ta-p/23904 ). 데이터가 있어야 하는 형식으로 데이터 세트를 첨부했습니다.
실험 실행을 위해 열을 포함했음을 알 수 있지만 모델을 설정할 때 사용하지 않을 것입니다. 몇 달 간격으로 수행한 실험 간의 차이에 대한 증거가 있는지 확인하는 데 관심이 있다면 해당 열을 대상 간 효과로 사용할 수 있습니다(식단이 대상 간과 같은 방식으로 대상 간입니다. 한 마리의 새는 요인의 두 수준에서 모두 측정됩니다.
내 추가 기능을 사용하여 모델을 설정하기 위해 Bird ID를 주제 ID로, Diet를 주제 간 효과로, 시간을 주제 내 효과로 사용합니다(이 열이 명목으로 표시되었는지 확인). 체중을 Y로 합니다.
이렇게 하면 표준 반복 측정 ANOVA와 동일한 선형 혼합 효과 모델이 반환됩니다.
이게 도움이 되길 바란다!
@줄리안
