モデルの適合 - 反復効果、固定効果、ランダム効果こんにちは、
実行したいテストに関して何らかのガイダンスが得られることを期待しています。 私たちは鳥に 2 つの飼料 (対照と治療) を与えた試験を行っています。 毎週（7、14、21、28日目）被験者の体重を測定し、成績データ（体重増加、飼料効率、死亡率など）を分析しました。 まったく同じ試験が、2 か月後に同じ施設で、まったく同じ食事と試験プロトコルを使用して繰り返されました。 両方の試験の結果を組み合わせて分析したいと考えています。
誰かこれを行う方法をアドバイスしてもらえますか? トライアル、治療、日を固定効果として追加し、これを Fit Model プラットフォーム経由で行う必要があると思います。 そうですか？ 試験のうちの 1 つが全体的により良い成績を収めましたが、私はどの試験の成績がより良かったかには興味がなく、どの治療法が全体的により良い成績を収めたかにのみ興味があります。 Day を繰り返し効果として追加する必要がありますか、それともこれを行うオプションはありますか? JMP を使用していますが、JMP Pro は持っていません。繰り返し測定アドインはありますが、これを使用すべきかどうかはわかりません。
また、どのような性格を選択すればよいですか? 固定効果とランダム効果の両方として何かを追加できますか?
前もって感謝します！
品質およびプロセスエンジニアリング結果の共有と伝達Re: モデルの適合 - 反復効果、固定効果、ランダム効果さまざまな視覚化オプションをチェックしていました。
情報のない問題のあるファームは「いいえ」に設定されました。
Re: モデルの適合 - 反復効果、固定効果、ランダム効果こんにちは、メロディーさん
これは、JMP Genomics の [モデル] タブの [ANOVA] ダイアログ内の [固定効果] および [ランダム効果] セクションを使用して行うことができます (それを使用していると仮定します)。 JMP と同様に、変数をネストすることができます。 構文は [] ではなく () と似ていますが、ドラッグ アンド ドロップではなく入力する必要があります。以下のリンクをチェックし、被験者間の効果 (薬物) 内で被験者の効果がどのようにネストされるかを定義する構文については、一変量アプローチを参照してください。 これはランダムセクションに入り、残りは固定効果であり、固定効果セクションに入ります。
http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html
したがって、この例では、JMP Genomics ANOVA ダイアログでは次のようになります。
JMP の観点から見たネストの別の説明は次のとおりです。
http://www.jmp.com/support/help/Launch_the_Fit_Model_Platform.shtml#65634
お役に立てば幸いです。
クリス
Re: モデルの適合 - 反復効果、固定効果、ランダム効果こんにちは、
私は JMP Genomics ユーザーです。 私の実験も似ていますが、各被験者には数千の遺伝子があり、行ごとのモデルでテストされます。
では、同様の実験でゲノム解析を行うにはどうすればよいでしょうか?
被験者の「間」と「内」の要素を埋めることができません。 ランダム要素または固定要素は何でしょうか? それはどうやって決めればいいのでしょうか？
Re: モデルの適合 - 反復効果、固定効果、ランダム効果こんにちは@アビーグラハム、
1 つの被験者間要因 (食事) と 1 つの被験者内要因 (時間) を使用して反復測定実験を行っているようです。 実験全体の異なる実行は、別の被験者間の要因であると考えることもできますが、それらが本当に同一である場合は、モデルの複雑さが増すため、その事実は無視するかもしれません。
[分析] > [モデルの適合] を使用して、標準 JMP でこのモデルを実行できます。 モデル効果の設定は、私のアドインを使用すると簡単になります。すでにお持ちのようです ( https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Full-Factorial-Repeated-Measures-ANOVA-Add-In/ta-p/23904 ）。 データが必要な形式のデータセットを添付しました。
実験実行用の列が含まれていることがわかりますが、モデルを設定するときにはそれを使用しません。 数か月おきに行った実験間に違いがあるかどうかを知りたい場合は、その列を被験者間の効果として使用できます (食事が被験者間であるのと同じように、被験者間でも効果があります。いいえ) 1 羽の鳥は因子の両方のレベルで測定されます)。
アドインを使用してモデルを設定するには、対象 ID として鳥 ID、対象間の効果として食事、対象内効果として時間を使用します (そして、この列が公称としてマークされていることを確認してください)。そしてあなたのYとしての体重。
これにより、標準的な反復測定 ANOVA と同等の線形混合効果モデルが返されます。
これがお役に立てば幸いです!
@ジュリアン
