Adatta modello: effetti ripetuti, fissi e casualiCIAO,
Spero in qualche consiglio su un test che vorrei eseguire. Abbiamo effettuato una prova in cui gli uccelli sono stati alimentati con 2 diete (controllo e trattamento). Ogni settimana (giorni 7, 14, 21, 28) i soggetti venivano pesati per analizzare i dati sulle prestazioni (aumento di peso, efficienza alimentare, mortalità ecc.). La stessa identica sperimentazione è stata ripetuta nella stessa struttura due mesi dopo, utilizzando esattamente la stessa dieta e lo stesso protocollo di sperimentazione. Voglio combinare i risultati di entrambi gli studi e analizzarli insieme.
Per favore, qualcuno può consigliare come farlo? Immagino che dovrei aggiungere prova, trattamento e giorno come effetti fissi e farlo tramite la piattaforma Fit Model. È giusto? Uno degli studi ha avuto risultati migliori in generale, ma non mi interessa sapere quale studio ha avuto risultati migliori, ma solo quale trattamento ha avuto risultati migliori nel complesso. Il Giorno dovrebbe essere aggiunto come effetto ripetuto o c'è un'opzione per farlo? Sto utilizzando JMP, ma non ho JMP Pro, anche se ho il componente aggiuntivo Misure ripetute, ma non sono sicuro che sia quello che dovrei utilizzare.
Inoltre, quale personalità dovrei selezionare e posso aggiungere qualcosa sia come effetto fisso che come effetto casuale?
Grazie in anticipo!
Ingegneria della qualità e dei processiCondivisione e comunicazione dei risultatiRe: Adatta modello: effetti ripetuti, fissi e casualiStavo solo controllando diverse opzioni di visualizzazione.
La farm problematica senza informazioni è stata impostata su "no".
Re: Adatta modello: effetti ripetuti, fissi e casualiCiao Melody,
Questa operazione può essere eseguita in JMP Genomics utilizzando la sezione Effetti fissi e Casuali nella finestra di dialogo ANOVA nella scheda Modello (supponendo che sia ciò che si sta utilizzando). È consentito nidificare le variabili proprio come fa JMP. La sintassi è simile, () invece di [], ma è necessario digitarli invece di trascinarli.Controlla il collegamento sottostante e osserva l'approccio univariato per la sintassi per definire come l'effetto del soggetto verrà nidificato all'interno dell'effetto tra soggetti (farmaco). Questo andrebbe nella sezione casuale, il resto sono effetti fissi e andrebbero nella sezione Effetti fissi.
http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html
Quindi, in questo esempio, sarebbe simile a questo nella finestra di dialogo ANOVA di JMP Genomics:
Ecco un'altra spiegazione del Nesting dal punto di vista di JMP:
http://www.jmp.com/support/help/Launch_the_Fit_Model_Platform.shtml#65634
Spero che aiuti,
Chris
Re: Adatta modello: effetti ripetuti, fissi e casualiCIAO,
Sono un utente JMP Genomics. Il mio esperimento è simile ma ogni soggetto ha migliaia di geni da testare con il modello riga per riga.
Allora cosa faccio con l'analisi genomica in un esperimento simile?
Non riesco a riempire il fattore "tra" e "dentro" i soggetti. Quali sarebbero i fattori casuali o fissi? Come lo decido?
Re: Adatta modello: effetti ripetuti, fissi e casualiCIAO @Abbiegraham ,
Sembra che tu abbia un esperimento di misure ripetute con un fattore tra soggetti (dieta) e un fattore entro soggetti (tempo). Potresti considerare le diverse esecuzioni dell'intero esperimento un altro fattore tra soggetti, ma se fossero davvero identiche potrei ignorare questo fatto poiché aumenterebbe la complessità del modello.
È possibile eseguire questo modello in JMP standard utilizzando Analizza > Adatta modello. L'impostazione degli effetti del modello sarà più semplice utilizzando il mio componente aggiuntivo, che sembra tu abbia già ( https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Full-Factorial-Repeated-Measures-ANOVA-Add-In/ta-p/23904 ). Ho allegato un set di dati con il formato in cui devono essere i dati.
Vedrai che ho incluso una colonna per l'esecuzione sperimentale, ma non la utilizzeremo quando imposteremo il modello. Se fossi interessato a vedere se ci sono prove di differenze tra gli esperimenti che hai fatto a distanza di pochi mesi, potresti usare quella colonna come effetto tra soggetti (è tra soggetti nello stesso modo in cui la dieta lo è tra soggetti - no singolo uccello viene misurato ad entrambi i livelli del fattore).
Per impostare il modello utilizzando il mio componente aggiuntivo, utilizzeremo Bird ID come ID soggetto, Dieta come effetto tra soggetti, tempo come effetto entro soggetto (e assicuriamoci che questa colonna sia contrassegnata come nominale), e peso come Y.
Ciò restituirà un modello lineare a effetti misti equivalente a un'ANOVA a misure ripetute standard.
Spero che aiuti!
@giuliano
