Ajuster le modèle - Effets répétés, fixes et aléatoiresSalut,
J'espère avoir des conseils avec un test que j'aimerais exécuter. Nous avons un essai où les oiseaux ont été nourris avec 2 régimes (contrôle et traitement). Chaque semaine (jours 7, 14, 21, 28), les sujets ont été pesés pour analyser les données de performance (gain de poids, efficacité alimentaire, mortalité, etc.). Le même essai a été répété dans le même établissement deux mois plus tard, en utilisant exactement le même régime alimentaire et le même protocole d'essai. Je souhaite combiner les résultats des deux essais et les analyser ensemble.
S'il vous plaît, quelqu'un peut-il vous indiquer comment procéder ? Je suppose que je devrais ajouter l'essai, le traitement et le jour comme effets fixes et le faire via la plateforme Fit Model. Est-ce correct? L'un des essais a donné de meilleurs résultats en général, mais je ne m'intéresse pas à savoir lequel des essais a donné de meilleurs résultats, mais seulement quel traitement a donné de meilleurs résultats dans l'ensemble. Day devrait-il être ajouté comme effet répété ou existe-t-il une option pour le faire ? J'utilise JMP, mais je n'ai pas JMP Pro, bien que j'aie le complément de mesures répétées, mais je ne sais pas si c'est ce que je devrais utiliser.
De plus, quelle personnalité dois-je sélectionner et puis-je ajouter quelque chose comme effet à la fois fixe et aléatoire ?
Merci d'avance!
Ingénierie Qualité et ProcédésPartager et communiquer les résultatsRe : Ajuster le modèle – Effets répétés, fixes et aléatoiresJe vérifiais simplement différentes options de visualisation.
La ferme à problèmes sans information a été définie sur "non".
Re : Ajuster le modèle – Effets répétés, fixes et aléatoiresSalut Mélodie,
Cela peut être fait dans JMP Genomics en utilisant la section Effets fixes et aléatoires de la boîte de dialogue ANOVA sous l'onglet Modèle (en supposant que c'est ce que vous utilisez). On est autorisé à imbriquer des variables tout comme JMP le peut. La syntaxe est similaire, () au lieu de [], mais il faut les saisir au lieu de glisser-déposer.Consultez le lien ci-dessous et consultez l'approche univariée pour connaître la syntaxe permettant de définir comment l'effet du sujet sera imbriqué dans l'effet entre les sujets (médicament). Cela irait dans la section aléatoire, le reste serait des effets fixes et irait dans la section Effets fixes.
http://www.jmp.com/support/notes/30/584.html
Ainsi, dans cet exemple, cela ressemblerait à ceci dans la boîte de dialogue JMP Genomics ANOVA :
Voici une autre explication du Nesting du point de vue de JMP :
http://www.jmp.com/support/help/Launch_the_Fit_Model_Platform.shtml#65634
J'espère que cela pourra aider,
Chris
Re : Ajuster le modèle – Effets répétés, fixes et aléatoiresSalut,
Je suis un utilisateur de JMP Genomics. Mon expérience est similaire mais chaque sujet possède des milliers de gènes à tester avec le modèle ligne par ligne.
Alors, que dois-je faire avec l’analyse génomique dans une expérience similaire ?
Je ne peux pas remplir le facteur « entre » et « à l'intérieur » des sujets. Quels seraient les facteurs aléatoires ou fixes ? Comment puis-je en décider ?
Re : Ajuster le modèle – Effets répétés, fixes et aléatoiresSalut @Abbiegraham ,
Il semble que vous ayez une expérience de mesures répétées avec un facteur inter-sujet (régime alimentaire) et un facteur intra-sujet (temps). Vous pourriez considérer les différentes exécutions de l'expérience entière comme un autre facteur entre les sujets, mais si elles étaient vraiment identiques, je pourrais ignorer ce fait car cela augmenterait la complexité du modèle.
Vous pouvez exécuter ce modèle dans JMP standard en utilisant Analyser > Ajuster le modèle. La configuration des effets du modèle sera plus facile en utilisant mon complément, que vous semblez déjà avoir ( https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Full-Factorial-Repeated-Measures-ANOVA-Add-In/ta-p/23904 ). J'ai joint un ensemble de données avec le format dans lequel les données doivent être.
Vous verrez que j'ai inclus une colonne pour l'exécution expérimentale, mais nous ne l'utiliserons pas lors de la configuration du modèle. Si vous souhaitez voir s'il existe des preuves de différences entre les expériences que vous avez faites à quelques mois d'intervalle, vous pouvez utiliser cette colonne comme effet entre sujets (c'est entre sujets de la même manière que le régime est entre sujets - non un seul oiseau est mesuré aux deux niveaux du facteur).
Pour configurer le modèle à l'aide de mon complément, nous utiliserons Bird ID comme ID de sujet, Diet comme effet entre-sujets, le temps comme effet intra-sujet (et assurez-vous que cette colonne est marquée comme nominale), et poids comme votre Y.
Cela renverra un modèle linéaire à effets mixtes équivalent à une ANOVA à mesures répétées standard.
J'espère que ça aide!
@julien
