一度に複数の遺伝子/列の比例モデルをフィットこんにちは
一度に複数の列/遺伝子のリスク比とp値を返すスクリプトを作成する方法があるかどうかを知りたいです。
複数の列（遺伝子）と複数の行（患者）を含むファイルがあるということです。発現値がUPまたはDOWNに分類されている100個の遺伝子を分析する必要があり、ダイアログボックスで毎回異なる遺伝子を選択する必要なく、それらすべてのリスク比を一度に取得する必要があります。スクリプトエディタを使用しますが、必要な列ごとにこの機能を自動化することはできません。
Re: Fit proportional Model for multiple genes/column at onceNo Clue? Even with a script in R?
Re: Fit proportional Model for multiple genes/column at onceHI @Confa ,
Since the genes are responses, you would put all of them into the Y section of Fit Model. You do not have to put them one at a time. Select them all in the Select Columns section can drag and drop them into Y.
Is that what you were looking for?
Chris
再：一度に複数の遺伝子/列の比例モデルをフィットこんにちはクリス、そうではありません。
Fit XYではなくFit Proportiona Hazardモードを使用して、150を超える遺伝子（上方制御対下方制御）のリスク比（死亡および死亡までの時間）を計算する必要があります。
これがプラットフォームです。通常、ボックスに「遺伝子」または変数を1つ入れると、その遺伝子のRRが得られます。もしあなたが複数の遺伝子あるいは変数を入れるならば、あなたは多変数モデルを得るでしょう、それぞれの分離された変数のための単一のRRではありません。
再：一度に複数の遺伝子/列の比例モデルをフィットHI @Confa ,
Try Stacking all 150 genes. You will have two new columns. Something like Gene Name and Direction. Then use the By field to put the gene name in there and then the direction in teh Model Effects section. You will get a single fit for each gene.
Chris
