Nivel: intermedio
Función laboral: Analista / Científico / Ingeniero
Paul Fogel, consultor, consultor de Paul Fogel
Jean-Luc Blachon, estadístico sénior, Investigación preclínica, Ipsen
En los ensayos clínicos, el análisis exploratorio de datos longitudinales multivariados es clave para la identificación de subgrupos de pacientes que tienen algunas de las características estudiadas, por ejemplo, biomarcadores, que comparten un curso temporal similar. En el contexto de la cinética de evolución tumoral, presentamos un nuevo complemento JMP de factorización de tensor no negativo (NTF), que permite la identificación de dichos subgrupos de pacientes y la selección simultánea de parámetros con un curso de tiempo prototípico. Mostramos que las características seleccionadas se pueden utilizar posteriormente para modelar la evolución del tumor. Además, gracias a la naturaleza no supervisada de nuestro enfoque, las estimaciones resultantes de la supervivencia general son robustas al sobreajuste. El complemento proporciona visualizaciones dinámicas de mapas de calor que son significativas para el biólogo y el médico. Gracias a la interoperabilidad de JMP 14 Python, se ejecuta en segundo plano un paquete NTF rápido escrito en el lenguaje Python 3.6. Finalmente, los resultados de NTF se comparan con los logrados por la plataforma de análisis funcional JMP 14 y un paquete R que realiza el modelado de rutas.