Level: Mittelstufe
Job Funktion: Analyst / Wissenschaftler / Ingenieur
Paul Fogel, Berater, Paul Fogel Berater
Jean-Luc Blachon, leitender Statistiker, Präklinische Forschung, Ipsen
In klinischen Studien ist die explorative Analyse multivariater Längsschnittdaten der Schlüssel zur Identifizierung von Patientenuntergruppen, bei denen einige der untersuchten Merkmale, z. B. Biomarker, einen ähnlichen zeitlichen Verlauf aufweisen. Im Zusammenhang mit der Kinetik der Tumorentwicklung präsentieren wir eine neue nicht-negative Tensorfaktorisierung (NTF) mit JMP-Zusatz, die die Identifizierung solcher Patientenuntergruppen und die gleichzeitige Auswahl von Parametern mit einem prototypischen Zeitverlauf ermöglicht. Wir zeigen, dass ausgewählte Merkmale anschließend zur Modellierung der Tumorentwicklung verwendet werden können. Darüber hinaus sind die resultierenden Schätzungen des Gesamtüberlebens dank des unbeaufsichtigten Charakters unseres Ansatzes robust gegenüber Überanpassungen. Das Add-In bietet dynamische Heatmap-Visualisierungen, die für den Biologen und Kliniker von Bedeutung sind. Dank der Interoperabilität von JMP 14 Python wird im Hintergrund ein schnelles NTF-Paket ausgeführt, das in der Sprache Python 3.6 geschrieben ist. Schließlich werden die NTF-Ergebnisse mit denen verglichen, die von der JMP 14-Funktionsanalyseplattform und einem R-Paket erzielt wurden, das die Pfadmodellierung durchführt.
