Niveau: intermédiaire
Fonction: Analyste / Scientifique / Ingénieur
Industrie: sciences de la vie
Paul Fogel, consultant, Paul Fogel consultant
Jean-Luc Blachon, Statisticien Senior, Recherche préclinique, Ipsen
Dans les essais cliniques, l'analyse exploratoire de données longitudinales multivariées est essentielle pour l'identification de sous-groupes de patients présentant certaines des caractéristiques étudiées, par exemple des biomarqueurs, partagés au cours d'une période similaire. Dans le contexte de la cinétique d'évolution tumorale, nous présentons un nouveau complément JMP, la factorisation du tenseur non négatif (NTF), qui permet d'identifier ces sous-groupes de patients et de sélectionner simultanément des paramètres présentant une évolution temporelle. Nous montrons que des caractéristiques sélectionnées peuvent ensuite être utilisées pour modéliser l'évolution de la tumeur. De plus, grâce à la nature non supervisée de notre approche, les estimations résultantes de la survie globale sont robustes au surajustement. Le complément fournit des visualisations dynamiques de cartes thermiques significatives pour le biologiste et le clinicien. Grâce à l'interopérabilité JMP 14 Python, un package NTF rapide écrit en langage Python 3.6 est exécuté en arrière-plan. Enfin, les résultats NTF sont comparés à ceux obtenus par la plate-forme d’analyse fonctionnelle JMP 14 et une modélisation de chemin d’exécution R package.
