El científico de aplicaciones de campo Doug Robinson y la ejecutiva de cuentas de JMP Susan Glick asistieron recientemente a una excelente conferencia sobre secuenciación de próxima generación, organizada por el cliente de JMP Genomics Centro Nacional de Recursos Genómicos . Esta conferencia, celebrada del 6 al 7 de marzo en Santa Fe, Nuevo México, fue patrocinada por JMP Genomics , Illumina, y Roche, entre otros. JMP Genomics fue invitado a exhibir por Faye Schilkey, Directora Asociada del Centro de Secuenciación del Genoma en NCGR. NCGR tiene varios secuenciadores de próxima generación de Illumina, y una serie de proyectos de colaboración en curso con otras instituciones, destinados a probar las capacidades de esta tecnología relativamente nueva.
JMP Genomics fue la única compañía de software que expuso en la conferencia, lo que brindó una excelente oportunidad para aprender más sobre la tecnología de los oradores destacados y los usuarios finales de las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento. Me decepcionó que no pudiera asistir para aprender más sobre esta área en crecimiento, pero es difícil salir de la ciudad tan tarde en el ciclo de lanzamiento. Con el lanzamiento de JMP Genomics 3.2 en un futuro muy cercano, ha habido mucha actividad en varios frentes: marketing, ventas, pruebas, documentación y desarrollo, por nombrar algunos.
Una vez finalizada la conferencia, el científico de aplicaciones de campo Jordan Hiller se unió a Doug y Susan en Nuevo México para el entrenamiento de JMP Genomics en NCGR. Creo que todo el mundo estaba sorprendido y complacido de la facilidad con la que los informes de consulta de expresiones de NCGR's Alfeo la secuencia de procesamiento de secuencias se podría importar a JMP Genomics y ejecutar las mismas herramientas de evaluación de calidad, normalización y ANOVA que los clientes de JMP Genomics aplican regularmente a otros conjuntos de datos de expresión. Los desarrolladores de Alpheus de NCGR han escrito una utilidad de salida para crear un conjunto de datos procesados en el formato típico de JMP Genomics, y los científicos de NCGR nos han dicho que las muestras de valores atípicos son fáciles de identificar debido a las diversas representaciones visuales de los datos que ofrecemos en nuestros procesos de control de calidad. Como puede imaginar, este informe trajo sonrisas a las caras de nuestro equipo de desarrollo de JMP Genomics. ¡Esperamos escuchar mucho más de NCGR a medida que avanzan sus estudios! Stephen Kingsmore de NCGR presentará parte de este trabajo en curso, incluido el análisis de los datos de Alpheus utilizando JMP Genomics, en el Conferencia de tecnologías de secuenciación de próxima generación Patrocinado por CHI en San Diego del 23 al 24 de abril.
