Doug Robinson, esperto di applicazioni sul campo, Susan Glick, account manager di JMP, ha recentemente partecipato a un'eccellente conferenza sul sequenziamento di prossima generazione, organizzato dal cliente di JMP Genomics Centro nazionale per le risorse genomiche . Questa conferenza, tenutasi dal 6 al 7 marzo a Santa Fe, NM, è stata sponsorizzata da Genomica di JMP , Illumina e Roche, tra gli altri. JMP Genomics è stata invitata ad esporre da Faye Schilkey, Associate Director del Genome Sequencing Center di NCGR. NCGR ha diversi sequenziatori di prossima generazione Illumina e una serie di progetti collaborativi in corso con altre istituzioni, volti a sondare le capacità di questa relativamente nuova tecnologia.
JMP Genomics è stata l'unica azienda di software presente alla conferenza, che ha fornito un'eccellente opportunità per saperne di più sulla tecnologia degli altoparlanti e degli utenti finali delle tecnologie di sequenziamento ad alto throughput. Sono rimasto deluso dal fatto che non potevo frequentare me stesso per saperne di più su questa area in crescita, ma è difficile uscire dalla città a fine del ciclo di rilascio. Con JMP Genomics 3.2 in uscita nel prossimo futuro, ci sono state molte attività su vari fronti: marketing, vendite, test, documentazione e sviluppo, per citarne alcuni.
Al termine della conferenza, lo scienziato delle applicazioni sul campo, Jordan Hiller, si è unito a Doug e Susan nel New Mexico per l'addestramento di JMP Genomics presso NCGR. Penso che tutti siano rimasti sorpresi e contenti di quanto facilmente le query di espressione riportino da NCGR Alpheus la pipeline di elaborazione delle sequenze può essere importata in JMP Genomics e sottoposta agli stessi strumenti di valutazione della qualità, normalizzazione e ANOVA. I clienti di JMP Genomics si applicano regolarmente ad altri set di dati di espressioni. Gli sviluppatori Alpheus di NCGR hanno ora creato un'utilità di output per creare un set di dati elaborato nel tipico formato Genomics di JMP e gli scienziati di NCGR ci hanno detto che i campioni di valori anomali sono facili da identificare a causa delle varie rappresentazioni visive dei dati che offriamo nei nostri processi di controllo qualità. Come puoi immaginare, questo rapporto ha fatto sorridere i volti del nostro team di sviluppo Genomics di JMP. Non vediamo l'ora di sentire molti altri da NCGR mentre progrediscono i loro studi! Stephen Kingsmore di NCGR presenterà alcuni di questi lavori in corso, inclusa l'analisi dei dati di Alpheus utilizzando JMP Genomics, al Conferenza sulle tecnologie di sequenziamento di prossima generazione sponsorizzato da CHI a San Diego il 23-24 aprile.
