Der Applikationswissenschaftler Doug Robinson und JMP Account Executive Susan Glick nahmen kürzlich an einer hervorragenden Konferenz zur Sequenzierung der nächsten Generation teil, die vom JMP Genomics-Kunden organisiert wurde Nationales Zentrum für Genomressourcen . Diese Konferenz, die vom 6. bis 7. März in Santa Fe, New York, stattfand, wurde gesponsert von JMP Genomics , Illumina und Roche unter anderem. JMP Genomics wurde von Faye Schilkey, Associate Director des Genome Sequencing Center am NCGR, eingeladen. NCGR verfügt über mehrere Illumina Next-Gen-Sequenzer und eine Reihe laufender Kooperationsprojekte mit anderen Institutionen, um die Fähigkeiten dieser relativ neuen Technologie zu untersuchen.
JMP Genomics war das einzige Software-Unternehmen, das auf der Konferenz ausstellte. Dies bot eine ausgezeichnete Gelegenheit, mehr über die Technologie von vorgestellten Lautsprechern und Endbenutzern von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien zu erfahren. Ich war enttäuscht, dass ich nicht selbst dabei war, mehr über dieses wachsende Gebiet zu erfahren, aber es ist schwer, die Stadt erst spät im Release-Zyklus zu verlassen. Da JMP Genomics 3.2 in naher Zukunft auf den Markt gebracht werden soll, gab es zahlreiche Aktivitäten an verschiedenen Fronten - Marketing, Vertrieb, Testen, Dokumentation und Entwicklung, um nur einige zu nennen.
Nach dem Ende der Konferenz kam der Feldanwendungswissenschaftler Jordan Hiller zu Doug und Susan in New Mexico, um an der NCGR für JMP Genomics zu trainieren. Ich denke, alle waren überrascht und freuten sich, wie leicht die Ausdrucksabfrage von NCGRs abfragt Alpheus Die Sequenzverarbeitungs-Pipeline könnte in JMP Genomics importiert werden und die gleichen Qualitätsbewertungs-, Normalisierungs- und ANOVA-Tools durchlaufen, die JMP Genomics-Kunden regelmäßig auf andere Ausdrucksdatensätze anwenden. Die Alpheus-Entwickler von NCGR haben jetzt ein Ausgabewerkzeug geschrieben, um einen verarbeiteten Datensatz im typischen JMP-Genomics-Format zu erstellen, und Wissenschaftler des NCGR haben uns mitgeteilt, dass Ausreißerproben aufgrund der verschiedenen visuellen Darstellungen der Daten, die wir in unseren QC-Prozessen anbieten, leicht zu identifizieren sind. Wie Sie sich vorstellen können, brachte dieser Bericht ein Lächeln auf die Gesichter unseres JMP Genomics-Entwicklungsteams. Wir freuen uns darauf, noch viel mehr von NCGR zu hören, als ihr Studium fortschreitet! Stephen Kingsmore von NCGR wird einige dieser laufenden Arbeiten vorstellen, einschließlich der Analyse von Alpheus-Daten mit JMP Genomics auf der Next Generation Sequencing Technologies Konferenz gesponsert von CHI in San Diego vom 23. bis 24. April.
