Was ist heute der heißeste Bereich der wissenschaftlichen Forschung? Thomson Reuters Science Watch sagt, es ist Genetik .
In einem Artikel mit dem Titel "Die weichere Seite der Genomik" Drug Discovery & Entwicklung Magazin beschreibt, wie die heutigen Datenmanagement- und Computertools Forscher tiefer in die Gene eintauchen lassen. Der Artikel beschreibt JMP Genomics unterstreicht seine statistische Leistungsfähigkeit, Flexibilität, die Erweiterung der Genom-Fähigkeiten und die prädiktive Modellierung. Shannon Conners, ein Produktmanager für JMP Biowissenschaften diskutiert, wie Forscher in der Wirkstoffforschung und -entwicklung Genomics-Software verwenden könnten, und ordnet diese Anforderungen den neuesten Verbesserungen von JMP Genomics zu:
Die zunehmende Komplexität der Genomforschung erfordert auch neue Wege zur Analyse der Ergebnisse. "Viele Studien werden jetzt auf der Ebene des gesamten Genoms durchgeführt", sagt Mindy Zhang von Genzyme. "Daher ist es wichtig, dass Software ein umfassendes Statistik-Tool enthält."Um diese statistische Leistung zu erhalten, verwenden Zhang und ihre Kollegen JMP Genomics von SAS (Cary, NC). Laut Shannon Conners, einem Produktmanager für JMP Life Sciences, muss die neueste Version von JMP Genomics 5 mit einer Reihe von Benutzern umgehen. "Es gibt Biologen auf einer Bank, die Genomanalyse und Software benötigen, um ihre Daten zu verstehen", sagt sie. "Es gibt Biostatistiker, die noch detailliertere Analysen durchführen wollen." Diese Breite der Anwendungen schafft eine Herausforderung.
Conners erklärt es so: "Sie benötigen Workflows, die für Nicht-Experten vereinfacht sind, aber ausreichend Flexibilität und Offenheit des Codes bieten, um Biostatistiker zufrieden zu stellen." Um diese Kluft zu überwinden, hat SAS JMP Genomics mit einer offenen Architektur entwickelt. Wenn ein Biostatistiker "unter die Haube schauen" will, ist es möglich. Für einen Nichtexperten, der nur "den Motor laufen lassen" will, ist das auch möglich.
Die neue Version von JMP Genomics enthält neue Werkzeuge für Verknüpfungskarten und andere Verbesserungen. Sie können mehr über das lesen JMP-Website oder in Die letzten Blogbeiträge von Shannon .
Doug schrieb:
Die Sequenzierung der nächsten Generation hat sicherlich den Bedarf nach mehr Fähigkeit zur Datenverarbeitung erhöht. Es wäre interessant zu sehen, wie die Sequenzierung der dritten Generation die Softwareanforderungen beeinflusst.