Sto scrivendo questo post sul blog mentre sono sull'aereo, al ritorno da San Diego dopo il Conferenza ASHG (American Society of Human Genetics per voi tipi non genetici). Nonostante gli incendi che bruciavano nell'area e le perdite subite da così tante persone nella regione, gli incontri procedevano come previsto. Sembrava un po 'surreale per noi tutti che nel centro vicino al centro congressi, così poco è stato colpito, con l'eccezione dell'aria, che era spiacevole da respirare a causa del fumo e della cenere. Mentre l'aereo si avvicinava a San Diego, abbiamo dato un'occhiata al fumo che ricopriva la regione e alcuni scorci di fuochi ancora accesi.
Ci è stato costantemente ricordato che eravamo vicini a una zona disastrata mentre i partecipanti ASHG locali hanno parlato di evacuazioni obbligatorie e volontarie e di case perse o quasi perse. Una persona ci ha riferito che la sua cassetta postale è stata cantata, ma la sua casa è stata risparmiata! Sfortunatamente, molti non furono così fortunati. Abbiamo incontrato altri residenti di San Diego che soggiornavano nel nostro hotel dopo aver lasciato le loro case. Molti avevano bambini piccoli e animali domestici con loro. I nostri cuori vanno a chiunque stia affrontando gli effetti in corso di questo disastro naturale.
Per l'amor di Filadelfia, spero che l'incontro dell'ASHG del prossimo anno manchi di ricordi di calamità naturali. Gli incontri dell'ASHG dello scorso anno (svoltisi a New Orleans un anno dopo Katrina) si sono svolti nel centro congressi parzialmente rinnovato dove si sono radunati così tanti durante le conseguenze dell'allagamento di Katrina. Sebbene il quartiere francese e l'area vicino al centro congressi di New Orleans non siano stati pesantemente colpiti, abbiamo visto molti altri quartieri che erano stati devastati dalle inondazioni.
Nonostante la tragedia circostante, gli incontri sono stati davvero fantastici. Doug Robinson e io siamo stati contenti di essere stati raggiunti da altri tre membri del team JMP Genomics, che ci hanno dato tutto il tempo per parlare con i clienti e i potenziali utenti, partecipare a conferenze e fare rete con i partner. Siamo stati così felici di avere tanti utenti di SAS / Genetics e JMP Genomics che si sono fermati allo stand! È stato bello sentir parlare di quello che stavano facendo e di come il nostro software li sta aiutando con le loro analisi.
C'è stato un grande interesse per la nuova funzionalità del numero di copie che abbiamo aggiunto Genomica di JMP 3.1. Copia funzionalità numero, e le funzionalità di associazione di tutto il genoma che abbiamo aggiunto per la versione 3.0 erano argomenti caldi di conversazione con i partecipanti ASHG. I potenziali clienti sono rimasti particolarmente colpiti dal fatto che siamo in grado di gestire dimensioni del set di dati che molti altri programmi non possono gestire. In particolare per il numero di copie, abbiamo sentito le parole "soffocare" e "crash" molto quando ci si riferisce ad altri prodotti. Il fatto di utilizzare SAS per elaborare i grandi set di dati genomici è stato davvero interessante per un numero di analisti di dati di codifica SAS che si sono fermati allo stand. Apprezzavano il fatto che SAS guidi la maggior parte dei processi JMP Genomics e che i metodi analitici SAS e JMP siano così ben documentati rispetto ai programmi che adottano un approccio black-box (anche con i propri clienti).
Chiaramente, i gruppi che anticipano la trasmissione volontaria dei dati genomici (VGDS) trovano interessante poter archiviare il codice SAS utilizzato per eseguire un processo analitico di Genomics JMP. SAS è da tempo fidato delle richieste della FDA e i revisori medici utilizzano regolarmente JMP nel processo di revisione. Il team di JMP Genomics è già stato pesantemente coinvolto nel consorzio Microarray Quality Control (MAQC) guidato dalla FDA per valutare le fonti di varianza nei dati dei microarray e convalidare la tecnologia. Prevediamo che JMP Genomics sarà probabilmente utilizzato nel processo di revisione VGDS presso la FDA. Certamente inseriremo i nostri strumenti in breve tempo sui set di dati da utilizzare per l'analisi dal sottogruppo di studio sull'associazione genoma di fase II del MAQC.