私は飛行機の中でこのブログ記事を書いています。 ASHGカンファレンス （あなたのためのアメリカの人間遺伝学協会非遺伝学タイプ）。地域周辺で火事が発生し、地域内の多くの人々が被害を被ったにもかかわらず、会議は予定通りに進行しました。コンベンションセンター近くのダウンタウンでは、煙と灰のために呼吸が不快だった空気を除いて、ほとんど影響を受けませんでした。飛行機がサンディエゴに近づくと、私たちはその地域を覆っている煙と、まだ燃えているいくつかの炎をちらっと見た。
地元のASHGの参加者が強制的で自発的な避難について話し、家が失われたか、ほとんど失われたため、私たちは常に災害地帯の近くにいたことを思い出しました。一人の人が私たちに彼のメールボックスは歌われたが彼の家は免れたと報告した！残念ながら、多くはそれほど幸運ではありませんでした。私たちは彼らの家を出た後に私たちのホテルに滞在していた他のサンディエゴの住民に会いました。多くの人が小さな子供たちとペットを飼っていました。私たちの心は、この自然災害の進行中の影響に対処しているすべての人に出かけます。
フィラデルフィアのために、私は来年のASHGの会合が自然災害のどんな思い出にも欠けることを願っています。昨年のASHG会議（カトリーナの翌年にニューオリンズで開催）は、部分的に改装されたコンベンションセンターで開催され、カトリーナからの洪水の余波の間に集まりました。フレンチクォーターやニューオーリンズのコンベンションセンター近くの地域はそれほど影響を受けませんでしたが、私たちは洪水によって壊滅的な被害を受けた他の多くの地域を見ました。
周囲の悲劇にもかかわらず、会議は本当に素晴らしいものでした。Doug Robinsonと私は、JMP Genomicsチームの他の3人のメンバーと一緒になって嬉しく思い、顧客や潜在的なユーザーと話すこと、話し合いに参加すること、そしてパートナーとネットワークを作ることができました。たくさんのSAS / GeneticsとJMP Genomicsのユーザーがブースに立ち寄ってくれて本当に嬉しかったです。彼らが何をしていたのか、そして私たちのソフトウェアが彼らの分析をどのように助けてくれたのかを彼らから聞くのはとてもクールでした。
私たちが追加した新しいコピー番号の機能性に大きな関心がありました ＪＭＰゲノミクス３．１。 コピー数機能、およびバージョン3.0用に追加した全ゲノム関連機能は、ASHGの参加者との話題の中心的トピックでした。潜在的な顧客は、他の多くのプログラムでは不可能なデータセットサイズを処理できるという事実に最も感銘を受けました。特にコピー数に関しては、他の製品を参照する際に「チョーク」と「クラッシュ」という言葉をよく耳にしました。大規模なゲノミクスデータセットを処理するためにSASを実行したという事実は、ブースに立ち寄った多くのSASコーディングデータアナリストにとって非常に興味深いものでした。彼らは、SASがほとんどのJMP Genomicsプロセスを推進していること、そしてSASとJMPの分析方法がブラックボックスアプローチをとるプログラムと比較して非常によく文書化されているという事実を気に入っていました。
明らかに、自発的ゲノムデータ提出（VGDS）を予想しているグループは、JMP Genomics分析プロセスを実行するために使用されるSASコードをアーカイブすることができることが魅力的だと感じています。SASはFDAへの提出に対して長い間信頼されており、医療レビューアはレビュープロセスで定期的にJMPを使用しています。JMP Genomicsチームは、マイクロアレイデータの変動の原因を評価し、その技術を検証することを目的としたFDA主導のマイクロアレイ品質管理（MAQC）コンソーシアムにすでに深く関わっています。私たちは、JMP GenomicsがFDAのVGDSレビュープロセスで使用される可能性が高いと予想しています。MAQCのフェーズIIのゲノムワイド関連研究サブグループによる分析に使用されるデータセットに、私たちのツールをまもなく使用するようにします。
