A veces, estoy totalmente asombrado de cuánto ha avanzado nuestra ciencia desde mis días como estudiante graduado. En aquel entonces, lo más cerca que nadie se había acercado a los estudios "genómicos" de organismos eucarióticos implicaba "fundir" el ADN y verlo volver a unirse usando Cuna curvas. La clonación y la secuenciación de un solo cDNA podrían conseguirle un documento Ciencia o incluso (si era especialmente importante) Naturaleza . Como biólogo molecular de formación clásica, estaba acostumbrado a pensar en genes individuales. Realizamos transferencias Northern y las probamos con sondas de ADNc individuales. En un buen día, nuestros geles de secuenciación podrían resolver hasta 300 nucleótidos, tal vez algunos más si hiciera varias cargas. Los experimentos fueron intensivos en mano de obra y no muy cuantitativos. Si bien pudimos generar algunas imágenes muy bonitas, ciertamente no pudimos hacer estadísticas. En aquel entonces, nuestra ciencia estaba limitada por la falta de datos.
Desde ese tiempo remoto (a mitad de camino hacia el pleistoceno , como dirían mis hijos), hemos hecho un progreso increíble. Hemos secuenciado los genomas de una creciente lista de diversos organismos. Podemos evaluar cuantitativamente la expresión no solo de un gen, sino de cada gen en un organismo, todo al mismo tiempo. Podemos hacer preguntas globales que nunca hubiéramos podido formular hace unos pocos años, y podemos obtener respuestas a esas preguntas en un período de tiempo relativamente corto. De hecho, hoy tenemos el problema opuesto: ¡demasiados datos! Solíamos pasar meses o incluso años recopilando algunos puntos de datos cruciales que podían evaluarse con una simple mirada a un autorradiograma. Hoy, podemos hacer un experimento en una fracción del tiempo, pero el análisis lleva mucho más tiempo. Afortunadamente, nuestras herramientas y habilidades están evolucionando junto con nuestra ciencia.
El lanzamiento inicial de JMP Genomics en 2006 combinó las capacidades de visualización y la facilidad de uso del software JMP con el poder de SAS . Ofreció a los investigadores más de 100 procesos diferentes para importar, manipular y analizar las vastas cantidades de datos generados por las nuevas tecnologías. El reciente lanzamiento de JMP Genomics 4.0, se basa en una plataforma ya sólida de herramientas de análisis y gestión de datos. Hemos agregado funciones y mejorado el poder de todos los procesos existentes. Además, hemos añadido 16 procesos totalmente nuevos. De hecho, esta última versión contiene casi 200 procesos diferentes para importar, evaluar, normalizar, anotar y explorar datos genéticos y de micromatrices. Todos los procesos están completamente documentados y disponibles para que los utilice como están o para adaptarse a sus necesidades particulares. Puede modificar los procesos y flujos de trabajo existentes o crear nuevos y agregarlos a sus menús. Además, si necesita algo especial, háganoslo saber y trabajaremos con usted para construirlo. Como siempre, seguimos comprometidos a ayudarlo a alcanzar sus objetivos de investigación.
Hemos llegado tan lejos en tan poco tiempo. ¿Adónde irá nuestra ciencia a continuación? Usted ayudará a decidir, y JMP Genomics lo ayudará a llevarnos allí. Ya estamos trabajando duro en nuestro próximo lanzamiento. Manténganse al tanto. Lo mejor está por venir.
