Als JMP Genomics-Produktmanager freue ich mich, Ihnen mitteilen zu können, dass JMP Genomics 3.0 abgeschlossen ist und Ende Mai erscheinen soll. Ein erstaunlicher Aufwand unserer hervorragenden Entwicklungs-, Test-, Dokumentations- und Supportteams hat hervorragende neue Funktionen und Anleitungen für deren Verwendung hervorgebracht. Ich bin erstaunt über die vielen neuen Arbeiten, die seit der Veröffentlichung unseres 2.0.4-Web-Updates Ende letzten Jahres durchgeführt wurden. Mit dem Veröffentlichungsdatum von 3.0 denken wir bereits über unser nächstes Update nach. Aber lassen Sie mich zunächst etwas über die bevorstehende 3.0-Version sagen.
JMP Genomics hat sich seit seiner ersten Veröffentlichung im März 2006 sowohl hinsichtlich Funktionalität als auch Aussehen stark weiterentwickelt. Mit der neuen JMP 7-Plattform bietet JMP Genomics 3.0 wunderschöne neue 3-D-Grafiken, einschließlich der von den Benutzern geforderten 3-D-PCA-Plots (Danke, CH). Sie können eine 3-D-Grafik deutlich sichtbar auf der Titelseite des Neuen sehen Sonderausgabe der Zeitschrift sascom , die JMP enthält. Viele unserer bestehenden Prozesse wurden verbessert, um die neuen 3D-Grafiken zu verwenden. Wir haben auch einige großartig aussehende neue Icons in unserem Genomics-Menü (Danke, GM!).
JMP Genomics 3.0 adressiert eine Reihe von Benutzeranfragen mit neuen und erweiterten Funktionen. Optimierte Genetik-Tools unterstützen sehr umfangreiche Assoziationsstudien über das gesamte Genom, und wir haben neue Möglichkeiten zur Erkennung von SNP-SNP- und SNP-Merkmal-Interaktionen hinzugefügt. Mit unserem neuen Workflow Builder-Prozess können Benutzer häufig verwendete JMP Genomics-Analyseeinstellungen mit wiederverwendbaren Workflows verknüpfen. Ein neuer Schätzer-Generator ermöglicht das Erstellen von Schätzwerten mit Mausklick zur Verwendung mit unseren ANOVA- und gemischten Modellprozessen. Mit einem neuen UCSC Genome-Browser-Link-Prozess werden Link-Tabellen erstellt. Benutzer können Variablen angeben, um benutzerdefinierte Tracks für den Upload in den Browser zu erstellen, um statistische Ergebnisse anzuzeigen, die mit JMP Genomics im Genom-Kontext abgerufen wurden. Wir freuen uns sehr über die erweiterten Vorhersagemodellierungsfunktionen von JMP Genomics 3.0 und die neue Cross-Validation-Modellvergleichsplattform (CVMC) zum Vergleich der Leistung verschiedener kreuzvalidierter Vorhersagemodelle für dieselben Datensätze. Unser Entwicklungs- und Testteam hat CVMC bereits in Vorbereitung auf ihre geplanten Präsentationen auf dem 7. Treffen des MicroArray Quality Control-Konsortiums vorbereitet, einer Gruppe von 150 Wissenschaftlern aus dem ganzen Land, die sich hier vom 24. bis 25. Mai bei SAS treffen werden.
Apropos Treffen, die JMP-Benutzerkonferenz ist für den 12.-13. Juni in Cary angesetzt, mit einer JMP-Genomics-Schulung vor der Konferenz am 11. Juni. ein Genom-Track am Dienstag Nachmittag; und ein fortgeschrittener JMP-Genomics-Workshop für Mittwochnachmittag geplant. Angesichts all der Begeisterung für JMP 7 wird die Anwenderkonferenz sehr aufregend sein. Wir freuen uns darauf, einen Vertreter unseres Partners Ingenuity Systems, Entwickler von Ingenuity Pathways Analysis (IPA), zu begrüßen. Unser IPA-Upload-Prozess, der erstmals in JMP Genomics 2.0.4 vorgestellt wurde, ermöglicht Benutzern das Hochladen von Genlisten direkt von JMP Genomics in die IPA-Webanwendung für die Analyse von Pfaden und zur funktionalen Annotation. Zu den weiteren Partnerfirmen für JMP Genomics gehören jetzt sowohl Affymetrix als auch Illumina, mit denen unsere Benutzer Tools zur Erzeugung von Ausdrucks- und SNP-Daten zur Analyse erhalten.
Ich möchte mich nochmals bei unseren Benutzern für ihre Vorschläge und Unterstützung bedanken und bei den Teams von JMP und JMP Genomics, die so viele Stunden mit JMP Genomics 3.0 gearbeitet haben. Wenn Sie ein Benutzer mit Ideen oder Vorschlägen für unser nächstes Update sind, hoffen wir, dass Sie diese per E-Mail senden genomics@jmp.com . Vielen Dank!
