Como gerente de producto de JMP Genomics, me complace anunciar que JMP Genomics 3.0 se ha finalizado y está programado para ser lanzado a fines de mayo. Un increíble esfuerzo de nuestros equipos de desarrollo, pruebas, documentación y soporte estelar ha producido algunas excelentes características nuevas y orientación sobre cómo usarlas. Me sorprende la cantidad de nuevos trabajos que se han realizado desde el lanzamiento de nuestra actualización web 2.0.4 a fines del año pasado. Con la fecha de lanzamiento 3.0 a la vuelta de la esquina, ya estamos pensando en nuestra próxima actualización. Pero primero, permítanme decirles un poco acerca del lanzamiento de la versión 3.0 que se lanzará.
JMP Genomics ha avanzado mucho en funcionalidad y apariencia desde su lanzamiento inicial en marzo de 2006. Al utilizar la nueva plataforma JMP 7, JMP Genomics 3.0 ofrece hermosos gráficos 3-D, incluidos los diagramas de PCA 3-D que demandaron los usuarios (gracias, CH). Puede ver un gráfico tridimensional destacado en la portada del nuevo edición especial de la revista sascom , que cuenta con JMP. Muchos de nuestros procesos existentes se han mejorado para utilizar los nuevos gráficos en 3D. También tenemos algunos íconos nuevos y atractivos en nuestro menú de genómica (¡gracias, GM!).
JMP Genomics 3.0 atiende una serie de solicitudes de usuarios con funciones nuevas y mejoradas. Las herramientas genéticas optimizadas admiten estudios de asociación de genoma completo muy grandes, y hemos agregado nuevas capacidades de descubrimiento de interacción SNP-SNP y SNP-rasgo. Nuestro nuevo proceso de Generador de flujo de trabajo permite a los usuarios vincular conjuntos de análisis de JMP Genomics utilizados en flujos de trabajo reutilizables. Un nuevo creador de estimaciones permite la creación de apuntar y hacer clic en las declaraciones de estimaciones para su uso con nuestros procesos ANOVA y modelos mixtos. Un nuevo proceso de enlace del navegador UCSC Genome crea tablas de enlaces y permite a los usuarios especificar variables para crear pistas personalizadas para cargarlas en el navegador y mostrar los resultados estadísticos obtenidos utilizando JMP Genomics en un contexto genómico. Estamos muy entusiasmados con las capacidades mejoradas de modelado predictivo de JMP Genomics 3.0 y la nueva plataforma de comparación de modelos de validación cruzada (CVMC) para comparar el rendimiento de diferentes modelos predictivos con validación cruzada en los mismos conjuntos de datos. Nuestro equipo de desarrollo y pruebas ya le dio a CVMC un entrenamiento en preparación para sus presentaciones planeadas en la séptima reunión del consorcio de control de calidad MicroArray, un grupo de 150 científicos de todo el país que se reunirán aquí en SAS del 24 al 25 de mayo.
Hablando de reuniones, el Conferencia de usuarios JMP está programado para el 12 y 13 de junio en Cary, con una capacitación previa a la conferencia JMP Genomics el lunes 11 de junio; una pista de genómica el martes por la tarde; y un taller avanzado de JMP Genomics programado para el miércoles por la tarde. Con todo el alboroto sobre JMP 7, la conferencia de usuarios será bastante emocionante, y esperamos dar la bienvenida a un representante de nuestro socio Ingenuity Systems, desarrolladores de Ingenuity Pathways Analysis (IPA). Nuestro proceso de carga de IPA, presentado por primera vez en JMP Genomics 2.0.4, permite a los usuarios cargar listas de genes directamente desde JMP Genomics en la aplicación web de IPA para el análisis de rutas y la anotación funcional. Las empresas asociadas adicionales para JMP Genomics ahora incluyen Affymetrix e Illumina, que proporcionan a nuestros usuarios herramientas para generar expresiones y datos de SNP para analizar.
Quiero agradecer nuevamente a nuestros usuarios por sus sugerencias y apoyo, ya los equipos de JMP y JMP Genomics por trabajar tantas horas en JMP Genomics 3.0. Si es un usuario con ideas o sugerencias para nuestra próxima actualización, esperamos que las envíe por correo electrónico a genomics@jmp.com . ¡Gracias!
