Come product manager di JMP Genomics, sono lieto di annunciare che JMP Genomics 3.0 è stato finalizzato ed è previsto che venga rilasciato alla fine di maggio. Uno straordinario sforzo dei nostri team di sviluppo, test, documentazione e supporto stellari ha prodotto alcune eccellenti nuove funzionalità e indicazioni su come utilizzarle. Sono sbalordito dalla quantità di nuovo lavoro che è stato realizzato dal rilascio del nostro aggiornamento Web 2.0.4 alla fine dell'anno scorso. Con la data di uscita 3.0 dietro l'angolo, stiamo già pensando al nostro prossimo aggiornamento. Ma prima, lasciatemi dire qualcosa sulla versione 3.0 che sta per essere lanciata.
JMP Genomics ha fatto molta strada sia nella funzionalità che nell'aspetto dalla sua versione iniziale nel marzo 2006. Guidando sulla nuova piattaforma JMP 7, JMP Genomics 3.0 offre una nuova e fantastica grafica 3-D, inclusi i plot PCA 3-D richiesti dagli utenti (grazie, CH). È possibile visualizzare un grafico 3D in evidenza sulla copertina anteriore del nuovo edizione speciale della rivista sascom , che presenta JMP. Molti dei nostri processi esistenti sono stati migliorati per utilizzare la nuova grafica 3D. Abbiamo anche alcune fantastiche nuove icone nel nostro menu genomica (grazie, GM!).
JMP Genomics 3.0 risolve un numero di richieste utente con funzionalità nuove e migliorate. Gli strumenti di genetica semplificati supportano studi di associazione genomica molto ampi e abbiamo aggiunto nuove funzionalità di scoperta dell'interazione tra SNP-SNP e SNP-trait. Il nostro nuovo processo Workflow Builder consente agli utenti di collegare set di impostazioni di analisi Genomics JMP comunemente utilizzate in flussi di lavoro riutilizzabili. Un nuovo builder di stima consente la creazione point-and-click di istruzioni di stima da utilizzare con i nostri processi ANOVA e Modello misto. Un nuovo processo di collegamento del browser Genome UCSC crea tabelle di collegamento e consente agli utenti di specificare le variabili per creare tracce personalizzate da caricare nel browser per visualizzare i risultati statistici ottenuti utilizzando Genomica JMP nel contesto genomico. Siamo piuttosto entusiasti delle funzionalità di modellazione predittiva potenziate di JMP Genomics 3.0 e della nuova piattaforma di confronto del modello di convalida incrociata (CVMC) per confrontare le prestazioni di diversi modelli predittivi incrociati convalidati sugli stessi set di dati. Il nostro team di sviluppo e test ha già dato a CVMC un allenamento in preparazione per le presentazioni programmate alla 7a riunione del consorzio MicroArray Quality Control, un gruppo di 150 scienziati provenienti da tutta la nazione che si incontreranno qui a SAS dal 24 al 25 maggio.
A proposito di incontri, il Conferenza utente JMP è in programma dal 12 al 13 giugno a Cary, con alcuni corsi di pre-conferenza JMP Genomics che si terranno lunedì 11 giugno; una traccia di genomica martedì pomeriggio; e un avanzato workshop sulla genomica di JMP in programma per mercoledì pomeriggio. Con tutto il brusio su JMP 7, la conferenza utente sarà molto eccitante e non vediamo l'ora di accogliere un rappresentante del nostro partner Ingenuity Systems, sviluppatore di Ingenuity Pathways Analysis (IPA). Il nostro processo di caricamento IPA, presentato per la prima volta in JMP Genomics 2.0.4, consente agli utenti di caricare elenchi di geni direttamente da JMP Genomics nell'applicazione Web IPA per l'analisi dei percorsi e l'annotazione funzionale. Altre società partner per JMP Genomics ora includono sia Affymetrix che Illumina, che forniscono agli utenti strumenti per generare dati di espressione e SNP da analizzare.
Voglio ringraziare nuovamente i nostri utenti per i loro suggerimenti e il loro supporto e ai team JMP e JMP Genomics per aver lavorato così tante ore su JMP Genomics 3.0. Se sei un utente con idee o suggerimenti per il nostro prossimo aggiornamento, ci auguriamo che ti inviino tramite e-mail genomics@jmp.com . Grazie!
